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生理性低氧对神经干细胞中miR-210的表达调控及功能研究

摘要第1-8页
Abstract第8-13页
英文缩写词表第13-14页
目录第14-19页
第一部分 引言第19-42页
 一、哺乳动物神经干细胞第20-23页
  (一) 神经干细胞的特性与定义第20-21页
  (二) 神经干细胞的应用价值第21-22页
  (三) 神经干细胞的来源第22-23页
 二、低氧的生理意义及对神经干细胞发育的影响第23-25页
  (一) 低氧是胚胎发育和成年脑组织的生理环境第23页
  (二) 低氧对神经干细胞增殖和分化的影响第23-25页
 三、HIF-1途径—低氧调控神经干细胞发育的核心信号通路第25-30页
  (一) HIF-1的发现第25页
  (二) HIF-1的功能结构第25-26页
  (三) 氧依赖的HIF-1调控第26-29页
  (四) 非氧依赖的HIF-1调控第29页
  (五) HIF-1的靶基因与细胞存活第29-30页
  (六) HIF-1在神经干细胞发育中的作用第30页
 四、microRNAs—低氧调控神经干细胞发育的新发现第30-39页
  (一) miRNAs的发现与命名第30-31页
  (二) miRNAs的特点第31-33页
  (三) miRNAs的加工机制与功能第33-35页
  (四) DNA甲基化对miRNAs的表达调控第35-36页
  (五) miRNAs与神经系统第36-38页
  (六) 低氧对miRNAs表达调控的影响第38-39页
 五、本研究的目的与意义第39-42页
第二部分 神经干细胞的分离培养和鉴定以及低氧时NSCs中HIF-1稳定的调控机制第42-69页
 一、实验材料与试剂第42-46页
  (一) 主要仪器第42-43页
  (二) 实验动物第43页
  (三) 抗体第43-44页
  (四) 主要试剂及常用试剂配方第44-46页
 二、实验方法第46-56页
  (一) 低氧条件与分组第46-47页
  (二) 原代大鼠中脑神经干细胞的分离第47页
  (三) 神经干细胞的传代培养第47-48页
  (四) 体外培养神经干细胞自我更新与分化能力的免疫荧光鉴定第48-49页
  (五) 细胞中总RNA的提取及反转录PCR检测mRNA表达水平的变化第49-52页
  (六) 细胞中蛋白的提取及Western blot检测蛋白表达水平的变化第52-55页
  (七) 流式细胞术检测细胞周期与增殖指数(PI)第55页
  (八) 细胞存活率分析第55页
  (九) 数据处理与统计学分析第55-56页
 三、实验结果第56-65页
  (一) 原代大鼠中脑神经干细胞的分离培养与鉴定结果第56-57页
  (二) 低氧对体外培养NSCs中HIF-1α和HSP90表达的影响第57-59页
  (三) 抑制HSP90活性对低氧诱导的HIF-1α蛋白稳定的影响第59-61页
  (四) 抑制HSP90活性对神经干细胞存活的影响第61-63页
   1. 用GA抑制HSP90活性对NSCs存活的影响第61-62页
   2. 用赤根霉素(Radicicol)抑制HSP90活性对HIF-1α稳定和NSCs存活的影响第62-63页
  (五) 抑制HSP90活性对神经干细胞增殖及细胞周期的影响第63-64页
  (六) 抑制HSP90活性后对HIF-1靶基因表达的影响第64-65页
 四、讨论第65-68页
 五、结论第68-69页
第三部分 低氧下神经干细胞中表达变化的microRNAs的芯片筛选及表达验证第69-81页
 一、实验材料与试剂第69-70页
  (一) 主要仪器第69页
  (二) 主要试剂及常用试剂配方第69-70页
 二、实验方法第70-74页
  (一) RNA提取与ncRNAs表达谱分析第70页
  (二) Real-Time PCR检测miRNAs表达第70-73页
  (三) 生物信息学分析第73-74页
  (四) 数据处理与统计学分析第74页
