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PRSV NIa-Pro互作宿主因子的筛选和功能分析

摘要第1-6页
Abstract第6-13页
1 前言第13-21页
   ·番木瓜的生产和种植第13-14页
     ·番木瓜的经济价值和开发前景第13页
     ·番木瓜种植业面临的挑战和抗病品种改良的重要性第13-14页
   ·番木瓜环斑病毒简介第14-16页
     ·PRSV的形态特征第14-15页
     ·PRSV在番木瓜上引起的症状第15页
     ·PRSV的传播途径,株系以及寄住范围第15-16页
     ·PRSV的基因组结构以及所编码的蛋白质第16页
   ·植物病毒蛋白与宿主蛋白间互作的重要性第16-18页
   ·NIa-Pro基因的研究现状第18-19页
   ·本研究的目的和意义第19-20页
   ·技术路线第20-21页
2 材料与方法第21-52页
   ·实验中所用到的主要材料、试剂、菌株及仪器等第21-30页
     ·植物和病毒材料第21页
     ·试剂第21-22页
     ·菌株第22页
     ·载体第22-26页
       ·SRS酵母双杂交系统载体第22-24页
       ·BIFC系统载体第24-25页
       ·亚细胞定位载体第25页
       ·原核表达载体第25-26页
     ·引物第26-29页
     ·仪器第29-30页
   ·方法第30-52页
     ·SRS系统筛选NIa-Pro互作宿主因子第30-39页
       ·NIa-Pro诱饵载体的构建第30-34页
         ·PRSV-HN接种第30页
         ·番木瓜叶片总RNA提取第30-31页
         ·NIa-Pro基因的克隆第31页
         ·PCR产物回收第31-32页
         ·PCR回收片段连接pMD18-T Vector第32页
         ·连接产物转化DH5α感受态细胞第32页
         ·菌液PCR检测第32页
         ·生工法小量质粒提取第32-33页
         ·克隆载体pMD18-T-NP和酵母表达载体pSos双酶切第33页
         ·pSos-NP诱饵载体的构建和鉴定第33-34页
       ·酵母菌株的表型鉴定和感受态制备第34-35页
         ·酵母菌株的活化和表型鉴定第34页
         ·cdc25H(α)感受态细胞的制备第34-35页
       ·诱饵蛋白自激活检测第35-36页
       ·NIa-Pro互作寄主因子初次筛选第36-37页
         ·MACHEREY-NAGEL法提取文库质粒和诱饵载体质粒第36页
         ·番木瓜cDNA文库筛选第36-37页
       ·候选阳性转化子文库载体的分离和SRS回转验证第37-39页
         ·天根法提取酵母质粒的提取第37页
         ·酵母质粒的转化分离第37-38页
         ·候选阳性转化子质粒PCR检测和质粒提取第38页
         ·候选阳性克隆的回转第38-39页
     ·SRS系统检测全长宿主因子与NIa-Pro的互作第39-40页
       ·阳性克隆分析和全长宿主因子克隆的获得第39页
       ·全长宿主因子pMyr载体构建第39页
       ·SRS系统检测第39-40页
     ·BIFC系统检测全长宿主因子与NIa-Pro的互作第40-42页
       ·全长宿主因子BIFC载体构建第40页
       ·BIFC分析第40-42页
         ·微载体制备第40-41页
         ·基因枪轰击转化洋葱表皮细胞与荧光观察第41-42页
     ·BIFC分析NIa-Pro与PaFBPA1和NIa-Pro与PaMsrB1互作的亚细胞定位第42-43页
       ·用于亚细胞定位的NIa-Pro、PaFBPA1和PaMsrB1载体构建第42页
       ·BIFC分析NIa-Pro与PaFBPA1和NIa-Pro与PaMsrB1互作的亚细胞定位第42-43页
         ·番木瓜叶片原生质体细胞的分离第42页
         ·原生质转化与激光共聚焦显微镜观察第42-43页
     ·SRS分析NIa-Pro,PaMsrB1和PaFBPA1不同突变体的互作第43-46页
       ·各种突变体克隆的获得第43页
       ·各种突变体载体构建第43-44页
       ·SRS系统检测NIa-Pro不同缺失突变体与全长宿主因子PaMsrB1和PaFBPA1的互作第44-45页
       ·SRS系统检测全长NIa-Pro与宿主因子PaMsrB1和PaFBPA1的不同缺失突变体的互作第45页
       ·SRS系统检测全长NIa-Pro与宿主因子PaMsrB1和PaFBPA1的不同点突变体的互作第45-46页
     ·原核表达NIa-Pro、PaFBPA1和PaMsrB1以及检测NIa-Pro对PaFBPA1和PaMsrB1的酶切第46-49页
       ·原核表达载体构建与鉴定第46-47页
       ·重组质粒的转化和表达第47页
         ·重组质粒转化大肠杆菌表达菌株BL21(DE3)第47页
         ·阳性克隆的诱导表达第47页
       ·GST融合蛋白的纯化第47-48页
       ·酶切分析第48页
