| 摘要 | 第5-7页 |
| ABSTRACT | 第7-9页 |
| 第一章 文献综述 | 第14-23页 |
| 1.1 引言 | 第14页 |
| 1.2 葡萄病害和抗病机制研究 | 第14-18页 |
| 1.2.1 葡萄黑痘病 | 第14-15页 |
| 1.2.2 葡萄白粉病 | 第15页 |
| 1.2.3 葡萄抗病机制研究 | 第15-18页 |
| 1.3 抗病相关转录因子 | 第18-20页 |
| 1.3.1 JAZ转录因子 | 第18-19页 |
| 1.3.2 bHLH转录因子 | 第19-20页 |
| 1.4 转录组测序技术在葡萄中的应用 | 第20-22页 |
| 1.5 本研究的立题依据、目的意义和研究内容 | 第22-23页 |
| 第二章 葡萄抗病相关基因的表达分析 | 第23-42页 |
| 2.1 材料 | 第23-25页 |
| 2.1.1 葡萄材料 | 第23页 |
| 2.1.2 EST序列 | 第23页 |
| 2.1.3 主要仪器设备 | 第23页 |
| 2.1.4 主要试剂 | 第23-24页 |
| 2.1.5 引物 | 第24-25页 |
| 2.2 方法 | 第25-26页 |
| 2.2.1 材料处理 | 第25-26页 |
| 2.2.2 葡萄RNA提取纯化及反转录反应 | 第26页 |
| 2.2.3 实时定量RT-PCR | 第26页 |
| 2.3 结果与分析 | 第26-39页 |
| 2.3.1 中国野生毛葡萄商-24株系抗病相关EST序列分析及功能分类 | 第26-28页 |
| 2.3.2 中国野生毛葡萄商-24株系抗黑痘病相关基因 | 第28-29页 |
| 2.3.3 中国野生毛葡萄商-24株系抗白粉病相关基因 | 第29页 |
| 2.3.4 葡萄抗黑痘病相关基因表达分析 | 第29-36页 |
| 2.3.5 葡萄抗白粉病相关基因表达分析 | 第36-39页 |
| 2.4 讨论 | 第39-42页 |
| 2.4.1 葡萄抗病相关基因分析 | 第39-40页 |
| 2.4.2 代谢相关基因 | 第40页 |
| 2.4.3 防御相关基因 | 第40-41页 |
| 2.4.4 泛素/26S蛋白酶体途径相关基因 | 第41-42页 |
| 第三章 抗病和感病葡萄抗黑痘病的转录组分析 | 第42-70页 |
| 3.1 材料 | 第42页 |
| 3.1.1 葡萄材料 | 第42页 |
| 3.1.2 主要仪器设备 | 第42页 |
| 3.1.3 主要试剂 | 第42页 |
| 3.2 方法 | 第42-44页 |
| 3.2.1 葡萄黑痘病接种 | 第42页 |
| 3.2.2 葡萄RNA的提取纯化 | 第42-43页 |
| 3.2.3 转录组文库构建及测序 | 第43页 |
| 3.2.4 差异表达基因的鉴定 | 第43页 |
| 3.2.5 差异表达基因的GO生物功能和Pathway富集性分析 | 第43页 |
| 3.2.6 转录组数据分析 | 第43-44页 |
| 3.3 结果与分析 | 第44-67页 |
| 3.3.1 接种黑痘菌后不同抗性葡萄转录组测序结果统计 | 第44-45页 |
| 3.3.2 不同接种时间抗病毛葡萄商-24株系和感病葡萄红地球的差异基因分析 | 第45-56页 |
| 3.3.3 相同接种时间抗病毛葡萄商-24株系与感病葡萄红地球的差异基因分析 | 第56-63页 |
| 3.3.4 抗病毛葡萄商-24株系和感病葡萄红地球差异基因表达模式的聚类分析 | 第63-67页 |
| 3.4 讨论 | 第67-70页 |
| 3.4.1 不同接种时间抗病毛葡萄商-24株系和感病葡萄红地球的差异基因分析 | 第67-68页 |
| 3.4.2 相同接种时间抗病毛葡萄商-24株系与感病葡萄红地球的差异基因分析 | 第68页 |
| 3.4.3 抗病毛葡萄商-24株系和感病葡萄红地球共表达差异基因分析 | 第68-70页 |
| 第四章 葡萄JAZ基因家族的表达分析及克隆 | 第70-85页 |
