基因定位方法的创新与DNA自动机硬件的研究
| 摘要 | 第4-5页 |
| ABSTRACT | 第5-6页 |
| 第一部分 基因分型方法的比较和创新 | 第12-50页 |
| 1 引言 | 第12-40页 |
| 1.1 常见的多态性标记 | 第12-17页 |
| 1.2 常用的SNP 基因分型技术 | 第17页 |
| 1.2.1 基于杂交的方法 | 第17-25页 |
| 1.2.2 引物延伸技术 | 第19-21页 |
| 1.2.3 等位基因特异性寡核苷酸连接技术 | 第21-23页 |
| 1.2.4 基于酶切的检测技术 | 第23-24页 |
| 1.2.5 根据分子构象改变检测SNP | 第24-25页 |
| 1.3 单倍型 | 第25-27页 |
| 1.3.1 连锁不平衡 | 第25-26页 |
| 1.3.2 单倍型域和单倍型 | 第26-27页 |
| 1.4 直接单倍型分型 | 第27-36页 |
| 1.4.1 体细胞杂交 | 第27-29页 |
| 1.4.2 单分子PCR | 第29-30页 |
| 1.4.3 等位基因特异性PCR | 第30-32页 |
| 1.4.4 Polymerase colony | 第32-33页 |
| 1.4.5 长片段PCR 和分子内连接 | 第33-36页 |
| 1.4.6 直接分析单个DNA 分子 | 第36页 |
| 1.4.7 单链构象多态性 | 第36页 |
| 1.5 纳米金粒子 | 第36-40页 |
| 1.5.1 纳米金的制备 | 第37-38页 |
| 1.5.2 纳米金粒子在PCR 反应中的作用 | 第38-40页 |
| 2 实验方法 | 第40-41页 |
| 3 结果 | 第41-44页 |
| 3.1 AuNP 浓度对PCR 的影响 | 第41-42页 |
| 3.2 AuNP 的粒径对ASPCR 反应的影响 | 第42-43页 |
| 3.3 纳米金对实际SNP 分型的影响 | 第43-44页 |
| 4 讨论 | 第44-50页 |
| 第二部分 顺序性状基因连锁分析的改进研究 | 第50-71页 |
| 1 引言 | 第50-61页 |
| 1.1 连锁、重组和连锁分析 | 第51-55页 |
| 1.1.1 同胞对等位基因相关性 | 第53页 |
| 1.1.2 Haseman-Elston 模型 | 第53-55页 |
| 1.2 主要的连锁分析方法 | 第55-61页 |
| 1.2.1 基于模型的连锁分析方法 | 第55-58页 |
| 1.2.2 模型自由方法 | 第58-61页 |
| 1.3 半定量性状 | 第61页 |
| 2 基于IBD 的半定量线性回归方法 | 第61-65页 |
| 2.1 排秩 | 第61-65页 |
| 3 数据模拟实验 | 第65-66页 |
| 3.1 数据模型 | 第65页 |
| 3.2 数据组成 | 第65-66页 |
| 4 结果和讨论 | 第66-70页 |
| 5 结论 | 第70-71页 |
| 第三部分 DNA 计算机硬件的研究 | 第71-99页 |
| 1 引言 | 第71-91页 |
| 1.1 DNA 计算的生物学背景知识 | 第73-77页 |
| 1.1.1 DNA 的结构 | 第73-74页 |
| 1.1.2 Watson-Crick 互补 | 第74-75页 |
| 1.1.3 工具酶和载体 | 第75-76页 |
| 1.1.4 DNA 计算常用的操作 | 第76-77页 |
| 1.2 经典的DNA 计算实验 | 第77-81页 |
| 1.2.1 Adleman 实验 | 第77-79页 |
| 1.2.2 Lipton 实验 | 第79-81页 |
| 1.3 DNA 计算发展前沿 | 第81-83页 |
| 1.3.1 自组装模型 | 第81-82页 |
| 1.3.2 加密和密码破译 | 第82-83页 |
| 1.4 DNA 自动机原理及实现 | 第83-91页 |
| 1.4.1 经典的DNA 自动机试验 | 第85-86页 |
| 1.4.2 对DNA 自动机硬件的新认识 | 第86-91页 |
| 2 材料和方法 | 第91-92页 |
| 2.1 实验组分的准备 | 第91-92页 |
| 2.2 梯度实验 | 第92页 |
| 3 结果和讨论 | 第92-99页 |
| 3.1 实验结果 | 第92-96页 |
| 3.2 DNA 计算的优点及目前存在的问题 | 第96-99页 |
| 3.2.1 DNA 计算的优点 | 第96-97页 |
| 3.2.2 DNA 计算目前存在的问题 | 第97-99页 |
| 总结与展望 | 第99-101页 |
| 参考文献 | 第101-107页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文 | 第107页 |
