| 摘要 | 第7-10页 |
| ABSTRACT | 第10-12页 |
| 缩略语 | 第20-21页 |
| 第一章 前言 | 第21-40页 |
| 1.1 引言 | 第21页 |
| 1.2 壳囊孢属真菌引起的腐烂病综述 | 第21-25页 |
| 1.3 壳囊孢属真菌系统学位置及分类系统 | 第25-38页 |
| 1.4 研究目的和意义 | 第38-39页 |
| 1.5 技术路线 | 第39-40页 |
| 第二章 壳囊孢属真菌种类鉴定及系统发育分析 | 第40-86页 |
| 2.1 材料与方法 | 第40-54页 |
| 2.1.1 主要仪器与试剂 | 第40页 |
| 2.1.2 试验菌株来源及分离、培养 | 第40-42页 |
| 2.1.3 形态特征及培养性状观察 | 第42页 |
| 2.1.4 试验菌株真菌DNA提取 | 第42-43页 |
| 2.1.5 rDNA-ITS、EF1-a和 β-tubulin序列PCR扩增及检测 | 第43-45页 |
| 2.1.6 PCR扩增产物测序与拼接、校正 | 第45页 |
| 2.1.7 三种序列同源性比对及系统发育分析 | 第45-54页 |
| 2.2 结果与分析 | 第54-81页 |
| 2.2.1 试验菌株分布 | 第54页 |
| 2.2.2 种类鉴定结果与分析 | 第54-67页 |
| 2.2.3 测序结果统计 | 第67-68页 |
| 2.2.4 rDNA-ITS序列同源性比对及系统发育分析结果 | 第68-69页 |
| 2.2.5 EF1-a序列同源性比对及系统发育分析结果 | 第69-77页 |
| 2.2.6 β-tubulin序列同源性比对及系统发育分析结果 | 第77-81页 |
| 2.3 讨论 | 第81-85页 |
| 2.3.1 形态学 | 第81-82页 |
| 2.3.2 系统发育分析 | 第82-85页 |
| 2.4 本章小结 | 第85-86页 |
| 第三章 壳囊孢属新种Cytospora palm sp.nov.的鉴定和描述 | 第86-99页 |
| 3.1 材料与方法 | 第86-90页 |
| 3.1.1 试验菌株分离、培养及形态观察 | 第86页 |
| 3.1.2 接种试验 | 第86-87页 |
| 3.1.3 rDNA-ITS序列系统发育分析 | 第87-90页 |
| 3.2 试验结果 | 第90-96页 |
| 3.2.1 试验菌株形态鉴定 | 第90-92页 |
| 3.2.2 接种试验结果 | 第92-93页 |
| 3.2.3 rDNA-ITS序列系统发育分析结果 | 第93-96页 |
| 3.3 讨论 | 第96-98页 |
| 3.4 本章小结 | 第98-99页 |
| 第四章 ITS1次级结构信息在Cytospora近缘种系统发育研究中的应用 | 第99-122页 |
| 4.1 材料和方法 | 第101-106页 |
| 4.1.1 常规系统发育分析方法 | 第101-102页 |
| 4.1.2 ITS1区域识别以及次级结构预测和比对 | 第102-106页 |
| 4.1.3 常规序列和次级结构复合信息的系统发育分析 | 第106页 |
| 4.1.4 保守区域和可变区域的识别 | 第106页 |
| 4.2 系统发育分析结果 | 第106-116页 |
| 4.2.1 常规rDNA-ITS序列系统发育分析结果 | 第106-112页 |
| 4.2.2 ITS1序列次级结构预测结果 | 第112页 |
| 4.2.3 联合ITS1序列及其次级结构信息的系统发育分析结果 | 第112-116页 |
| 4.3 讨论 | 第116-121页 |
| 4.4 本章小结 | 第121-122页 |
| 第五章 金黄壳囊孢Cytospora chrysosperma种内遗传分化研究 | 第122-143页 |
| 5.1 材料与方法 | 第123-127页 |
| 5.1.1 试验菌株 | 第123页 |
| 5.1.2 试验菌株rDNA-ITS、EF1-a和 β-tubulin序列 | 第123页 |
| 5.1.3 rDNA-ITS、EF1-a和 β-tubulin序列进化树构建以及多基因联合分析 | 第123-126页 |
| 5.1.4 C. chrysosperma祖先地理分布区重建 | 第126-127页 |
| 5.2 系统发育分析结果 | 第127-138页 |
| 5.2.1 rDNA-ITS序列系统发育分析结果 | 第127页 |
| 5.2.2 EF1-A序列系统发育分析结果 | 第127-128页 |
| 5.2.3 β-tubulin序列系统发育分析结果 | 第128-129页 |
| 5.2.4 rDNA-ITS、EF1-a和 β-tubulin多基因联合系统发育分析结果 | 第129-135页 |
| 5.2.5 C. chrysosperma祖先分布区重建结果 | 第135-138页 |
| 5.3 讨论 | 第138-142页 |
| 5.4 本章小结 | 第142-143页 |
| 第六章 总结、展望与创新点 | 第143-147页 |
| 6.1 总结 | 第143-145页 |
| 6.2 展望 | 第145-146页 |
| 6.3 论文创新点 | 第146-147页 |
| 参考文献 | 第147-157页 |
| 在读期间发表论文 | 第157-158页 |
| 致谢 | 第158页 |
