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禾谷镰刀菌蛋白激酶Prp4调控mRNA剪切机制研究

摘要第5-7页
ABSTRACT第7-8页
第一章 文献综述第12-33页
    1.1 前体mRNA剪切与拼接第12-23页
        1.1.1 前体mRNA剪接简介第12-13页
        1.1.2 前体mRNA的剪切过程第13-15页
        1.1.3 剪接体中的蛋白第15-18页
        1.1.4 可变剪切第18-21页
        1.1.5 mRNA剪接与人类疾病第21-23页
    1.2 禾谷镰刀菌第23-26页
        1.2.1 禾谷镰刀菌的生物学特征第23-24页
        1.2.2 禾谷镰刀菌的生活史第24-25页
        1.2.3 禾谷镰刀菌的毒素第25页
        1.2.4 禾谷镰刀菌与蛋白激酶第25-26页
    1.3 Prp4蛋白激酶研究进展第26-31页
        1.3.1 Prp4蛋白激酶的发现第26-27页
        1.3.2 Prp4蛋白激酶的底物第27-29页
        1.3.3 Prp4在mRNA剪接中的作用第29-30页
        1.3.4 禾谷镰刀菌中Prp4的研究进展第30-31页
    1.4 本研究的目的和意义第31-33页
第二章 Prp4的预测与进化分析第33-39页
    2.1 材料与方法第33页
        2.1.1 Prp4蛋白激酶的进化分析第33页
        2.1.2 Prp4的结构和功能分析第33页
        2.1.3 Prp4的表达和可变剪切分析第33页
    2.2 结果第33-37页
        2.2.1 禾谷镰刀菌Prp4的进化分析第33-34页
        2.2.2 禾谷镰刀菌Prp4的结构和功能分析第34-37页
        2.2.3 Prp4的可变剪切分析第37页
    2.3 讨论第37-39页
第三章 Prp4对前体mRNA剪切的调控第39-45页
    3.1 材料和方法第39-40页
        3.1.1 RNA的提取第39页
        3.1.2 RNA纯化第39-40页
        3.1.3 cDNA的制备第40页
        3.1.4 RNA-seq测序及数据分析第40页
        3.1.5 RT-PCR验证第40页
    3.2 实验结果第40-44页
        3.2.1 Prp4蛋白激酶影响内含子剪切效率第40-41页
        3.2.2 Prp4影响DNA重组和修复第41-42页
        3.2.3 受到Prp4蛋白激酶影响的内含子的序列特点第42-44页
    3.3 讨论第44-45页
第四章 Prp4N端区域的作用第45-55页
    4.1 材料与方法第45-51页
        4.1.1 Prp4N端区域的功能分析第45-48页
        4.1.2 免疫亲和沉淀法寻找Prp4蛋白激酶N端区域的磷酸化位点第48-51页
        4.1.3 Prp4中N端S289磷酸化位点功能分析第51页
    4.2 结果第51-53页
        4.2.1 Prp4~(△1-310)、Prp4~(S289A)和Prp4-3xFlag载体的获得第51页
        4.2.2 Prp4N端区域影响蛋白的定位和功能第51-52页
        4.2.3 Prp4的N端区域磷酸化位点的确定与分析第52-53页
    4.3 讨论第53-55页
第五章 PRP4突变体的自发抑制突变第55-70页
    5.1 材料与方法第55-59页
        5.1.1 角变子的表型分析第55-56页
        5.1.2 候选基因的测序分析第56-57页
        5.1.3 突变位点的序列分析第57页
        5.1.4 突变位点对三维结构的影响分析第57页
        5.1.5 Prp31的人工突变验证第57-59页
    5.2 结果第59-67页
        5.2.1 角变子的分类第59页
        5.2.2 角变子的表型第59-62页
        5.2.3 U4/U6-U5三联体蛋白抑制突变位点的确定第62-64页
        5.2.4 Prp31中点突变分析以及人工突变验证第64-65页
        5.2.5 Prp6中点突变分析第65页
        5.2.6 Prp8和Brr2中点突变的分析第65-67页
        5.2.7 角变子S2和S47剪切效率恢复验证第67页
    5.3 讨论第67-70页
第六章 Prp4调控Prp31的自抑制以及与三联体蛋白的互作第70-85页
    6.1 材料和方法第70-73页
        6.1.1 Prp31中突变位点进一步鉴定第70页
        6.1.2 Prp4磷酸化Prp31验证第70页
        6.1.3 Prp31的Pull-down实验。第70页
        6.1.4 酵母双杂交第70-72页
        6.1.5 免疫共沉淀(Co-IP)第72页
        6.1.6 双分子荧光(BiFC)第72页
        6.1.7 Prp31保守磷酸化位点突变分析第72-73页
    6.2 结果第73-83页
        6.2.1 Prp31中突变位点的进一步鉴定第73-74页
        6.2.2 Prp31能够被Prp4磷酸化第74-75页
        6.2.3 Prp31磷酸化位点突变分析第75-77页
        6.2.4 Prp31的C端尾巴能够对自身进行自抑制作用第77-79页
        6.2.5 Prp31 N端区域(75-225氨基酸)参与和C端尾巴的互作第79页
        6.2.6 Prp31与其他蛋白的互作第79-83页
    6.3 讨论第83-85页
第七章 总结和展望第85-87页
参考文献第87-93页
附录第93-103页
致谢第103-104页
作者简介第104页

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