摘要 | 第5-6页 |
Abstract | 第6-7页 |
第一章 绪论 | 第10-16页 |
1.1 引言 | 第10-14页 |
1.1.1 宏基因组学 | 第10-11页 |
1.1.2 宏基因组学测序方法 | 第11-13页 |
1.1.3 宏基因组用于个体识别研究 | 第13-14页 |
1.2 论文主要创新点 | 第14-15页 |
1.3 论文组织结构 | 第15-16页 |
第二章 基于宏基因组编码的个体识别 | 第16-26页 |
2.1 人体微生物群落的稳定性 | 第16-17页 |
2.2 宏基因组编码的量化指标 | 第17-18页 |
2.3 宏基因组样本属性与检测阈值 | 第18-19页 |
2.4 宏基因组编码步骤 | 第19-20页 |
2.5 极小碰集在宏基因组编码中的应用 | 第20-21页 |
2.6 计算极小碰集的方法 | 第21-25页 |
2.6.1 贪心算法 | 第21页 |
2.6.2 遗传算法 | 第21-25页 |
2.7 本章小结 | 第25-26页 |
第三章 基于遗传算法与生物特征的宏基因组编码算法 | 第26-35页 |
3.1 基于遗传算法求解全部极小碰集的宏基因组编码 | 第26-28页 |
3.2 基于稀有度的宏基因组编码 | 第28-31页 |
3.3 基于丰度差的宏基因组编码 | 第31-34页 |
3.4 本章小结 | 第34-35页 |
第四章 基于微生物丰度值的个体特征识别研究 | 第35-43页 |
4.1 样本内微生物特征丰度值选取原理 | 第35页 |
4.2 基于丰度值的宏基因组编码算法 | 第35-37页 |
4.2.1 微生物特征的丰度值编码策略 | 第35-36页 |
4.2.2 基于丰度值的宏基因组编码算法步骤 | 第36-37页 |
4.3 实验结果分析与讨论 | 第37-42页 |
4.3.1 数据集与实验平台 | 第37-38页 |
4.3.2 个体识别结果分析 | 第38-41页 |
4.3.3 宏基因组编码长度分析 | 第41-42页 |
4.4 本章小结 | 第42-43页 |
第五章 基于联合微生物特征的个体特征识别研究 | 第43-51页 |
5.1 联合生物特征选择原理 | 第43页 |
5.2 算法思想及流程 | 第43-44页 |
5.3 启发式参数优化方法进行特征选择 | 第44-46页 |
5.4 实验结果与分析 | 第46-49页 |
5.5 本章小结 | 第49-51页 |
第六章 总结与展望 | 第51-53页 |
6.1 全文总结 | 第51页 |
6.2 展望 | 第51-53页 |
参考文献 | 第53-58页 |
致谢 | 第58页 |