真核生物顺式作用元件提取与识别模型研究与实现
| 摘要 | 第8-9页 |
| 英文摘要 | 第9页 |
| 1 引言 | 第11-16页 |
| 1.1 研究目的和意义 | 第11-12页 |
| 1.2 国内外研究现状 | 第12-14页 |
| 1.3 本文研究内容 | 第14-15页 |
| 1.4 本文组织结构 | 第15-16页 |
| 2 模型的架构与基本原理 | 第16-26页 |
| 2.1 模体识别介绍 | 第16-22页 |
| 2.1.1 模体表示方法 | 第16-17页 |
| 2.1.2 模体识别的主要方法 | 第17-20页 |
| 2.1.3 模体识别的体系结构 | 第20-22页 |
| 2.2 模型的体系结构 | 第22-25页 |
| 2.2.1 模型的基本原理 | 第22-23页 |
| 2.2.2 模体提取与识别的流程 | 第23-25页 |
| 2.3 本章小结 | 第25-26页 |
| 3 模型的关键技术研究 | 第26-38页 |
| 3.1 文件预处理 | 第26页 |
| 3.1.1 文件格式转换 | 第26页 |
| 3.1.2 启动子提取 | 第26页 |
| 3.2 同源基因比对 | 第26-32页 |
| 3.2.1 Blast工具与Mcl聚类算法 | 第27-31页 |
| 3.2.2 实验结果与分析 | 第31-32页 |
| 3.3 基于三阶马尔科夫模型与图论的模体识别算法 | 第32-37页 |
| 3.3.1 背景分布序列的建立 | 第33-34页 |
| 3.3.2 模体识别与显著性判定 | 第34-36页 |
| 3.3.3 识别结果与分析 | 第36-37页 |
| 3.4 本章小结 | 第37-38页 |
| 4 系统设计与实现 | 第38-49页 |
| 4.1 真核生物顺式作用元件识别系统实现 | 第38-44页 |
| 4.1.1 系统设计原则 | 第38页 |
| 4.1.2 系统功能设计 | 第38-41页 |
| 4.1.3 系统具体实现 | 第41-44页 |
| 4.2 实验测试与分析 | 第44-48页 |
| 4.2.1 性能评价指标 | 第44-45页 |
| 4.2.2 实验结果 | 第45页 |
| 4.2.3 实验结果比较及分析 | 第45-48页 |
| 4.3 本章小结 | 第48-49页 |
| 5 总结与展望 | 第49-51页 |
| 5.1 总结 | 第49页 |
| 5.2 展望 | 第49-51页 |
| 致谢 | 第51-52页 |
| 参考文献 | 第52-56页 |
| 攻读硕士学位期间发表的学术论文 | 第56页 |
