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玉米类黄酮代谢途径候选基因挖掘与功能分析

摘要第7-9页
Abstract第9-10页
缩略语表第11-12页
1 文献综述第12-27页
    1.1 类黄酮研究进展第12-19页
        1.1.1 生物类黄酮的结构、分类以及在植物界的分布第12-13页
        1.1.2 生物类黄酮功能的研究及进展第13-16页
            1.1.2.1 类黄酮对植物自身生长发育作用的研究第13-15页
            1.1.2.2 类黄酮生物活性与人类健康第15-16页
        1.1.3 类黄酮的代谢途径以及玉米中相关基因研究进展第16-19页
            1.1.3.1 类黄酮代谢途径第16-17页
            1.1.3.2 代谢途径中的基因研究第17-19页
    1.2 数量性状位点(QTLS)定位第19-21页
        1.2.1 QTL作图的原理和分析步骤第19-20页
        1.2.2 数量性状位点(QTLs)克隆进展第20-21页
    1.3 关联分析第21-26页
        1.3.1 连锁不平衡(LD)第22页
        1.3.2 影响连锁不平衡的因素第22-23页
        1.3.3 关联分析步骤第23-25页
        1.3.4 玉米关联分析研究进展第25页
        1.3.5 关联分析和连锁分析比较第25-26页
    1.4 本研究的意义第26-27页
2 材料与方法第27-39页
    2.1 用于关联分析和连锁分析的群体材料第27页
    2.2 田间实验和表型调查第27页
    2.3 表型鉴定第27-28页
    2.4 基因型的获得第28页
    2.5 表型数据分析第28-29页
        2.5.1 表型数据的基本统计分析第28-29页
        2.5.2 遗传力分析第29页
        2.5.3 不同表型间的相关性分析第29页
    2.6 连锁分析第29页
    2.7 关联分析第29页
    2.8 表达量相关性分析第29-30页
    2.9 候选基因确定第30页
    2.10 利用转基因实验验证基因功能第30-39页
        2.10.1 材料和试剂第30-32页
            2.10.1.1 受体材料第30页
            2.10.1.2 菌株和载体第30-31页
            2.10.1.3 实验试剂第31-32页
        2.10.2 实验方法第32-39页
            2.10.2.1 试剂盒提取玉米B73 叶片总RNA第32-33页
            2.10.2.2 琼脂糖凝胶电泳检测总RNA质量第33页
            2.10.2.3 RT-PCR第33页
            2.10.2.4 CTAB小样法提取玉米基因组DNA第33-34页
            2.10.2.5 克隆目的基因的引物设计第34页
            2.10.2.6 PCR的条件第34页
            2.10.2.7 中间载体的构建第34页
            2.10.2.8 大肠杆菌的遗传转化第34-35页
            2.10.2.9 农杆菌的遗传转化第35页
            2.10.2.10 菌落PCR、质粒提取和测序第35-36页
            2.10.2.11 质粒的小量提取第36-37页
            2.10.2.12 农杆菌介导的水稻愈伤组织转基因第37-38页
            2.10.2.13 PCR法鉴定转基因水稻阳性植株第38-39页
3 结果与分析第39-99页
    3.1 表型数据分析第39-54页
        3.1.1 表型性状的确定第39-41页
        3.1.2 表型性状的分类第41-42页
        3.1.3 表型数据的描述统计分析第42-51页
        3.1.4 表型之间的相关性分析第51-52页
        3.1.5 遗传力分析第52-54页
    3.2 QTL定位第54-75页
    3.3 全基因组关联分析第75-85页
    3.4 关联分析和连锁分析结果进行整合第85-89页
    3.5 共表达分析第89-94页
    3.6 候选基因EQTL第94页
    3.7 基因功能验证第94-99页
        3.7.1 基因详情第95-96页
        3.7.2 超表达载体的构建第96页
        3.7.3 表达载体遗传转化水稻第96-97页
        3.7.4 阳性植株的PCR鉴定第97-99页
4 讨论第99-102页
    4.1 类黄酮在植物体内含量变异显著第99页
    4.2 全基因组关联分析结果第99-100页
    4.3 候选基因的确定第100-102页
参考文献第102-108页
附录第108-109页
    引物序列第108-109页
致谢第109页

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