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脑心肌炎病毒LAMP及Real-time PCR检测方法的建立及初步应用

摘要第1-8页
Abstract第8-10页
缩略词英文对照表第10-18页
第一部分:文献综述第18-32页
 1 脑心肌炎病毒(EMCV)概述第18-23页
   ·EMCV的病原学第18-19页
   ·EMCV的基因组结构第19-21页
     ·病毒的蛋白结构及功能第19-21页
       ·结构蛋白及其功能第19-20页
       ·非结构蛋白及其功能第20-21页
   ·EMCV的流行情况第21页
   ·EMCV的诊断技术第21-23页
     ·EMCV 血清学检测第22页
     ·EMCV病原学检测第22-23页
 2 环介导等温扩增技术(LAMP技术)第23-27页
   ·LAMP原理及特点第23-26页
     ·LAMP引物的设计第23-24页
     ·LAMP反应原理第24-25页
     ·LAMP反应特点第25-26页
   ·LAMP技术的应用第26-27页
     ·LAMP技术在病毒诊断中的应用第27页
     ·LAMP技术在细菌诊断中的应用第27页
     ·LAMP技术在寄生虫检测中的应用第27页
 3 实时荧光定量PCR技术(Real-time PCR技术)第27-30页
   ·Real-time PCR技术的原理及特点第28-29页
     ·Real-time PCR技术的反应原理第28页
     ·Real-time PCR的种类第28-29页
   ·Real-time PCR的应用第29-30页
     ·Real-time PCR在基因工程研究领域的应用第29页
     ·Real-time PCR在医学研究领域的应用第29页
     ·其他领域第29-30页
 4 本论文研究的目的及意义第30-32页
第二部分:试验研究第32-67页
 第一章 EMCV LAMP方法的建立第32-38页
  1 材料及仪器设备第32-33页
   ·主要材料第32页
   ·主要试剂第32页
   ·主要仪器设备第32-33页
  2 试验步骤及方法第33-35页
   ·病毒总RNA提取第33页
   ·逆转录第33-34页
   ·LAMP引物设计及合成第34页
   ·EMCV LAMP扩增反应第34-35页
   ·EMCV LAMP扩增方法的最佳引物筛选第35页
  3 试验结果第35-37页
   ·EMCV LAMP引物的设计结果第35页
   ·引物合成及配制第35页
   ·EMCV LAMP扩增反应结果第35-36页
   ·最佳引物筛选结果第36-37页
  4 小结与分析第37-38页
 第二章 EMCV LAMP法条件优化、质控及应用第38-47页
  1 材料及仪器设备第38-39页
   ·主要材料第38页
   ·主要试剂第38页
   ·主要仪器设备第38-39页
  2 试验步骤及方法第39-41页
   ·EMCV LAMP反应体系的条件优化第39-40页
     ·EMCV LAMP反应体系中Tm值的优化第39页
     ·EMCV LAMP反应体系中最佳外引物用量的优化第39页
     ·EMCV LAMP反应体系中最佳内引物用量的优化第39页
     ·EMCV LAMP反应体系中最佳反应时间的优化第39-40页
   ·EMCV LAMP方法的特异性检测第40页
   ·EMCV LAMP方法的灵敏性检测第40页
   ·EMCV LAMP方法的重复性检测第40-41页
   ·EMCV LAMP法对田间样品的检测第41页
  3 试验结果第41-45页
   ·EMCV LAMP反应体系优化结果第41-43页
     ·EMCV LAMP反应最佳Tm值的确定第41页
     ·EMCV LAMP反应最佳内外引物用量的确定第41-42页
     ·EMCV LAMP反应最佳反应时间的确定第42-43页
   ·EMCV LAMP法的特异性验证结果第43-44页
   ·EMCV LAMP法的灵敏性验证结果第44页
   ·EMCV LAMP法的重复性验证结果第44-45页
   ·田间样本检测结果第45页
  4 小结与分析第45-47页
 第三章 EMCV Real-time PCR检测方法的建立第47-53页
  1 材料及仪器设备第47-48页
   ·主要材料第47页
   ·主要试剂第47页
   ·主要仪器设备第47-48页
  2 试验步骤及方法第48-50页
   ·病毒总RNA提取第48页
   ·逆转录第48-49页
   ·引物和探针的设计第49页
   ·引物和探针的合成第49页
   ·EMCV Real-time PCR扩增反应第49-50页
   ·引物及探针的最佳组合优选第50页
  3 试验结果第50-51页
   ·引物与探针的设计结果第50页
   ·引物与探针的合成及使用第50页
   ·EMCV Real-time PCR扩增结果第50-51页
   ·引物及探针组合筛选结果第51页
  4 小结与分析第51-53页
 第四章 EMCV Real-time PCR法条件优化、质控及应用第53-67页
  1 材料及仪器设备第53-54页
   ·主要材料第53页
   ·主要试剂第53-54页
   ·主要仪器设备第54页
  2 试验步骤及方法第54-59页
   ·EMCV Real-time PCR法反应体系的优化第54-55页
     ·引物最佳使用浓度的优化第54-55页
     ·探针最佳使用浓度的优化第55页
     ·最佳Tm值的优化第55页
   ·标准曲线的绘制第55-58页
     ·质粒标准品的制备第55-58页
       ·病毒总RNA提取第56页
       ·逆转录第56页
       ·PCIU广土曾第56页
       ·目的基因PCR产物的纯化与回收第56-57页
       ·目的基因与pMD-18T载体的连接第57页
       ·连接物的转化、单克隆第57页
       ·质粒DNA的提取第57-58页
       ·序列测定第58页
       ·重组质粒浓度的测定第58页
     ·标准曲线的绘制第58页
   ·EMCV Real-time PCR法的特异性验证第58页
   ·EMCV Real-time PCR法的灵敏性验证第58页
   ·EMCV Real-time PCR法的可重复性第58页
   ·结果判定标准第58-59页
   ·EMCV Real-time PCR法对田间样品的检测第59页
  3 试验结果第59-66页
   ·最佳引物使用浓度筛选结果第59-60页
   ·探针最佳使用浓度筛选第60页
   ·Tm值优化结果第60-61页
   ·标准曲线的绘制结果第61-64页
     ·PCR产物扩增与纯化、回收结果第61-62页
     ·质粒DNA的提取第62页
     ·序列测定结果第62-63页
     ·质粒浓度的测定及拷贝数计算第63页
     ·标准曲线的绘制第63-64页
   ·EMCV Real-time PCR法的特异性第64页
   ·EMCV Real-time PCR法的灵敏性第64-65页
   ·EMCV Real-time PCR法的可重复性第65页
   ·田间样本检测结果第65-66页
  4 小结与分析第66-67页
第三部分:结论第67-69页
   ·EMCV LAMP检测方法的建立第67页
   ·EMCV LAMP法条件优化、质控及应用第67页
   ·EMCV Real-time PCR检测方法的建立第67页
   ·EMCV Real-time PCR法条件优化、质控及应用第67-69页
参考文献第69-75页
致谢第75-76页
作者简介第76页
硕士期间已发表论文第76页
硕士期间参与的课题研究第76页

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