| 中文摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 第一章 绪论 | 第10-19页 |
| 1.1 植物联合微生物组 | 第10-14页 |
| 1.1.1 植物根际微生物组 | 第10-11页 |
| 1.1.2 植物根系对微生物的富集 | 第11-12页 |
| 1.1.3 根际微生物对植物的反馈调节 | 第12-13页 |
| 1.1.4 细菌适应植物的基因特征 | 第13页 |
| 1.1.5 根际微生物-植物的信号交流 | 第13-14页 |
| 1.2 根际微生物的研究内容 | 第14-18页 |
| 1.2.1 微生物群落结构的研究方法 | 第14-15页 |
| 1.2.2 根际微生物的群落结构和系统发育研究 | 第15-16页 |
| 1.2.3 植物根际微生物组的建立以及驱动因素 | 第16-18页 |
| 1.3 本研究的目的及意义 | 第18-19页 |
| 第二章 荒漠植物根际细菌的空间分布特征及其富集模式 | 第19-67页 |
| 2.1 引言 | 第19页 |
| 2.2 材料方法 | 第19-23页 |
| 2.2.1 研究区概况 | 第19-20页 |
| 2.2.2 样品的采集 | 第20-21页 |
| 2.2.3 土壤理化性质测定 | 第21页 |
| 2.2.4 土壤样本DNA的提取 | 第21页 |
| 2.2.5 基于16srRNA基因的IlluminaMiSeq高通量测序 | 第21-22页 |
| 2.2.6 测序数据的优化与统计 | 第22页 |
| 2.2.7 生物信息学分析 | 第22-23页 |
| 2.2.8 网络分析 | 第23页 |
| 2.3 结果与分析 | 第23-59页 |
| 2.3.1 荒漠植物根际细菌的群落组成 | 第27-28页 |
| 2.3.2 荒漠植物根际细菌群落α-多样性 | 第28-32页 |
| 2.3.3 细菌群落β-多样性与发生模式 | 第32-40页 |
| 2.3.4 细菌群落与环境因子的关联 | 第40-44页 |
| 2.3.5 细菌群落的空间分布特征 | 第44-45页 |
| 2.3.6 细菌群落结构的变差分解 | 第45-46页 |
| 2.3.7 生物地理因素响应的根际细菌指示种模型 | 第46-47页 |
| 2.3.8 微生物相关性网络分析 | 第47-51页 |
| 2.3.9 基于16srDNA的功能预测 | 第51-57页 |
| 2.3.10 网络模块分别与环境和功能基因的关联 | 第57-59页 |
| 2.3.11 群落结构、功能和环境因子的SEM | 第59页 |
| 2.4 讨论 | 第59-65页 |
| 2.4.1 荒漠植物根际常驻的菌群组成 | 第59-60页 |
| 2.4.2 环境因子和生物地理因素调节细菌群落多样性 | 第60页 |
| 2.4.3 土壤理化和生物地理因素驱动的细菌群落的构建 | 第60-62页 |
| 2.4.4 地理因素和环境异质性对不同植物根际细菌富集模式的影响.. | 第62页 |
| 2.4.5 空间距离对根际细菌群落构建的影响 | 第62-63页 |
| 2.4.7 生物地理因素关联的根际细菌群落的分类和功能分布 | 第63-64页 |
| 2.4.8 细菌群落的模块化分布和关联特征 | 第64-65页 |
| 2.5 小结 | 第65-67页 |
| 第三章 两种荒漠植物根际可培养细菌组成及促生特性 | 第67-75页 |
| 3.1 引言 | 第67页 |
| 3.2 材料方法 | 第67-69页 |
| 3.2.1 样本采集 | 第67页 |
| 3.2.2 可培养细菌分离培养 | 第67-68页 |
| 3.2.3 植物促生功能测定 | 第68页 |
| 3.2.4 可培养细菌基因组DNA提取 | 第68页 |
| 3.2.5 数据分析 | 第68-69页 |
| 3.3 结果与分析 | 第69-74页 |
| 3.3.1 可培养细菌的分类学组成和分布特征 | 第69-72页 |
| 3.3.2 可培养细菌与高通量测序OTUs的比较 | 第72页 |
| 3.3.3 根际类型对可培养细菌系统发育β-多样性的影响 | 第72-73页 |
| 3.3.4 可培养细菌潜在的促生特性 | 第73-74页 |
| 3.4 讨论 | 第74页 |
| 3.5 小结 | 第74-75页 |
| 第四章 结论与展望 | 第75-77页 |
| 4.1 结论 | 第75页 |
| 4.2 展望 | 第75-77页 |
| 参考文献 | 第77-84页 |
| 在学期间的研究成果 | 第84-85页 |
| 致谢 | 第85页 |
