摘要 | 第6-7页 |
Abstract | 第7页 |
中英文对照表 | 第11-13页 |
第一章 引言 | 第13-26页 |
1.1 本研究要解决的问题及研究的意义 | 第13页 |
1.2 miRN A简介 | 第13-14页 |
1.3 脂肪沉积是脂肪细胞分化和脂代谢的结果 | 第14-15页 |
1.4 miRN A调控脂肪细胞分化的机制 | 第15-20页 |
1.4.1 miR1792簇 | 第15-16页 |
1.4.2 miR-21 | 第16-17页 |
1.4.3 miR-130 | 第17页 |
1.4.4 miR-143 | 第17页 |
1.4.5 miR-146b | 第17-18页 |
1.4.6 miR-363 | 第18页 |
1.4.7 其他调控脂肪细胞分化的miRNAs | 第18-20页 |
1.5 miRN A调控脂代谢的机制 | 第20-22页 |
1.5.1 miR-33 | 第21页 |
1.5.2 miR-122 | 第21页 |
1.5.3 miR-758 | 第21-22页 |
1.6 脂肪组织中的miRNA受到多种因素调控 | 第22页 |
1.7 Illumina测序技术 | 第22-23页 |
1.7.1 Illumina测序技术原理 | 第22-23页 |
1.7.2 Illumina测序技术优势及应用 | 第23页 |
1.8 smallRNA-seq数据的分析方法 | 第23-26页 |
1.8.1 数据预处理和质控 | 第24页 |
1.8.2 从基因组比对到差异表达 | 第24页 |
1.8.3 靶基因预测 | 第24页 |
1.8.4 靶基因的GO和Pathway富集分析 | 第24-26页 |
第二章 两品种牛脂肪组织miRNA的鉴定 | 第26-49页 |
2.1 材料与方法 | 第26-31页 |
2.1.1 材料 | 第26-27页 |
2.1.2 实验方法 | 第27-31页 |
2.2 结果 | 第31-45页 |
2.2.1 脂肪组织总RNA提取和纯化 | 第31-32页 |
2.2.2 测序数据的生物信息学分析 | 第32-44页 |
2.2.3 qRT-PCR验证 | 第44-45页 |
2.3 讨论 | 第45-49页 |
第三章 Bta-miR-320a的靶基因预测及生物信息学分析 | 第49-59页 |
3.1 材料与方法 | 第49-50页 |
3.1.1 TFBS预测 | 第49页 |
3.1.2 保守性分析 | 第49页 |
3.1.3 Bta- miR-320a的靶基因预测和后续分析靶基因的获得 | 第49-50页 |
3.1.4 靶基因的GO富集分析 | 第50页 |
3.1.5 靶基因的KEGG Pathway富集分析 | 第50页 |
3.1.6 TF-miRNA-靶基因作用网络 | 第50页 |
3.2 结果 | 第50-56页 |
3.2.1 TFBS预测结果 | 第50-51页 |
3.2.2 保守性分析 | 第51页 |
3.2.3 靶基因预测 | 第51-52页 |
3.2.4 GO富集分析 | 第52-55页 |
3.2.5 KEGG Pathway富集分析 | 第55页 |
3.2.6 转录因子-miRNA-靶基因作用网络 | 第55-56页 |
3.3 讨论 | 第56-59页 |
第四章 全文结论 | 第59-60页 |
参考文献 | 第60-70页 |
致谢 | 第70-71页 |
作者简介 | 第71-72页 |
附录 | 第72页 |