       ·Western blot分析酶切结果第48-49页
     ·互作宿主因子PaFBPA1和PaMsrB1在PRSV入侵过程中的表达分析第49-51页
       ·PRSV接种第49页
       ·番木瓜叶片总RNA提取第49页
       ·实时定量检测第49-51页
         ·定量模板cDNA第一链合成第49-50页
         ·实时定量检测第50页
         ·结果分析第50-51页
     ·病毒入侵过程中的活性氧表达分析第51-52页
       ·样品制备第51页
       ·Quantikine ELISA检测第51-52页
3 结果第52-84页
   ·SRS筛选NIa-Pro互作宿主因子第52-55页
     ·NIa-Pro诱饵载体的构建和SRS系统自激活检测第52-53页
       ·全长NIa-Pro的获得和诱饵载体构建第52页
       ·酵母菌株cdc25H(α)感受态制备转化效率检测第52-53页
       ·SRS系统自激活检测第53页
     ·NIa-Pro互作因子初次筛选第53-54页
     ·回转验证第54-55页
   ·SRS系统检测6种全长宿主因子与NIa-Pro的互作第55-62页
     ·6种宿主基因序列分析和全长克隆的获得第55-60页
     ·全长宿主因子pMyr载体构建第60-61页
     ·SRS系统检测结果分析第61-62页
   ·BIFC系统检测6个宿主因子与NIa-Pro的互作第62-64页
     ·6个宿主因子和NIa-Pro BIFC载体构建第62-63页
     ·BIFC结果分析第63-64页
   ·NIa-Pro-PaFBPA1和NIa-Pro-PaMsrB1的亚细胞定位第64-67页
     ·NIa-Pro,PaFBPA1和PaMsrB1的亚细胞载体构建第64-65页
     ·激光共聚焦显微镜观察分析第65-67页
   ·SRS分析NIa-Pro,PaMsrB1和PaFBPA1不同突变体的互作第67-77页
     ·SRS系统检测NIa-Pro不同缺失突变体与全长宿主因子PaMsrB1和PaFBPA1的互作第67-70页
       ·PRSV NIa-Pro的生物信息学分析和缺失突变体设计第67-68页
       ·缺失突变载体构建第68-69页
       ·SRS系统检测NIa-Pro不同缺失突变体与全长宿主因子PaMsrBl 和 PaFBPAl 的互作第69-70页
     ·SRS系统检测NIa-Pro与全长宿主因子PaFBPA1不同缺失突变体的互作第70-72页
       ·PaFBPA1的生物信息学分析和缺失突变体设计第70页
       ·PaFBPA1缺失突变载体构建第70-71页
       ·SRS系统检测NIa-Pro与PaFBPA1缺失突变体的互作第71-72页
     ·SRS系统检测NIa-Pro与全长宿主因子PaFBPA1不同点突变体的互作第72-73页
       ·PaFBPA1的生物信息学分析和点突变设计第72页
       ·PaFBPA1点突变载体构建第72页
       ·SRS系统检测NIa-Pro与PaFBPA1点突变体的互作第72-73页
     ·SRS系统检测NIa-Pro与全长宿主因子PaMsrB1不同缺失突变体的互作第73-75页
       ·PaMsrB1的生物信息学分析和缺失突变载体构建第73-74页
       ·PaMsrB1缺失突变载体构建第74页
       ·SRS系统检测NIa-Pro与PaMsrB1缺失突变体的互作第74-75页
     ·SRS系统检测NIa-Pro与全长宿主因子PaMsrB1不同点突变体的互作第75-77页
       ·PaMsrB1的生物信息学分析和点突变设计第75-76页
       ·PaMsrB1点突变载体构建第76页
       ·SRS系统检测NIa-Pro与PaMsrB1点突变体的互作第76-77页
   ·原核表达NIa-Pro、PaFBPA1和PaMsrB1以及检测NIa-Pro对PaFBPA1和PaMsrB1的酶切第77-80页
     ·NIa-Pro蛋白酶识别位点在PaFBPA1上的查找和分析第77-78页
     ·NIa-Pro、PaFBPA1和PaMsrB1原核表达载体构建第78-79页
     ·NIa-Pro、PaFBPA1和PaMsrB1大肠杆菌表达和纯化结果分析第79页
     ·NIa-Pro对PaFBPA1和PaMsrB1的酶切分析第79-80页
   ·互作宿主因子在PRSV入侵过程中的表达第80-82页
     ·扩增曲线、融解曲线分析第80-81页
     ·接种病毒后PaFBPA1和PaMSRB1的相对表达分析第81-82页
   ·病毒入侵过程中的活性氧表达分析第82-84页
     ·标准曲线绘制第82-83页
     ·PRSV接种不同时间ROS变化结果第83-84页
4 讨论第84-89页
   ·NIa-Pro互作宿主因子的分析第84-89页
     ·NIa-Pro与PaFBPA1互作分析第84-85页
     ·NIa-Pro与PaMsrB1互作分析第85-87页
     ·NIa-Pro与PaEIF3G、PaMTL、PaFK506BP和PaGTPBP互作分析第87-89页
5 结论第89-90页
参考文献第90-97页
致谢第97页

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