 三、实验结果第74-78页
  (一) 低氧下NSCs中表达变化的ncRNAs的芯片筛选结果第74页
  (二) Q-PCR验证低氧下表达上调的miRNAs第74-76页
  (三) 生物信息学分析可能受HIF-1调控的miRNAs第76-77页
  (四) 不同氧浓度对NSCs中miR-210的表达影响第77-78页
 四、讨论第78-80页
 五、结论第80-81页
第四部分 低氧时神经干细胞中miR-210表达调控机制的研究第81-121页
 一、实验材料与试剂第81-82页
  (一)主要仪器第81页
  (二) 实验动物、菌株与质粒第81页
  (三) 抗体第81页
  (四) 主要试剂及常用试剂配方第81-82页
 二、实验方法第82-101页
  (一) pGL3-miRNA荧光素酶报告质粒的构建第82-87页
  (二) pEGFP-HIF-1过表达质粒的构建、鉴定与表达验证第87-89页
  (三) 双荧光素酶检测系统检测低氧及HIF-1对miRNAs的表达调控第89-92页
  (四) 染色质免疫沉淀分析(ChIP)第92-93页
  (五) miR-210调控序列CpG岛分布的软件分析第93页
  (六) 亚硫酸氢盐修饰测序法检测基因组DNA甲基化状态第93-97页
  (七) Real-Time PCR检测AZA对NSCs中miRNAs表达的影响第97页
  (八) Real-Time PCR检测NSCs中Dnmts家族的表达水平第97-98页
  (九) NSCs中Dnmts及HAT酶活性检测第98-100页
  (十) 数据处理与统计学分析第100-101页
 三、实验结果第101-115页
  (一) HIF-1途径对miR-210表达的调控第101-104页
   1. pGL3-miRNA荧光素酶质粒和pEGFP-HIF-1质粒的构建及鉴定第101-102页
   2. 双荧光素酶系统检测过表达HIF-1对pGL3-miRNA荧光素酶活性的影响第102-104页
   3. ChIP检测与HIF-1蛋白结合的miRNA调控序列第104页
  (二) DNA甲基化对miR-210表达的调控第104-115页
   1. 软件分析miR-210调控序列的CpG岛分布第105页
   2. AZA抑制DNA甲基化对miR-210表达的影响第105-108页
   3. 亚硫酸盐修饰测序法检测低氧下miR-210调控序列甲基化修饰水平的变化第108-112页
   4. 低氧对神经干细胞中Dnmts表达水平的影响第112-113页
   5. 低氧对神经干细胞中Dnmts和HAT活性的影响第113-115页
 四、讨论第115-120页
 五、结论第120-121页
第五部分 miR-210在神经干细胞及组织发育中的功能研究第121-133页
 一、实验材料与试剂第121页
  (一) 主要仪器第121页
  (二) 实验动物第121页
  (三) 主要试剂及常用试剂配方第121页
 二、实验方法第121-126页
  (一) miR-210慢病毒载体表达效果检测第121-122页
  (二) CCK-8检测细胞的存活率第122-123页
  (三) BrdU掺入及DAB染色检测细胞的增殖率第123-124页
  (四) E16大鼠子宫胚胎电转及免疫组化检测第124-126页
 三、实验结果第126-130页
  (一) miR-210慢病毒载体的过表达效果检测第126页
  (二) CCK-8法检测过表达miR-210对细胞存活率的影响第126-127页
  (三) BrdU掺入法检测过表达miR-210对细胞存活率的影响第127-128页
  (四) 抑制miR-210对胎鼠神经发育的影响第128-130页
 四、讨论第130-132页
 五、结论第132-133页
总结第133-134页
论文创新点第134-135页
参考文献第135-146页
博士期间发表及待发表论文第146-147页
致谢第147-148页

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