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香鱼核转录抑制因子PaIκBα克隆与表达

摘要第1-6页
Abstract第6-11页
引言第11-13页
1 绪论第13-26页
   ·香鱼的生物学特性第13-14页
   ·香鱼养殖中的病害第14-16页
     ·香鱼寄生虫病第14-15页
     ·香鱼细菌性疾病第15-16页
     ·香鱼真菌性疾病第16页
   ·NFκB/IκB 家族第16-22页
     ·NF-κB 蛋白家族及其结构特征第17-19页
     ·IκB 蛋白家族及其结构特征第19-20页
     ·I-κK 蛋白家族及其结构特征第20-22页
   ·NF-κB 信号转导机制第22-26页
     ·TNFα介导的 NF-κB 信号通路第23页
     ·IL-1Rs/TLRs 介导的 NF-κB 信号通路第23-24页
     ·T 细胞受体介导的 NF-κB 激活第24页
     ·B 细胞受体介导的 NF-κB 激活第24页
     ·旁路 NF-κB 途径第24-26页
2 香鱼 PaIκBα 的基因克隆第26-38页
   ·实验材料第26-28页
     ·实验动物第26页
     ·酶与试剂盒第26页
     ·引物第26页
     ·培养基及常用试剂配制第26-27页
     ·菌株和载体第27页
     ·实验仪器第27页
     ·多序列比对和进化树分析中用到的各物种 IκBα 的氨基酸序列第27-28页
   ·实验方法第28-34页
     ·香鱼 RNA 的提取第28-29页
     ·转录合成香鱼 cDNA 第一链第29页
     ·目的基因 PaIκBα 的核心片段扩增第29-30页
     ·切胶回收目的基因 PaIκBα第30-31页
     ·PCR 产物回收纯化后与 pMd19-Tvector 的连接第31页
     ·CaCl2法制备大肠杆菌感受态细胞第31页
     ·重组质粒的转化第31-32页
     ·菌落 PCR 鉴定第32页
     ·测序第32页
     ·RACE cDNA 文库的构建第32-33页
     ·RACE 法扩增 PaIκBα 基因的 3’末端序列第33-34页
     ·RACE 法扩增 PaIκBα 基因的 5’末端序列第34页
     ·PaIκBα 基因全长序列的获得第34页
   ·结果与分析第34-38页
     ·香鱼总 RNA 提取及检测第34-35页
     ·核心片段克隆第35-36页
     ·3’-RACE 结果和 5’-RACE 结果第36-37页
     ·全长序列第37-38页
3 香鱼 PaIκBα 序列生物信息学分析第38-49页
   ·PaIκBα 同源性分析第38-41页
   ·香鱼 PaIκBα 一级结构分析第41页
   ·香鱼 PaIκBα 二级结构分析第41-42页
   ·香鱼 PaIκBα 三级结构分析第42-43页
   ·PaIκBα 跨膜结构分析第43-44页
   ·PaIκBα 结构域分析第44页
   ·PaIκBα 亚细胞定位分析第44页
   ·PaIκBα 信号肽预测分析第44-45页
   ·PaIκBα 磷酸化位点预测第45页
   ·香鱼 PaIκBα 系统进化树建立第45-47页
   ·讨论第47-49页
4 半定量技术检测 PaIκBα 基因的表达模式第49-61页
   ·实验材料第49页
     ·实验动物第49页
     ·实验所用菌种等材料第49页
   ·实验方法第49-52页
     ·香鱼各组织解剖及总 RNA 提取第49页
     ·半定量技术分析 PaIκBα 的组织表达差异第49-51页
     ·病原刺激实验第51页
     ·脂多糖刺激试验第51-52页
     ·氯化钠刺激试验第52页
     ·黄芪多糖试验第52页
     ·半定量检测 PaIκBα 在香鱼肝脏的表达模式分析第52页
   ·实验结果第52-61页
     ·总 RNA 提取及检测第52页
     ·香鱼 PaIκBα 基因 mRNA 的组织表达特征第52-53页
     ·不同处理对香鱼 PaIκBα 基因的表达模式分析第53-57页
     ·讨论第57-61页
5 结论第61-64页
   ·香鱼核转录抑制因子 PaIκBα 的序列克隆第61页
   ·半定量检测 PaIκBα 的表达模式第61-62页
   ·半定量 RT-PCR 与荧光定量 PCR第62-64页
参考文献第64-77页
在学研究成果第77-79页
致谢第79页

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