| 摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-7页 |
| 中英文缩略词表 | 第11-12页 |
| 第1章 绪论 | 第12-22页 |
| 1.1 地下鼠研究概况 | 第12-13页 |
| 1.2 甘肃鼢鼠 | 第13-15页 |
| 1.2.1 甘肃鼢鼠生态学特征 | 第13-14页 |
| 1.2.2 甘肃鼢鼠研究概况 | 第14-15页 |
| 1.3 糖代谢概述 | 第15-18页 |
| 1.3.1 糖酵解和糖异生 | 第15-16页 |
| 1.3.2 本研究中糖代谢相关基因 | 第16-18页 |
| 1.4 转录组研究概况 | 第18-19页 |
| 1.4.1 转录组测序技术 | 第18-19页 |
| 1.4.2 地下鼠的高通量测序 | 第19页 |
| 1.5 研究目的和内容 | 第19-20页 |
| 1.6 技术路线 | 第20-22页 |
| 第2章 甘肃鼢鼠肝脏转录组测序及数据分析 | 第22-36页 |
| 2.1 实验材料 | 第22-23页 |
| 2.1.1 实验动物 | 第22页 |
| 2.1.2 实验仪器和耗材 | 第22-23页 |
| 2.1.3 实验试剂 | 第23页 |
| 2.2 实验方法 | 第23-27页 |
| 2.2.1 组织中总RNA提取 | 第23-24页 |
| 2.2.2 总RNA质量检测 | 第24页 |
| 2.2.3 cDNA文库构建 | 第24-25页 |
| 2.2.4 Illumina测序、短读序拼接 | 第25页 |
| 2.2.5 转录组数据组装机文库质量评估 | 第25页 |
| 2.2.6 Unigene功能注释 | 第25-26页 |
| 2.2.7 基因结构分析 | 第26页 |
| 2.2.8 差异表达基因筛选 | 第26页 |
| 2.2.9 差异表达基因功能注释和富集分析 | 第26-27页 |
| 2.3 结果分析 | 第27-33页 |
| 2.3.1 甘肃鼢鼠肝脏总RNA提取结果 | 第27页 |
| 2.3.2 Illumina测序与拼接分析 | 第27-28页 |
| 2.3.3 Unigene功能注释 | 第28页 |
| 2.3.4 差异表达分析 | 第28-31页 |
| 2.3.5 差异表达基因功能注释和富集分析 | 第31-33页 |
| 2.3.6 甘肃鼢鼠肝脏转录组CDS预测 | 第33页 |
| 2.4 讨论 | 第33-36页 |
| 2.4.1 甘肃鼢鼠肝脏转录组测序与功能注释 | 第33-34页 |
| 2.4.2 HNF-4α、HNF-1α和GCK基因的挖掘 | 第34-36页 |
| 第3章 甘肃鼢鼠糖代谢相关基因的表达 | 第36-52页 |
| 3.1 实验材料 | 第36页 |
| 3.1.1 实验动物 | 第36页 |
| 3.1.2 实验设备及仪器 | 第36页 |
| 3.1.3 实验试剂 | 第36页 |
| 3.2 实验方法 | 第36-40页 |
| 3.2.1 组织中总RNA提取和质量鉴定 | 第37页 |
| 3.2.2 第一链cDNA合成 | 第37页 |
| 3.2.3 引物设计 | 第37-38页 |
| 3.2.4 检测模板及引物专一性 | 第38-39页 |
| 3.2.5 实时定量 | 第39-40页 |
| 3.2.6 数据分析 | 第40页 |
| 3.3 结果与分析 | 第40-48页 |
| 3.3.1 模板及引物专一性检测 | 第40-41页 |
| 3.3.2 实时定量 | 第41-45页 |
| 3.3.3 HNF-4α的mRNA表达 | 第45页 |
| 3.3.4 HNF-1α的mRNA表达 | 第45-46页 |
| 3.3.5 GCK的mRNA表达 | 第46-47页 |
| 3.3.6 HNF-4α HNF-1α和GCK代谢途径中相关基因的mRNA表达 | 第47-48页 |
| 3.4 讨论 | 第48-52页 |
| 3.4.1 HNF-4α的mRNA表达分析 | 第48页 |
| 3.4.2 HNF-1α的mRNA表达分析 | 第48-49页 |
| 3.4.3 GCK的mRNA表达分析 | 第49页 |
| 3.4.4 HNF-4α、HNF-1α和GCK代谢途径中相关基因的表达分析 | 第49-52页 |
| 第4章 甘肃鼢鼠肝脏HNF-4α、HNF-1α和GCK基因cDNA片段扩增 | 第52-66页 |
| 4.1 实验材料 | 第52-53页 |
| 4.1.1 实验动物 | 第52页 |
| 4.1.2 实验设备以及耗材 | 第52-53页 |
| 4.1.3 主要实验试剂 | 第53页 |
| 4.2 实验方法 | 第53-54页 |
| 4.2.1 总RNA提取 | 第53页 |
| 4.2.2 总RNA质量鉴定 | 第53页 |
| 4.2.3 第一链cDNA合成 | 第53页 |
| 4.2.4 引物设计 | 第53-54页 |
| 4.2.5 HNF-4α、HNF-1α和GCK基因扩增的体系和程序 | 第54页 |
| 4.2.6 琼脂糖凝胶电泳检测PCR扩增产物 | 第54页 |
| 4.3 结果与分析 | 第54-64页 |
| 4.3.1 RNA的提取 | 第54页 |
| 4.3.2 HNF-4α、HNF-1α和GCK基因cDNA片段的扩增 | 第54-61页 |
| 4.3.3 HNF-4α、HNF-1α和GCK基因的CDS预测及其氨基酸预测 | 第61-64页 |
| 4.4 讨论 | 第64-66页 |
| 第5章 总结 | 第66-68页 |
| 参考文献 | 第68-78页 |
| 致谢 | 第78页 |
