菊花蚜虫抗性相关基因表达谱分析及microRNA发掘
| 摘要 | 第1-9页 |
| ABSTRACT | 第9-12页 |
| 缩略词表 | 第12-13页 |
| 引言 | 第13-14页 |
| 第一章 文献综述 | 第14-30页 |
| 1 植物抗蚜虫性研究进展 | 第14-21页 |
| ·菊姬长管蚜的生物学特性及其危害 | 第14页 |
| ·植物与蚜虫之间的相互作用 | 第14-20页 |
| ·蚜虫的取食行为 | 第15-16页 |
| ·蚜虫唾液成分及其在诱导植物反应中的作用 | 第16-18页 |
| ·植物的抗性反应 | 第18-20页 |
| ·植物抗虫性研究的重要性与可行性 | 第20-21页 |
| 2 高通量测序技术的发展及其在生物学研究中的应用 | 第21-25页 |
| ·从头测序 | 第21-22页 |
| ·全基因组重测序 | 第22页 |
| ·转录组测序 | 第22-24页 |
| ·转录组测序技术 | 第23页 |
| ·数字基因表达谱测序技术 | 第23-24页 |
| ·小分子RNA测序 | 第24-25页 |
| 3 MicroRNA的研究进展 | 第25-28页 |
| ·MicroRNA合成及其作用机制 | 第25-26页 |
| ·MicroRNA合成 | 第25页 |
| ·MicroRNA作用机制 | 第25-26页 |
| ·MicroRNA在植物逆境胁迫中的作用 | 第26-27页 |
| ·MicroRNA的研究展望 | 第27-28页 |
| 4 本研究的目的意义 | 第28-30页 |
| 第二章 蚜虫胁迫下切花菊表达谱分析 | 第30-50页 |
| 摘要 | 第30-31页 |
| 1 材料和方法 | 第31-33页 |
| ·供试材料 | 第31页 |
| ·人工蚜虫接种 | 第31-32页 |
| ·虫源准备 | 第31页 |
| ·微虫笼制备与使用方法 | 第31-32页 |
| ·蚜虫接种 | 第32页 |
| ·针刺处理 | 第32页 |
| ·菊花叶片RNA提取 | 第32页 |
| ·数字基因表达谱测序 | 第32页 |
| ·样品检测 | 第32页 |
| ·测序流程 | 第32页 |
| ·测序结果的生物信息学分析方法 | 第32-33页 |
| 2 结果与分析 | 第33-47页 |
| ·RNA提取质量检测 | 第33页 |
| ·测序质量 | 第33-34页 |
| ·差异基因的筛选 | 第34-36页 |
| ·差异表达基因的GO功能分类比较 | 第36-37页 |
| ·Pathway差异显著性分析 | 第37-47页 |
| 3 讨论 | 第47-50页 |
| 第三章 切花菊蚜虫抗性相关microRNA发掘 | 第50-72页 |
| 摘要 | 第50页 |
| 1 材料与方法 | 第50-51页 |
| ·植物材料 | 第50-51页 |
| ·人工蚜虫接种 | 第51页 |
| ·菊花叶片RNA提取 | 第51页 |
| ·菊花叶片小分子RNA文库构建 | 第51页 |
| ·小分子RNA文库的生物信息学分析 | 第51页 |
| 2 结果与分析 | 第51-69页 |
| ·小分子RNA序列信息 | 第51-54页 |
| ·小分子RNA数据质量及长度分析 | 第51-53页 |
| ·小分子RNA分类注释 | 第53-54页 |
| ·microRNA鉴定及表达分析 | 第54-61页 |
| ·差异表达microRNA靶基因预测及其功能分析 | 第61-69页 |
| ·差异表达microRNA靶基因预测 | 第61页 |
| ·预测靶基因的功能初步分析 | 第61-69页 |
| 3 讨论 | 第69-72页 |
| 全文结论 | 第72-74页 |
| 创新之处 | 第74-76页 |
| 参考文献 | 第76-86页 |
| 论文发表情况及参加的科研项目 | 第86-88页 |
| 附录一 菊花叶片RNA提取 | 第88-89页 |
| 附录二 数字型表达谱测序流程及数据分析 | 第89-92页 |
| 附录三 菊花叶片小分子RNA组的测序与分析法 | 第92-95页 |
| 附录四 差异基因GO富集分析 | 第95-98页 |
| 致谢 | 第98页 |
