| 目录 | 第4-7页 |
| CONTENT | 第7-9页 |
| 摘要 | 第9-11页 |
| ABSTRACT | 第11-12页 |
| 第一章 文献综述 | 第13-29页 |
| 1.1 线粒体及其基因组结构特征 | 第13-16页 |
| 1.1.1 线粒体概况 | 第13-14页 |
| 1.1.2 线粒体基因组的大小 | 第14-15页 |
| 1.1.3 线粒体基因组的碱基组成 | 第15页 |
| 1.1.4 线粒体基因组的基因组成 | 第15页 |
| 1.1.5 线粒体基因组的非编码区 | 第15-16页 |
| 1.2 线粒体基因组遗传特征 | 第16-18页 |
| 1.2.1 线粒体基因组的遗传密码 | 第16-17页 |
| 1.2.2 线粒体基因组的遗传特征 | 第17-18页 |
| 1.3 线粒体基因组在系统演化研究的应用 | 第18-19页 |
| 1.4 系统进化树的构建方法 | 第19-23页 |
| 1.4.1 距离法(Distance Matrix Method) | 第19-21页 |
| 1.4.2 最大简约法(Maximum Parsimony) | 第21-22页 |
| 1.4.3 最大似然法(Maximum Likelihood) | 第22页 |
| 1.4.4 贝叶法(Bayesian Inference) | 第22-23页 |
| 1.5 松鼠科动物系统演化研究进展 | 第23-26页 |
| 1.6 本研究的目的和意义 | 第26-29页 |
| 第二章 材料和方法 | 第29-37页 |
| 2.1 实验材料 | 第29-30页 |
| 2.1.1 标本的采集、鉴定和保存 | 第29页 |
| 2.1.2 实验仪器 | 第29-30页 |
| 2.1.3 实验用平品和试剂 | 第30页 |
| 2.2 实验方法 | 第30-37页 |
| 2.2.1 基因组DNA提取及检测 | 第30-31页 |
| 2.2.2 PCR引物设计 | 第31-32页 |
| 2.2.3 PCR扩增及产物回收纯化 | 第32页 |
| 2.2.4 克隆和测序 | 第32-34页 |
| 2.2.5 序列校正及拼接 | 第34页 |
| 2.2.6 基因定位与注释 | 第34页 |
| 2.2.7 系统进化树的构建 | 第34-37页 |
| 第三章 系统演化关系分析结果 | 第37-47页 |
| 第四章 系统演化关系讨论 | 第47-51页 |
| 第五章 松鼠科三种松鼠线粒体全基因组结构特征分析和讨论 | 第51-81页 |
| 5.1 海南鼯鼠线粒体全基因组 | 第51-60页 |
| 5.1.1 线粒体全基因组结构特征及其碱基组成 | 第51-53页 |
| 5.1.2 蛋白质编码基因及密码子使用 | 第53-56页 |
| 5.1.3 蛋白质编码基因氨基酸组成 | 第56页 |
| 5.1.4 tRNA | 第56页 |
| 5.1.5 rRNA | 第56-57页 |
| 5.1.6 非编码区 | 第57-60页 |
| 5.2 中印飞鼠线粒体全基因组 | 第60-68页 |
| 5.2.1 线粒体全基因组结构特征及其碱基组成 | 第60-61页 |
| 5.2.2 蛋白质编码基因及密码子使用 | 第61-64页 |
| 5.2.3 蛋白质编码基因氨基酸组成 | 第64页 |
| 5.2.4 tRNA | 第64-65页 |
| 5.2.5 rRNA | 第65页 |
| 5.2.6 非编码区 | 第65-68页 |
| 5.3 红颊长吻松鼠线粒体全基因组 | 第68-76页 |
| 5.3.1 线粒体全基因组结构特征及其碱基组成 | 第68-69页 |
| 5.3.2 蛋白质编码基因及密码子使用 | 第69-72页 |
| 5.3.3 蛋白质编码基因氨基酸组成 | 第72页 |
| 5.3.4 tRNA | 第72-73页 |
| 5.3.5 rRNA | 第73页 |
| 5.3.6 非编码区 | 第73-76页 |
| 5.4 讨论 | 第76-81页 |
| 5.4.1 松鼠科六物种线粒体基因组结构特征比较 | 第76页 |
| 5.4.2 松鼠科六物种线粒体基因组蛋白质编码基因密码子比较 | 第76-78页 |
| 5.4.3 松鼠科六物种tRNA和rRNA比较比较 | 第78页 |
| 5.4.4 松鼠科六物种D-loop区比较 | 第78-81页 |
| 附录 | 第81-107页 |
| 参考文献 | 第107-115页 |
| 致谢 | 第115-117页 |
| 学位论文评阅及答辩情况表 | 第117页 |
