| 摘要 | 第7-9页 |
| ABSTRACT | 第9-10页 |
| 前言 | 第11-13页 |
| 第一章 文献综述 | 第13-29页 |
| 1 农药污染的微生物修复 | 第13-14页 |
| 1.1 农药的环境微生物降解机制 | 第13-14页 |
| 1.2 农药污染微生物修复的方式 | 第14页 |
| 2 硫代氨基甲酸酯类除草剂及杀草丹的性质、应用及残留危害 | 第14-16页 |
| 3 杀草丹的降解研究进展 | 第16-20页 |
| 3.1 杀草丹在动植物体内的降解 | 第16-18页 |
| 3.2 杀草丹的微生物降解及其主要降解类群 | 第18-19页 |
| 3.3 杀草丹的非生物降解 | 第19-20页 |
| 3.4 杀草丹降解基因的研究 | 第20页 |
| 4 对氯苯甲酸的降解 | 第20-23页 |
| 5 国内外研究进展总结和研究技术路线 | 第23-24页 |
| 6 本研究的目的和意义 | 第24-25页 |
| 参考文献 | 第25-29页 |
| 第二章 杀草丹降解菌S351的分离与鉴定 | 第29-41页 |
| 1 材料与方法 | 第29-32页 |
| 1.1 菌株、培养基与试剂 | 第29-30页 |
| 1.2 杀草丹降解菌株的分离 | 第30页 |
| 1.3 杀草丹降解菌株的培养特征及生理生化鉴定 | 第30页 |
| 1.4 杀草丹降解菌株的16S rRNA基因序列的测定 | 第30-31页 |
| 1.5 杀草丹降解菌株系统发育地位的确定 | 第31页 |
| 1.6 杀草丹含量的测定 | 第31-32页 |
| 1.7 杀草丹降解菌株菌体生长量的测定 | 第32页 |
| 2 结果与分析 | 第32-39页 |
| 2.1 污染土壤中杀草丹降解菌株S351降解菌株的分离 | 第32-33页 |
| 2.2 降解菌株S351的菌落形态及生理生化特征 | 第33-34页 |
| 2.3 降解菌株S351的鉴定结果 | 第34-36页 |
| 2.4 环境条件对降解菌株S351生长的影响 | 第36-39页 |
| 2.5 最适培养基的确定 | 第39页 |
| 3 本章小结 | 第39-40页 |
| 参考文献 | 第40-41页 |
| 第三章 杀草丹降解菌S351的降解特性研究 | 第41-53页 |
| 1 材料与方法 | 第41-43页 |
| 1.1 培养基与试剂 | 第41页 |
| 1.2 菌体生长量的测定 | 第41页 |
| 1.3 菌株S351对杀草丹的降解特性研究 | 第41-42页 |
| 1.4 底物利用试验 | 第42页 |
| 1.5 Cl-、SO_4~(2-)释放实验 | 第42-43页 |
| 2 结果与分析 | 第43-50页 |
| 2.1 菌株S351以杀草丹为唯一碳源的生长及降解实验 | 第43-45页 |
| 2.2 底物利用谱 | 第45页 |
| 2.3 杀草丹降解菌株S351脱氯的验证 | 第45-46页 |
| 2.4 杀草丹降解菌株S351脱硫的验证 | 第46页 |
| 2.5 菌株S351以杀草丹为唯一 C-N源,C-S源,C-Cl-N源生长的实验 | 第46-47页 |
| 2.6 杀草丹起始浓度对菌株S351降解杀草丹的影响 | 第47-48页 |
| 2.7 接种量对菌株S351降解杀草丹的影响 | 第48页 |
| 2.8 初始pH对菌株S351降解杀草丹的影响 | 第48-49页 |
| 2.9 培养温度对菌株S351降解杀草丹的影响 | 第49-50页 |
| 3 本章小结 | 第50-51页 |
| 参考文献 | 第51-53页 |
| 第四章 菌株S351和S3512基因组框架图测序,基因组差异比较与验证以及侧翼片段扩增 | 第53-65页 |
| 1 材料与方法 | 第53-55页 |
| 1.1 试剂与培养基 | 第53页 |
| 1.2 杀草丹降解菌株S351和突变株S3512基因组框架图测序 | 第53-54页 |
| 1.3 菌株S351及其突变株全基因组序列差异比较与验证 | 第54页 |
| 1.4 突变株S3512缺失片段的侧翼序列扩增与拼接 | 第54-55页 |
| 2 结果与讨论 | 第55-63页 |
| 2.1 杀草丹降解菌株S351的突变株S3512的获得 | 第55-56页 |
| 2.2 菌株S351及其突变株S3512的基因组提取及检测 | 第56-57页 |
| 2.3 DNA样品文库构建 | 第57页 |
| 2.4 基因组数据组装 | 第57-58页 |
| 2.5 菌株S351及其突变株全基因组序列比对及验证 | 第58-60页 |
| 2.6 两菌株差异片段的拼接 | 第60-61页 |
| 2.7 SEFA-PCR结果 | 第61-63页 |
| 3 本章小结 | 第63-64页 |
| 参考文献 | 第64-65页 |
| 第五章 菌株S351降解杀草丹的降解途径及杀草丹下游降解基因分析 | 第65-77页 |
| 1 材料与方法 | 第65-67页 |
| 1.1 培养基与试剂 | 第65页 |
| 1.2 菌株S351降解酶的粗酶液酶学特性研究 | 第65-66页 |
| 1.3 代谢产物提取 | 第66页 |
| 1.4 代谢产物的GC-MS检测 | 第66页 |
| 1.5 杀草丹下游降解基因分析 | 第66页 |
| 1.6 菌株中的fcbABC基因的扩增 | 第66-67页 |
| 2 结果与讨论 | 第67-75页 |
| 2.1 菌株S351降解酶的粗酶液酶学特性研究 | 第67-68页 |
| 2.2 杀草丹降解产物的高效液相色谱初步检测 | 第68-69页 |
| 2.3 杀草丹降解产物的GC-MS检测 | 第69-72页 |
| 2.4 全基因组测序所得结果的分析 | 第72-73页 |
| 2.5 fcbABC基因的扩增 | 第73页 |
| 2.6 菌株S351降解杀草丹的下游遗传机制研究及其降解途径分析 | 第73-75页 |
| 3 本章小结 | 第75-76页 |
| 参考文献 | 第76-77页 |
| 全文总结 | 第77-79页 |
| 本文的创新点 | 第79-81页 |
| 不足之处 | 第81-83页 |
| 展望 | 第83-85页 |
| 附录一 文中所用培养基及试剂配方 | 第85-87页 |
| 附录二 相关DNA序列 | 第87-89页 |
| 附录三 符号与缩略语说明 | 第89-91页 |
| 攻读硕士学位期间发表或已接收的学术论文 | 第91-93页 |
| 致谢 | 第93页 |
