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麦草畏降解菌株3-3的分离鉴定及Ndbn-20~T的多相分类研究

摘要第7-9页
ABSTRACT第9-10页
符号与缩略语说明第11-12页
前言第12-13页
第一章 文献综述第13-31页
    1 除草剂麦草畏对环境的影响及其研究进展第13-18页
        1.1 麦草畏的基本情况第13-14页
            1.1.1 麦草畏学名及结构式第13页
            1.1.2 麦草畏的理化性质第13-14页
            1.1.3 麦草畏的药害第14页
            1.1.4 麦草畏的除草机制第14页
        1.2 麦草畏的微生物降解研究第14-18页
            1.2.1 麦草畏降解菌株及代谢途径的研究第14-16页
            1.2.2 麦草畏微生物降解的脱甲基酶第16-18页
        1.3 麦草畏中间代谢产物3,6-二氯水杨酸的简介第18页
    2 微生物多相分类法概述第18-24页
        2.1 细菌分类学的发展历史第19页
        2.2 传统表型特征分类第19-20页
        2.3 细胞化学组成分类第20-22页
            2.3.1 细胞壁化学成分分析第20-21页
            2.3.2 全细胞脂肪酸分析第21页
            2.3.3 醌组分分析第21-22页
            2.3.4 极性脂成分分析第22页
            2.3.5 全细胞可溶性蛋白及核糖体蛋白电泳图谱分析第22页
        2.4 遗传学鉴定分类第22-24页
            2.4.1 基因组DNA的G+C mol%测定第22-23页
            2.4.2 原核生物16S rRNA基因序列分析第23页
            2.4.3 DNA-DNA杂交第23-24页
    3 Rhizorhabdus属的分类研究概况第24-25页
    4 本研究的目的与意义第25-26页
    参考文献第26-31页
第二章 麦草畏降解菌株3-3的分离鉴定第31-43页
    1 材料与方法第31-33页
        1.1 培养基与试剂第31页
        1.2 麦草畏降解菌的分离和鉴定第31-32页
        1.3 降解菌液的制备第32页
        1.4 麦草畏及其中间代谢产物的测定第32页
        1.5 粗酶液活性测定第32页
        1.6 脱甲基酶基因的PCR扩增第32-33页
        1.7 脱甲基酶基因的查找第33页
    2 结果与分析第33-42页
        2.1 菌株3-3的分离与鉴定第33-34页
        2.2 菌株3-3以麦草畏为碳源的生长和降解试验第34-35页
        2.3 温度对菌株3-3降解麦草畏的影响第35-36页
        2.4 pH对菌株3-3降解麦草畏的影响第36页
        2.5 接种量对菌株3-3降解麦草畏的影响第36-37页
        2.6 麦草畏起始浓度对菌株3-3降解麦草畏的影响第37页
        2.7 麦草畏中间代谢产物的鉴定第37-39页
        2.8 粗酶液中脱甲基酶活性的测定第39页
        2.9 DMO基因的PCR扩增及基因组的生物信息学分析第39-42页
    参考文献第42-43页
第三章 麦草畏降解菌株Ndbn-20~T的分类地位研究第43-83页
    1 材料与方法第43-61页
        1.1 供试菌株第43-44页
        1.2 化学试剂和培养基第44页
        1.3 实验设备第44页
        1.4 菌株Ndbn-20~T表型特征分析第44-47页
            1.4.1 菌落形态学特征第44页
            1.4.2 单细胞形态特征第44-45页
            1.4.3 革兰氏染色第45页
            1.4.4 菌株的运动性观察第45页
            1.4.5 API鉴定系统检测分析第45页
            1.4.6 其他生理生化实验分析第45-47页
        1.5 菌株Ndbn-20~T化学分类特征分析第47-49页
            1.5.1 细胞脂肪酸分析第47-48页
            1.5.2 呼吸醌组成分析第48页
            1.5.3 多胺模式分析第48-49页
            1.5.4 极性脂组成分析第49页
        1.6 菌株Ndbn-20~T基因型特征分析第49-61页
            1.6.1 菌株Ndbn-20~T的16S rDNA基因序列及系统发育关系的分析第49-53页
            1.6.2 基因组G+C mol%的测定第53-54页
            1.6.3 DNA-DNA杂交第54-61页
    2 结果与分析第61-80页
        2.1 菌株Ndbn-20~T表型特征分析第61-68页
            2.1.1 Ndbn-20~T菌落及细胞形态第61页
            2.1.2 Ndbn-20~T的API系统测定结果比较第61-65页
            2.1.3 其他生理生化分析结果第65-68页
        2.2 菌株Ndbn-20~T化学分类特征分析第68-72页
            2.2.1 菌株脂肪酸组成第68-70页
            2.2.2 菌株醌组分第70-71页
            2.2.3 菌株多胺模式分析第71页
            2.2.4 菌株极性脂组分第71-72页
        2.3 菌株Ndbn-20~T基因型特征分析第72-80页
            2.3.1 参考菌株及模式菌株总DNA的提取第72-73页
            2.3.2 16S rDNA基因序列和系统进化关系分析第73-75页
            2.3.3 菌株基因组G+C mol%含量测定第75-76页
            2.3.4 DNA-DNA杂交同源性结果第76-80页
    参考文献第80-83页
全文总结第83-85页
论文创新点第85-87页
附录一 培养基与试剂配方第87-89页
附录二 API 50CH成分第89-90页
附录三 Rhizorhabdus sp.Ndbn-20~T 16S rRNA序列第90-91页
攻读硕士学位期间发表学术论文第91-93页
致谢第93页

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