| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 第一章 绪论 | 第10-20页 |
| 1.1 红鳍东方鲀 | 第10页 |
| 1.2 鱼类的性别决定与分化 | 第10-17页 |
| 1.2.1 遗传决定模式 | 第11-12页 |
| 1.2.2 环境决定模式 | 第12页 |
| 1.2.3 性别决定及分化的分子机制 | 第12-17页 |
| 1.3 鱼类转录组学研究概述 | 第17-18页 |
| 1.3.1 转录组与测序技术 | 第17页 |
| 1.3.2 RNA测序技术在鱼类中的研究进展 | 第17-18页 |
| 1.4 实验的目的和意义 | 第18-20页 |
| 第二章 红鳍东方鲀amh和amhrII的表达研究 | 第20-38页 |
| 2.1 实验材料与仪器 | 第20-21页 |
| 2.1.1 实验用鱼 | 第20页 |
| 2.1.2 实验试剂 | 第20页 |
| 2.1.3 主要试剂配制 | 第20-21页 |
| 2.1.4 主要仪器设备 | 第21页 |
| 2.2 实验方法 | 第21-27页 |
| 2.2.1 雌雄性别鉴定及引物设计 | 第21-22页 |
| 2.2.1.1 性别鉴定 | 第21-22页 |
| 2.2.1.2 引物设计 | 第22页 |
| 2.2.2 幼鱼基因组提取 | 第22页 |
| 2.2.3 琼脂糖凝胶电泳检测 | 第22-23页 |
| 2.2.4 红鳍东方鲀不同组织总RNA的提取与cDNA第一链的合成 | 第23-24页 |
| 2.2.4.1 总RNA的提取 | 第23页 |
| 2.2.4.2 cDNA第一链的合成 | 第23-24页 |
| 2.2.5 PCR扩增反应 | 第24页 |
| 2.2.6 DNA切胶回收 | 第24-25页 |
| 2.2.7 DNA目的片段的连接、转化 | 第25页 |
| 2.2.8 质粒提取 | 第25-26页 |
| 2.2.9 实时荧光定量PCR | 第26-27页 |
| 2.2.9.1 反应过程 | 第26页 |
| 2.2.9.2 标准曲线的制备 | 第26页 |
| 2.2.9.3 相对表达荧光定量PCR | 第26-27页 |
| 2.2.9.4 数据处理 | 第27页 |
| 2.3 实验结果 | 第27-35页 |
| 2.3.1 红鳍东方鲀幼鱼性别鉴定 | 第27-28页 |
| 2.3.2 各组织总RNA提取及目的基因片段克隆 | 第28-29页 |
| 2.3.3 qRT-PCR实验体系优化 | 第29-30页 |
| 2.3.3.1 引物特异性 | 第29页 |
| 2.3.3.2 标准曲线 | 第29-30页 |
| 2.3.4 amh和amhrII的组织表达 | 第30-32页 |
| 2.3.4.1 amh的组织表达情况 | 第30-31页 |
| 2.3.4.2 amhrII的组织表达情况 | 第31-32页 |
| 2.3.5 amh和amhrII不同发育时期的表达 | 第32-33页 |
| 2.3.5.1 amh基因不同发育时期的表达 | 第32-33页 |
| 2.3.5.2 amhrII基因不同发育时期的表达 | 第33页 |
| 2.3.6 AMH信号通路分析 | 第33-35页 |
| 2.4 讨论 | 第35-38页 |
| 2.4.1 amh基因的组织表达 | 第35页 |
| 2.4.2 amh基因不同时期的表达 | 第35-36页 |
| 2.4.3 amhrII基因的组织表达 | 第36-37页 |
| 2.4.4 amhrII基因不同发育时期的表达 | 第37-38页 |
| 第三章 基于RNA-seq技术的红鳍东方鲀性腺转录组的初步研究 | 第38-56页 |
| 3.1 实验材料 | 第38页 |
| 3.2 实验方法 | 第38-41页 |
| 3.2.1 红鳍东方鲀精巢和卵巢总RNA提取 | 第38页 |
| 3.2.2 总RNA的质量检测 | 第38页 |
| 3.2.3 转录组文库构建 | 第38-39页 |
| 3.2.4 转录组文库上机测序 | 第39页 |
| 3.2.5 测序数据组装 | 第39页 |
| 3.2.6 生物信息学分析 | 第39-41页 |
| 3.3 实验结果 | 第41-52页 |
| 3.3.1 总RNA的质量检测 | 第41页 |
| 3.3.2 红鳍东方鲀精巢和卵巢的转录组生物信息分析 | 第41-52页 |
| 3.3.2.1 数据整理、过滤和质量评估 | 第41-42页 |
| 3.3.2.2 转录组序列分析 | 第42-49页 |
| 3.3.2.3 表达差异基因分析 | 第49-52页 |
| 3.4 讨论 | 第52-56页 |
| 3.4.1 转录组数据分析 | 第52-53页 |
| 3.4.2 差异表达基因的研究 | 第53-56页 |
| 3.4.2.1 刺鼠相关蛋白基因 1（agrp1） | 第53-54页 |
| 3.4.2.2 生长抑素受体基因 2（sstr2） | 第54页 |
| 3.4.2.3 叉头框基因N4（foxn4） | 第54页 |
| 3.4.2.4 生长分化因子 3（gdf3）和生长分化因子 15（gdf15） | 第54-56页 |
| 结论 | 第56-57页 |
| 参考文献 | 第57-65页 |
| 攻读硕士学位期间发表的学术论文 | 第65-66页 |
| 致谢 | 第66-68页 |