| 4.1 材料 | 第70-72页 |
| 4.1.1 葡萄材料 | 第70页 |
| 4.1.2 主要仪器设备 | 第70页 |
| 4.1.3 主要试剂 | 第70页 |
| 4.1.4 载体与菌株 | 第70-71页 |
| 4.1.5 引物 | 第71-72页 |
| 4.2 方法 | 第72-73页 |
| 4.2.1 材料处理 | 第72页 |
| 4.2.2 葡萄RNA提取纯化及反转录反应 | 第72页 |
| 4.2.3 半定量RT-PCR | 第72-73页 |
| 4.2.4 实时定量RT-PCR | 第73页 |
| 4.2.5 葡萄JAZ基因的克隆 | 第73页 |
| 4.3 结果与分析 | 第73-82页 |
| 4.3.1 葡萄JAZ基因在不同组织中的表达分析 | 第73-74页 |
| 4.3.2 葡萄JAZ基因在不同外源激素处理下的表达分析 | 第74-75页 |
| 4.3.3 葡萄JAZ基因在高盐（NaCl）和干旱胁迫下的表达分析 | 第75-76页 |
| 4.3.4 葡萄JAZ基因在病原菌侵染后的表达分析 | 第76-77页 |
| 4.3.5 葡萄JAZ基因的qRT-PCR分析 | 第77-78页 |
| 4.3.6 葡萄JAZ抗逆抗病相关基因的克隆与分析 | 第78-82页 |
| 4.4 讨论 | 第82-85页 |
| 第五章 葡萄bHLH转录因子家族的鉴定及表达分析 | 第85-113页 |
| 5.1 材料 | 第85-87页 |
| 5.1.1 葡萄材料 | 第85页 |
| 5.1.2 主要仪器设备 | 第85页 |
| 5.1.3 主要试剂 | 第85页 |
| 5.1.4 引物 | 第85-87页 |
| 5.2 方法 | 第87-88页 |
| 5.2.1 葡萄bHLH转录因子家族的鉴定 | 第87页 |
| 5.2.2 葡萄bHLH转录因子家族的序列比对及进化树分析 | 第87-88页 |
| 5.2.3 葡萄bHLH转录因子的蛋白基序分析 | 第88页 |
| 5.2.4 葡萄bHLH转录因子的外显子/内含子结构分析 | 第88页 |
| 5.2.5 葡萄bHLH转录因子的同线性分析 | 第88页 |
| 5.2.6 葡萄材料处理 | 第88页 |
| 5.2.7 葡萄RNA提取纯化及反转录反应 | 第88页 |
| 5.2.8 葡萄bHLH转录因子的实时定量表达分析 | 第88页 |
| 5.3 结果与分析 | 第88-110页 |
| 5.3.1 葡萄bHLH转录因子家族的鉴定 | 第88-97页 |
| 5.3.2 葡萄、拟南芥与水稻bHLH基因家族的进化树分析 | 第97-99页 |
| 5.3.3 葡萄bHLH转录因子家族的序列比对及进化树分析 | 第99-101页 |
| 5.3.4 葡萄bHLH转录因子家族的染色体定位和基因复制 | 第101-103页 |
| 5.3.5 葡萄和拟南芥bHLH转录因子家族的同线性分析 | 第103-104页 |
| 5.3.6 葡萄bHLH转录因子在不同组织中的表达分析 | 第104-107页 |
| 5.3.7 葡萄bHLH转录因子在外源ABA和MeJA激素处理下的表达分析 | 第107页 |
| 5.3.8 葡萄bHLH转录因子在高盐（NaCl）和干旱胁迫下的表达分析 | 第107-110页 |
| 5.3.9 葡萄bHLH转录因子在病原菌侵染后的表达分析 | 第110页 |
| 5.4 讨论 | 第110-113页 |
| 5.4.1 葡萄bHLH转录因子家族的鉴定 | 第110页 |
| 5.4.2 葡萄bHLH转录因子家族的进化与扩增 | 第110-111页 |
| 5.4.3 葡萄bHLH转录因子在多种生物过程中的功能 | 第111-113页 |
| 第六章 结论 | 第113-114页 |
| 参考文献 | 第114-126页 |
| 附录 | 第126-150页 |
| 缩略词 | 第150-151页 |
| 致谢 | 第151-152页 |
| 作者简介 | 第152-153页 |
