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北极海冰适冷菌Pseudoalteromonas sp.SM495在海冰环境碳循环中的生态作用

摘要第1-11页
Abstract第11-13页
缩略词表第13-15页
第一章 研究背景与立题依据第15-22页
   ·研究背景第15-20页
     ·海冰环境第15页
     ·海冰第15页
     ·海冰胞外多糖第15-16页
     ·海冰藻类第16-18页
       ·海冰藻类概述第16页
       ·海冰硅藻结构、组成第16-17页
       ·海冰硅藻细胞壁的功能第17-18页
     ·海冰细菌第18页
       ·海冰细菌的生理生态学第18页
       ·海冰细菌的生态作用第18页
     ·海冰细菌在氮循环和碳循环中的生态作用第18-19页
     ·纤维素酶概述第19-20页
       ·纤维素酶来源第19页
       ·纤维素酶分类第19页
       ·纤维素酶催化功能的研究进展第19-20页
       ·低温耐盐纤维素酶第20页
   ·立题依据与研究内容第20-22页
第二章 北极海冰适冷菌Pseudoalteromonas sp.SM495胞外酶对北极海冰硅藻Fragilaria sp.strain 04的作用第22-34页
   ·引言第22页
   ·实验材料、试剂和仪器第22-24页
     ·藻株与培养基第23页
     ·菌株与培养基第23页
     ·主要药品、试剂和试剂盒第23-24页
     ·主要仪器设备第24页
   ·实验方法第24-25页
     ·北极海冰硅藻F.sp.strain 04的培养第24页
     ·北极海冰适冷菌Ps.sp.SM495的培养第24页
     ·北极海冰适冷菌Ps.sp.SM495菌体以及胞外酶对北极海冰硅藻F.sp.strain 04的作用和取样第24-25页
     ·光学显微镜观察硅藻细胞结构第25页
     ·硅藻光谱吸收的测定第25页
   ·结果与分析第25-32页
     ·北极海冰硅藻F.sp.strain 04的培养第25-26页
     ·Ps.sp.SM495的培养第26页
     ·Ps.sp.SM495对硅藻的作用第26-28页
     ·Ps.sp.SM495胞外酶对硅藻作用第28-32页
       ·Ps.sp.SM495胞外酶处理前后硅藻溶液的变化第28-29页
       ·显微镜观察Ps.sp.SM495胞外酶处理前后硅藻的细胞结构变化第29-30页
       ·Ps.sp.SM495胞外酶处理前后硅藻溶液的光谱吸收第30-32页
   ·讨论第32-34页
第三章 北极海冰硅藻Fragilaria sp.strain 04及其代谢物对北极海冰适冷菌Pseudoalteromonas sp.SM495与碳循环有关的胞外酶基因的诱导作用第34-53页
   ·引言第34页
   ·实验材料、试剂和仪器第34-36页
     ·藻株与培养基第34页
     ·菌株与培养基第34-35页
     ·主要药品、试剂和试剂盒第35页
     ·主要仪器设备第35-36页
     ·数据库及分析软件第36页
   ·实验方法第36-39页
     ·北极海冰硅藻F.sp.strain 04的培养、冻融第36页
     ·诱导培养基组成的条件摸索第36页
     ·Ps.sp.SM495的培养、取样、生长曲线测定第36-37页
     ·Ps.sp.SM495总RNA的提取和反转录第37-38页
     ·Ps.sp.SM495中可能和硅藻有关的胞外酶基因的选取和引物设计第38页
     ·RT qPCR第38页
     ·纤维素酶、果胶酶类、褐藻酸裂解酶的酶活检测第38-39页
   ·结果与分析第39-51页
     ·北极海冰硅藻F.sp.strain 04的培养、冻融第39-40页
     ·加硅藻培养基组成第40-41页
     ·Ps.sp.SM495的生长曲线第41-42页
     ·Ps.sp.SM495的总RNA第42-43页
     ·Ps.sp.SM495可能和硅藻有关的胞外酶基因第43-45页
     ·Ps.sp.SM495胞外酶基因在硅藻诱导下的表达量变化第45-48页
     ·Ps.sp.SM495胞外纤维素酶、果胶酶类、褐藻酸裂解酶在硅藻诱导前后的酶活检测第48-51页
   ·讨论第51-53页
第四章 北极海冰适冷菌Pseudoalteromonas sp.SM495纤维素酶Cel495的分离纯化、异源表达和性质研究第53-76页
   ·引言第53页
   ·实验材料、试剂和仪器第53-55页
     ·菌株与质粒第53页
     ·培养基第53-54页
     ·主要药品、试剂和试剂盒第54页
     ·主要仪器设备第54-55页
     ·数据库及分析软件第55页
   ·实验方法第55-61页
     ·菌株的培养第55页
     ·纤维素酶酶活测定方法第55-56页
     ·蛋白质含量测定方法第56页
     ·蛋白质电泳方法第56-57页
     ·Ps.sp.SM495野生菌中纤维素酶的纯化第57-58页
     ·Ps.sp.SM495野生菌中纤维素酶的N端蛋白序列的测定和比对第58页
     ·Cel495的结构域及氨基酸序列分析第58页
     ·Cel495重组酶的异源表达和分离纯化第58-60页
       ·Cel495重组酶的基因克隆第58-59页
       ·Cel495重组酶在E.coli BL21(DE3)中的异源表达第59页
       ·Cel495全酶和催化结构域的分离纯化和电泳检测、酶含量测定第59页
       ·表达菌株和质粒的保存第59-60页
     ·Cel495野生酶和重组酶的酶学性质分析第60-61页
       ·底物特异性分析第60页
       ·最适反应温度及温度稳定性分析第60页
       ·最适反应pH分析第60页
       ·金属离子和化学试剂对酶活性的影响第60-61页
       ·NaCl对酶活性的影响第61页
       ·K_m值的测定及k_(cat)值、k_(cat)/K_m值的求算第61页
   ·结果与分析第61-74页
     ·Ps.sp.SM495的发酵条件第61页
     ·Ps.sp.SM495胞外纤维素酶的纯化及N端测序、蛋白序列确定第61-63页
       ·Ps.sp.SM495胞外纤维素酶的分离纯化第61-63页
       ·N端序列的确定第63页
       ·蛋白基因序列的确定第63页
     ·Cel495的结构域及氨基酸序列分析第63-64页
     ·Cel495重组酶的异源表达和分离纯化第64-66页
       ·Cel495重组酶的基因克隆第64-65页
       ·Cel495重组酶的表达和纯化第65-66页
     ·Cel495野生酶和重组酶的酶学性质分析第66-74页
       ·Cel495的最适反应温度及温度稳定性分析第66-68页
       ·Cel495的最适反应pH分析第68-69页
       ·Cel495的底物特异性分析第69页
       ·Cel495的金属离子对酶活性的影响第69-71页
       ·NaCl对Cel495酶活性的影响第71-72页
       ·Cel495的底物亲和力和催化效率比较第72-74页
   ·讨论第74-76页
全文总结与展望第76-78页
参考文献第78-85页
在读期间发表的论文、专利及获奖情况第85-87页
致谢第87-88页
学位论文评阅及答辩情况表第88页

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