| 摘要 | 第4-5页 |
| ABSTRACT | 第5-6页 |
| 第一章 计算机辅助药物分子设计概述 | 第10-15页 |
| 1.1 新药研发现状与CADD | 第10页 |
| 1.2 CADD方法的分类 | 第10-11页 |
| 1.2.1 基于配体小分子的药物设计方法 | 第10-11页 |
| 1.2.2 基于受体结构的药物设计方法 | 第11页 |
| 1.3 计算机辅助药物分子设计成功的例子 | 第11-12页 |
| 1.3.1 磺酰脲类除草剂的设计——基于 3D-QSAR 的药物分子设计 | 第11-12页 |
| 1.3.2 碳酸酐酶的抑制剂——基于受体 Surflex 分子对接的药物设计 | 第12页 |
| 参考文献 | 第12-15页 |
| 第二章 阿片受体研究进展 | 第15-27页 |
| 2.1 阿片受体概述 | 第15-16页 |
| 2.2 阿片受体的三种亚型 | 第16-18页 |
| 2.2.1 μ阿片受体 | 第16-17页 |
| 2.2.2 δ阿片受体 | 第17页 |
| 2.2.3 κ阿片受体 | 第17页 |
| 2.2.4 阿片样受体（ORL1） | 第17-18页 |
| 2.3 阿片受体激动剂、拮抗剂和激动拮抗剂 | 第18-23页 |
| 2.4 阿片受体作用机制分析 | 第23-24页 |
| 2.5 阿片受体研究展望 | 第24-25页 |
| 参考文献 | 第25-27页 |
| 第三章 芬太尼类化合物的药效团模型 | 第27-35页 |
| 3.1 GALAHAD模块程序 | 第27-28页 |
| 3.2 μ阿片受体激动剂的药效团模型 | 第28-33页 |
| 3.2.1 小分子库的建立 | 第28-29页 |
| 3.2.2 分子构象数据库的建立 | 第29-30页 |
| 3.2.3 药效团模型的建立 | 第30页 |
| 3.2.4 药效团模型分析与讨论 | 第30-33页 |
| 参考文献 | 第33-35页 |
| 第四章 芬太尼类化合物的三维定量构效关系研究（3D-QSAR） | 第35-42页 |
| 4.1 比较分子场分析(comparative molecular field analysis,CoMFA) | 第35-36页 |
| 4.2 比较分子相似因子分子方法(comparative molecular similarity indices analysis, CoMSIA) | 第36页 |
| 4.3 u 阿片受体激动剂的 3D-QSAR 模型 | 第36-39页 |
| 4.3.1 研究背景 | 第36-37页 |
| 4.3.2 计算方法 | 第37-38页 |
| 4.3.3 结构叠合 | 第38-39页 |
| 4.4 CoMFA 模型以及测试集验证 | 第39-40页 |
| 4.5 结果分析与讨论 | 第40-41页 |
| 参考文献 | 第41-42页 |
| 第五章 μ阿片受体的三维结构模拟及活性位点预测 | 第42-50页 |
| 5.1 μ阿片受体及阿片受体功能 | 第42页 |
| 5.2 μ阿片受体的三维结构模建 | 第42-43页 |
| 5.3 基于Composer模建的步骤 | 第43-45页 |
| 5.3.1 μ阿片受体序列和模板1F88 | 第43页 |
| 5.3.2 序列比对和同源模建 | 第43-44页 |
| 5.3.3 模建μ阿片受体的能量优化 | 第44页 |
| 5.3.4 μ阿片受体的二级结构预测 | 第44页 |
| 5.3.5 μ阿片受体活性位点的确定 | 第44-45页 |
| 5.4 结果分析与讨论 | 第45-47页 |
| 5.4.1 模建的μ阿片受体三维结构的特征 | 第45页 |
| 5.4.2 模建的μ阿片受体的二级结构预测 | 第45页 |
| 5.4.3 模建μ阿片受体的Ramachandran图和平均疏水性分析 | 第45-46页 |
| 5.4.4 μ阿片受体活性位点的确定和分析 | 第46-47页 |
| 5.5 结论 | 第47-48页 |
| 参考文献 | 第48-50页 |
| 第六章 芬太尼类化合物与μ阿片受体的分子对接研究 | 第50-60页 |
| 6.1 虚拟筛选的概述 | 第50页 |
| 6.2 虚拟筛选的基本流程 | 第50-51页 |
| 6.3 分子对接 | 第51-53页 |
| 6.4 μ阿片受体与激动剂的分子对接 | 第53-56页 |
| 6.4.1 μ阿片受体的三维结构 | 第53-54页 |
| 6.4.2 小分子的处理 | 第54页 |
| 6.4.3 活性位点的确定 | 第54-55页 |
| 6.4.4 配体与μ阿片受体的分子对接 | 第55-56页 |
| 6.5 分子对接结果分析与讨论以及作用机制分析 | 第56-57页 |
| 6.6 新型激动剂的药物分子设计 | 第57-59页 |
| 6.6.1 芬太尼类化合物的结构改造 | 第57-58页 |
| 6.6.2 实验室正在合成的目标化合物 | 第58-59页 |
| 参考文献 | 第59-60页 |
| 第七章 芬太尼类反恐活性化合物数据库的研制 | 第60-70页 |
| 7.1 研究背景 | 第60页 |
| 7.2 数据库系统结构设计 | 第60-62页 |
| 7.2.1 系统架构 | 第60-61页 |
| 7.2.2 Access数据库简介 | 第61页 |
| 7.2.3 ODBC简介 | 第61-62页 |
| 7.3 反恐活性化合物数据库设计 | 第62-63页 |
| 7.4 文献的收集与整理 | 第63页 |
| 7.4.1 文献的收集 | 第63页 |
| 7.4.2 信息的录入和整理 | 第63页 |
| 7.5 反恐活性化合物数据库查询系统开发 | 第63-65页 |
| 7.5.1 反恐活性化合物数据库的安装 | 第64-65页 |
| 7.6 反恐活性化合物数据库的使用 | 第65-67页 |
| 7.6.1 查询条件设定 | 第66页 |
| 7.6.2 查询 | 第66页 |
| 7.6.3 其他功能 | 第66-67页 |
| 7.7 反恐活性化合物数据库特点 | 第67-68页 |
| 参考文献 | 第68-70页 |
| 硕士期间发表和待发表的学术论文 | 第70-71页 |
| 致谢 | 第71页 |
