| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 第一章 海洋病毒宏基因组学研究进展 | 第11-27页 |
| 1 病毒宏基因组学概念 | 第11-14页 |
| 2 病毒宏基因组学研究现状 | 第14-22页 |
| 3 病毒宏基因组学实验方法 | 第22页 |
| 4 宏基因组测序 | 第22-23页 |
| 5 生物信息学分析 | 第23-26页 |
| 6 宏基因组学在海洋病毒生态学中的应用与前景 | 第26-27页 |
| 第二章 北黄海浮游病毒群落的宏基因组学研究 | 第27-54页 |
| 1 调查海域和站位设定 | 第30页 |
| 2 材料与方法 | 第30-36页 |
| 2.1 实验试剂与仪器 | 第31页 |
| 2.1.1 试剂 | 第31页 |
| 2.1.2 仪器 | 第31页 |
| 2.2 实验方法 | 第31-34页 |
| 2.2.1 样品的采集及处理 | 第31-32页 |
| 2.2.2 DNA的提取 | 第32页 |
| 2.2.3 高通量测序 | 第32-34页 |
| 2.3 生物信息学分析 | 第34-36页 |
| 2.3.1 组装和基因预测 | 第34-35页 |
| 2.3.2 病毒组分类组成 | 第35页 |
| 2.3.3 系统发生分析 | 第35页 |
| 2.3.4 基因功能分析 | 第35-36页 |
| 3 结果 | 第36-54页 |
| 3.1 宏基因组文库分析 | 第36页 |
| 3.2 病毒分类组成 | 第36-38页 |
| 3.3 北黄海病毒组中丰富的SAR11病毒 | 第38-39页 |
| 3.4 丰富的原绿球藻噬藻体P-SSM2 | 第39-40页 |
| 3.5 北黄海病毒群落多样性 | 第40-41页 |
| 3.6 系统发生分析 | 第41-46页 |
| 3.6.1 藻类DNA病毒的系统发生分析 | 第41-44页 |
| 3.6.2 噬病毒体的系统发生分析 | 第44-46页 |
| 3.7 基因功能分析 | 第46-47页 |
| 3.7.1 功能组成 | 第46页 |
| 3.7.2 北黄海病毒宏基因组功能多样性 | 第46-47页 |
| 3.8 病毒群落结构时空差异和与环境因子的相关性分析 | 第47-51页 |
| 3.8.1 环境因子PCA分析 | 第47-48页 |
| 3.8.2 病毒群落结构的时空差异 | 第48-49页 |
| 3.8.3 病毒群落与环境因子的相关性分析 | 第49-50页 |
| 3.8.4 生物因子和环境因子的相关性分析 | 第50-51页 |
| 3.9 病毒群落功能结构时空差异和与环境因子的相关性分析 | 第51-54页 |
| 3.9.1 病毒群落功能结构的时空差异 | 第51-52页 |
| 3.9.2 病毒群落功能结构和环境因子的相关性分析 | 第52-54页 |
| 讨论 | 第54-59页 |
| 小结 | 第59-60页 |
| 参考文献 | 第60-77页 |
| 致谢 | 第77-78页 |
| 个人简历 | 第78页 |
| 发表的学术论文 | 第78页 |
