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SurKex诱导survivin基因沉默的分子机理研究

摘要第1-6页
ABSTRACT第6-11页
简写说明第11-17页
第一章 概论第17-39页
 1 基因表达的表观遗传调控第17-18页
 2 基因沉默第18-20页
   ·转录水平基因沉默第19页
   ·转录后水平基因沉默第19-20页
   ·基因沉默的生物学意义第20页
 3 DNA 甲基化第20-28页
   ·DNA 甲基化及其建立第20-21页
   ·DNA 甲基化转移酶第21页
   ·DNA 甲基化与基因表达第21-22页
   ·DNA 甲基化与肿瘤第22-25页
     ·肿瘤基因中的DNA 甲基化异常与肿瘤发生第22-23页
     ·DNA甲基化与肿瘤的治疗第23-25页
       ·基于抑癌基因启动子区高甲基化而进行的去甲基化治疗第23页
       ·基于肿瘤相关癌基因启动子区低甲基化而进行的甲基化治疗第23-25页
         ·RNA 介导的DNA 甲基化第24页
         ·DNA 介导的DNA 甲基化第24-25页
   ·DNA 甲基化检测的方法第25-28页
 4 组蛋白密码与基因表达第28-33页
   ·组蛋白甲基化第29-31页
     ·组蛋白甲基化与基因表达第29-30页
     ·组蛋白去甲基化第30页
     ·组蛋白甲基化与DNA 甲基化第30-31页
     ·组蛋白甲基化与肿瘤第31页
   ·组蛋白乙酰化和去乙酰化与基因表达第31-32页
     ·组蛋白乙酰化/去乙酰化与DNA 甲基化的关系第31-32页
     ·组蛋白乙酰化/去乙酰化与组蛋白甲基化的关系第32页
     ·组蛋白乙酰化/去乙酰化与肿瘤第32页
   ·组蛋白的其他修饰方式第32-33页
   ·研究组蛋白共价修饰的分析方法第33页
 5 凋亡抑制因子survivin 与肿瘤第33-35页
   ·survivin 的分子结构与功能第33-34页
   ·survivin 与肿瘤第34页
   ·针对survivin 的肿瘤靶向治疗第34-35页
 6 本文的研究内容及意义第35-39页
   ·前期研究基础第35-38页
     ·核酸药物SurKex 的设计第35-37页
     ·SurKex 的药效学实验第37-38页
     ·对SurKex 诱导survivin 沉默机理的初步探讨第38页
   ·本论文主要研究内容第38页
   ·本论文的研究意义第38-39页
第二章 SurKex诱导survivin启动子部位甲基化的方式第39-49页
 1 材料与方法第39-44页
   ·材料与主要试剂第39页
   ·主要仪器第39-40页
   ·细胞培养第40页
   ·转染第40页
   ·基因组抽提第40-41页
   ·亚硫酸氢钠处理基因组DNA第41页
   ·纯化基因组DNA 及终止亚硫酸氢钠反应第41页
   ·PCR 扩增目的片断第41-42页
   ·电泳检测第42页
   ·回收目的条带第42-43页
   ·TA 克隆第43页
   ·挑取并PCR 鉴定转化子,对正确插入的转化子进行扩大培养第43页
   ·测序第43-44页
 2 结果第44-49页
 3 讨论第49页
第三章 SurKex 对与survivin 特异结合的组蛋白的共价修饰的影响第49-59页
 1 材料与方法第49-53页
   ·材料与主要试剂第49-50页
   ·主要仪器第50页
   ·细胞培养第50页
   ·转染第50页
   ·染色质免疫沉淀分析第50-53页
     ·超声剪切基因组DNA第50-51页
     ·免疫沉淀第51-52页
     ·PCR 扩增结合在免疫沉淀的组蛋白上的DNA第52-53页
 2 结果第53-57页
   ·超声条件的确定第54-55页
   ·免疫沉淀实验系统的可靠性验证第55-56页
   ·SurKex 对H3、H4 特定位点乙酰化、甲基化修饰的影响第56-57页
 3 讨论第57-59页
第四章 DNA 甲基化、组蛋白共价修饰在survivin 沉默中的作用第59-71页
 1 材料与方法第60-63页
   ·材料与主要试剂第60页
   ·主要仪器第60页
   ·细胞培养第60页
   ·转染第60页
   ·RT-PCR第60-63页
     ·RNA 抽提第60-61页
     ·反转录第61-62页
     ·PCR第62-63页
     ·电泳第63页
   ·Bisulfite sequencing第63页
   ·ChIP 分析第63页
 2 结果第63-69页
   ·不同抑制剂对SurKex 抑制survivin mRNA 表达的影响第63-65页
   ·不同抑制剂对SurKex 诱导survivin 启动子区特定CpG位点甲基化的影响第65-67页
   ·不同抑制剂对survivin 启动子区结合的组蛋白共价修饰的影响第67-69页
 3 讨论第69-71页
第五章 组蛋白共价修饰对DNMT1 表达的影响第71-73页
 1 材料与方法第71页
   ·材料与主要试剂第71页
   ·主要仪器第71页
   ·细胞培养第71页
   ·转染第71页
   ·RT-PCR第71页
 2 结果第71-73页
   ·组蛋白去乙酰化对DNMT1 表达的影响第71-72页
   ·组蛋白甲基化对DNMT1 表达的影响第72-73页
 3 讨论第73页
第六章 总结与展望第73-78页
参考文献第78-89页
附录1第89-99页
附录2第99-100页
附录3第100-101页
攻读博士学位期间发表论文情况第101页
攻读博士学位期间发表会议论文情况第101-102页
致谢第102-104页

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