| 摘要 | 第3-4页 |
| Abstract | 第4页 |
| 缩略词表 | 第8-9页 |
| 第一章 文献综述 | 第9-36页 |
| 1.1 PcG复合体 | 第9-20页 |
| 1.1.1 PRC2复合体 | 第9-14页 |
| 1.1.2 PRC1复合体 | 第14-18页 |
| 1.1.3 Pho-RC复合体 | 第18页 |
| 1.1.4 PR-DUB复合体 | 第18-20页 |
| 1.2 PRC2和PRC1之间的招募关系 | 第20-22页 |
| 1.3 PcG复合体的招募机制 | 第22-25页 |
| 1.3.1 转录因子/DNA结合蛋白招募PcG复合体 | 第22-23页 |
| 1.3.2 染色质修饰招募PcG复合体 | 第23页 |
| 1.3.3 noncoding RNA招募PcG复合体 | 第23-24页 |
| 1.3.4 CG island招募PcG复合体 | 第24-25页 |
| 1.3.5 染色质状态招募PcG复合体 | 第25页 |
| 1.4 表观遗传修饰的传递 | 第25-26页 |
| 1.5 PRC2和基因印记 | 第26-34页 |
| 1.5.1 autonomous development与印记基因 | 第26-31页 |
| 1.5.2 autonomous endosperm现象的深层原因 | 第31-32页 |
| 1.5.3 prc2导致的autonomous endosperm在植物中的保守性分析 | 第32-34页 |
| 1.6 prc2造成的发育缺陷可以被越过 | 第34-35页 |
| 1.7 PRC2和DNA甲基化 | 第35-36页 |
| 第二章 实验材料与方法 | 第36-60页 |
| 2.1 实验用到的仪器 | 第36页 |
| 2.2 试剂配制 | 第36-40页 |
| 2.3 实验方法 | 第40-60页 |
| 2.3.1 TRIzol提取总RNA | 第40-41页 |
| 2.3.2 反转录,cDNA第一链合成 | 第41-42页 |
| 2.3.3 RNA-seq文库构建 | 第42-46页 |
| 2.3.4 ChIP(染色质免疫沉淀) | 第46-49页 |
| 2.3.5 ChIP-seq文库构建 | 第49-52页 |
| 2.3.6 玉米全基因组DNA提取 | 第52-53页 |
| 2.3.7 蛋白提取 | 第53页 |
| 2.3.8 Blue-native PAGE(温和胶) | 第53页 |
| 2.3.9 质粒提取 | 第53-54页 |
| 2.3.10 从琼脂糖凝胶中回收DNA片段 | 第54页 |
| 2.3.11 从PCR产物中回收DNA | 第54-55页 |
| 2.3.12 连接、转化 | 第55-56页 |
| 2.3.13 转染级质粒提取 | 第56页 |
| 2.3.14 酵母双杂交 | 第56-57页 |
| 2.3.15 SDS-PAGE凝胶制备 | 第57-58页 |
| 2.3.16 Western Blot | 第58页 |
| 2.3.17 玉米原生质体制备 | 第58-60页 |
| 第三章 实验结果与分析 | 第60-116页 |
| 3.1. 利用CRISPR-Cas9技术体系获得玉米多梳蛋白基因MEZ1突变体 | 第60-64页 |
| 3.1.1 玉米CRISPR-Cas9体系的建立及实验流程 | 第60页 |
| 3.1.2 MEZ1基因CRISPR-Cas9敲除载体的设计构建与原生质体转化的验证 | 第60-63页 |
| 3.1.3 转基因T_0代阳性植株的基因型与表型分析 | 第63-64页 |
| 3.2 MEZ1的进化及表型分析 | 第64-72页 |
| 3.2.1 MEZ1蛋白的系统进化分析 | 第64-65页 |
| 3.2.2 MEZ1在籽粒中的表达模式 | 第65-66页 |
| 3.2.3 MEZ1在胚乳发育过程中是全程印记的基因 | 第66-67页 |
| 3.2.4 mez1/MEZ1 ×MEZ1/MEZ1的表型分析 | 第67页 |
| 3.2.5 mez1/MEZ1籽粒中胚的发育滞后 | 第67-68页 |
| 3.2.6 mez1/MEZ1早期的发育滞后可在后期得到恢复 | 第68-69页 |
| 3.2.7 mez1/MEZ1不影响营养生长 | 第69页 |
| 3.2.8 mez1/MEZ1自交的后代表型 | 第69-72页 |
| 3.3 MEZ1的生化功能研究 | 第72-75页 |
| 3.3.1 MEZ1影响H3K27me3的水平 | 第72-73页 |
| 3.3.2 MEZ1处在一个大的蛋白复合体中 | 第73页 |
| 3.3.3 MEZ1与DNA甲基转移酶互作 | 第73-75页 |
| 3.4 转录组数据分析 | 第75-103页 |
| 3.4.1 差异表达基因的GO注释 | 第75-87页 |
| 3.4.2 印记基因的表达变化分析 | 第87-99页 |
| 3.4.3 籽粒亚区特异表达基因的变化 | 第99-102页 |
| 3.4.4 淀粉合成相关基因的变化 | 第102-103页 |
| 3.5 MEZ1-PRC2的靶基因分析 | 第103-107页 |
| 3.5.1 MEZ1-PRC2的靶基因的表达分析 | 第103-104页 |
| 3.5.2 MEZ1-PRC2靶基因的GO分析 | 第104-105页 |
| 3.5.3 转录因子基因在PRC2靶基因中富集 | 第105-107页 |
| 3.5.4 MEZ1-PRC2与氮代谢相关基因 | 第107页 |
| 3.5.5 MEZ1-PRC2与MADS基因 | 第107页 |
| 3.6 MEZ1和DNA甲基化的关系 | 第107-116页 |
| 3.6.1 DMR分析 | 第108-109页 |
| 3.6.2 基因区DNA甲基化分析 | 第109-110页 |
| 3.6.3 转录因子基因的DNA甲基化分析 | 第110-111页 |
| 3.6.4 印记基因和DNA甲基化 | 第111-112页 |
| 3.6.5 TE上DNA甲基化分析 | 第112-113页 |
| 3.6.6 TE长度和DNA甲基化的关系 | 第113-114页 |
| 3.6.7 TE边界的甲基化 | 第114-115页 |
| 3.6.8 TE家族与DNA甲基化的关系 | 第115-116页 |
| 第四章 讨论与结论 | 第116-123页 |
| 4.1 讨论 | 第116-122页 |
| 4.1.1 MEZ1与自我调控 | 第116页 |
| 4.1.2 MEZ1影响特定基因的表达 | 第116-117页 |
| 4.1.3 MEZ1-PRC2的靶基因 | 第117页 |
| 4.1.4 MEZ1和基因区DNA甲基化 | 第117-118页 |
| 4.1.5 MEZ1和异染色质区TE甲基化 | 第118-120页 |
| 4.1.6 MEZ1与MEZ2、 MEZ3的关系 | 第120-122页 |
| 4.2 结论 | 第122-123页 |
| 参考文献 | 第123-138页 |
| 致谢 | 第138-139页 |
| 作者简历 | 第139页 |
