| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-8页 |
| 縮略词 | 第8-9页 |
| 第一章 绪论 | 第9-24页 |
| ·双歧杆菌与人体健康密切相关 | 第9-12页 |
| ·双歧杆菌是人体肠道最早的定殖者 | 第9-10页 |
| ·双歧杆菌改善多种疾病状态 | 第10-11页 |
| ·双歧杆菌通过多种途径促进人体健康 | 第11-12页 |
| ·双歧杆菌在人体肠道中的丰度是限制其功能的主要因素 | 第12-13页 |
| ·婴儿肠道双歧杆菌受多种因素影响丰度下降 | 第12页 |
| ·随年龄增长双歧杆菌的丰度下降 | 第12-13页 |
| ·外源摄入的双歧杆菌只能暂时提高丰度 | 第13页 |
| ·双歧杆菌对肠道环境的适应能力是影响其丰度的重要因素 | 第13-21页 |
| ·对肠道碳源的利用能力是影响双歧杆菌丰度主要决定因素 | 第14-19页 |
| ·对其他肠道环境条件的适应能力是影响双歧杆菌丰度的重要因素 | 第19-21页 |
| ·组学是研究双歧杆菌肠道适应机制的主要手段 | 第21-22页 |
| ·宏基因组学全面解析了双歧杆菌所在肠道菌群的组成 | 第21页 |
| ·功能基因组学研究揭示了双歧杆菌对婴儿肠道碳源适应的机制 | 第21页 |
| ·比较基因组学在解析双歧杆菌共性及特性方面显示了巨大的潜力 | 第21-22页 |
| ·BBMN68是研究双歧杆菌肠道环境适应的理想菌株 | 第22页 |
| ·研究目的及意义 | 第22-23页 |
| ·研究目的 | 第23页 |
| ·研究意义 | 第23页 |
| ·研究内容 | 第23-24页 |
| ·多糖利用能力对双歧杆菌丰度的决定作用 | 第23页 |
| ·BBMN68对肠道多糖的利用特点 | 第23页 |
| ·BBMN68适应肠道环境的遗传基础 | 第23-24页 |
| 第二章 双歧杆菌碳源利用能力的比较基因组预测 | 第24-39页 |
| ·前言 | 第24页 |
| ·材料与方法 | 第24-28页 |
| ·基因组序列获取 | 第24-28页 |
| ·糖苷水解酶序列获取 | 第28页 |
| ·糖苷水解酶亚细胞定位分析 | 第28页 |
| ·糖苷水解酶底物分析 | 第28页 |
| ·结果与分析 | 第28-36页 |
| ·糖苷水解酶数量及细胞定位比较 | 第28-29页 |
| ·糖苷水解酶家族比较 | 第29-31页 |
| ·不同类型糖苷水解酶预测底物的比较 | 第31-36页 |
| ·讨论 | 第36-38页 |
| ·不同种群具有不同的优势底物 | 第36-37页 |
| ·淀粉是双歧杆菌的优势底物 | 第37页 |
| ·淀粉类底物的利用是决定双歧杆菌肠丰度的主要因素 | 第37-38页 |
| ·小结 | 第38-39页 |
| 第三章 BBMN68碳源利用能力的分析及验证 | 第39-68页 |
| ·前言 | 第39页 |
| ·材料与试剂 | 第39-45页 |
| ·实验菌株 | 第39页 |
| ·主要仪器 | 第39-40页 |
| ·主要试剂及配制 | 第40-41页 |
| ·实验方法 | 第41-45页 |
| ·结果与分析 | 第45-65页 |
| ·基因功能预测 | 第45-55页 |
| ·基因功能验证 | 第55-59页 |
| ·淀粉利用相关基因的验证 | 第59-63页 |
| ·基因序列保守性分析 | 第63-65页 |
| ·讨论 | 第65-67页 |
| ·BBMN68编码数目较多胞外植物细胞壁降解糖苷水解酶 | 第65-66页 |
| ·BBMN68具有完整代谢淀粉不完全降解产物-麦芽糊精的途径 | 第66页 |
| ·BBMN68淀粉代谢基因在双歧杆菌中保守存在 | 第66-67页 |
| ·小结 | 第67-68页 |
| 第四章 BBMN68肠道环境适应相关的特有基因研究 | 第68-82页 |
| ·前言 | 第68页 |
| ·材料与方法 | 第68-69页 |
| ·基因相似度分析 | 第68页 |
| ·蛋白COG功能分析 | 第68-69页 |
| ·蛋白TAT信号肽分析 | 第69页 |
| ·结果与讨论 | 第69-80页 |
| ·BBMN68基因序列保守性 | 第69-70页 |
| ·BBMN68蛋白COG功能保守性 | 第70-74页 |
| ·BBMN68特异性基因功能 | 第74-80页 |
| ·小结 | 第80-82页 |
| 第五章 总结与展望 | 第82-84页 |
| ·总结 | 第82页 |
| ·论文创新点 | 第82-83页 |
| ·展望 | 第83-84页 |
| 参考文献 | 第84-100页 |
| 附录 | 第100-112页 |
| 致谢 | 第112-113页 |
| 个人简介 | 第113页 |
