利用启发式算法在三维方格网上预测蛋白质结构
摘要 | 第4-5页 |
abstract | 第5-6页 |
第一章 绪论 | 第12-15页 |
1.1 研究背景和研究意义 | 第12页 |
1.2 国内外研究现状 | 第12-14页 |
1.3 本文主要工作 | 第14页 |
1.4 文章结构 | 第14-15页 |
第二章 蛋白质结构预测问题及其模型 | 第15-20页 |
2.1 蛋白质结构 | 第15-16页 |
2.2 蛋白质结构预测问题 | 第16-17页 |
2.3 HP格点模型 | 第17页 |
2.4 数学模型 | 第17-20页 |
第三章 组合优化算法 | 第20-30页 |
3.1 基本粒子群算法 | 第20-22页 |
3.2 粒子群算法的改进 | 第22-25页 |
3.2.1 粒子位置 | 第22页 |
3.2.2 粒子速度 | 第22-24页 |
3.2.3 改进的粒子群算法 | 第24-25页 |
3.3 禁忌策略 | 第25-27页 |
3.3.1 禁忌搜索算法 | 第25-26页 |
3.3.2 禁忌策略 | 第26页 |
3.3.3 组合算法TPPSO1 | 第26-27页 |
3.4 拉动策略 | 第27-30页 |
3.4.1 拉动策略描述 | 第27-28页 |
3.4.2 组合算法TPPSO2 | 第28-30页 |
第四章 数值实验 | 第30-41页 |
4.1 算法验证 | 第30-35页 |
4.1.1 长度一致的氨基酸序列 | 第30-34页 |
4.1.2 长度不同的氨基酸序列 | 第34-35页 |
4.2 氨基酸突变 | 第35-41页 |
4.2.1 单点突变 | 第36-38页 |
4.2.2 双点突变 | 第38-41页 |
第五章 总结与展望 | 第41-43页 |
参考文献 | 第43-47页 |
致谢 | 第47-48页 |
攻读硕士学位期间发表(录用)论文情况 | 第48页 |