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基于ITS+rbcL序列探讨藤黄属(Garcinia)植物的亲缘关系和分子鉴定

摘要第4-6页
ABSTRACT第6-7页
第一章 前言第17-26页
    第一节 藤黄属植物概述第17-20页
        一 藤黄属植物形态特征及地理分布第17-18页
        二 藤黄属植物的利用价值第18-19页
        三 藤黄属植物的研究现状第19-20页
        四 选题意义第20页
    第二节 民族植物学第20-21页
    第三节 植物DNA条形码的研究进展第21-26页
        一 DNA条形码第21-22页
        二 DNA条形码的发展第22-23页
        三 ITS和rbcL序列第23-24页
        四 DNA条形码的应用第24-25页
        五 DNA条形码工作流程第25页
        六 植物DNA条形码技术存在的问题与展望第25-26页
第二章 材料与方法第26-38页
    第一节 实验材料第26-31页
        一 调查地点概况第26页
        二 民族植物学考察内容第26-27页
        三 民族植物学考察方法第27页
        四 调查结果第27-31页
    第二节 实验试剂及仪器第31-33页
        一 实验试剂第31-32页
        二 实验仪器第32-33页
    第三节 实验方法第33-37页
        一 植物基因组DNA的提取第33页
        二 DNA质量检测第33-34页
        三 目的序列的扩增第34-35页
        四 PCR产物的检测第35页
        五 目的条带的测序第35页
        六 序列分析第35-36页
        七 亲缘关系与系统进化分析第36-37页
    第四节 技术路线第37-38页
第三章 结果与分析第38-59页
    第一节 植物基因组DNA提取结果第38页
    第二节 目的条带扩增结果第38-40页
        一 ITS序列扩增结果第38-39页
        二 rbcL序列扩增结果第39-40页
    第三节 测序结果分析第40-41页
    第四节 序列分析结果第41-50页
        一 序列GC含量分析结果第41-42页
        二 序列变异位点分析结果第42-43页
        三 Kimura 2-parameter(K2P)遗传距离结果与分析第43-47页
        四 “Barcoding Gap”评估结果第47-50页
    第五节 亲缘关系与系统进化分析结果第50-59页
        一 ML系统发育树分析第50-53页
        二 NJ系统发育树分析第53-55页
        三 ML树和NJ树的比较第55页
        四 DNA条形码分类与传统分类的比较第55-59页
第四章 讨论与结论第59-63页
    第一节 植物总DNA的提取第59页
    第二节 序列信息第59-60页
    第三节 亲缘关系分析第60页
    第四节 遗传多样性第60-61页
    第五节 DNA条形码和传统形态学的比较第61页
    第六节 补充NCBI不足,完善分子鉴定第61-62页
    第七节 解决的民族植物学问题第62-63页
参考文献第63-70页
附录第70-71页
致谢第71-73页
项目支持第73-74页
攻读学位期间发表的学术论文目录第74页

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