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两个稻瘟菌温度敏感型突变体的数字基因表达谱分析及相关基因敲除

致谢第1-8页
摘要第8-10页
Abstract第10-11页
目录第11-13页
第一章 文献综述第13-34页
 1 稻瘟病与稻瘟病菌第13-20页
   ·稻瘟菌病原生物学第13-14页
   ·稻瘟病菌的生理分化第14-15页
     ·生理小种第14-15页
     ·变异机制第15页
   ·稻瘟病的病害循环第15-20页
     ·病原菌的越冬第16页
     ·病原菌的传播第16页
     ·病原菌侵入过程第16-19页
     ·病原菌的发病第19-20页
     ·病原菌的产孢与再侵染第20页
 2 转录表达谱学的研究第20-28页
   ·转录表达谱的研究方法第20-21页
   ·基因表达系列分析(SAGE)第21-28页
     ·SAGE技术的原理第21-23页
     ·SAGE技术的优点第23-24页
     ·SAGE技术的缺点及改进第24-25页
     ·SAGE技术的应用第25-27页
     ·SAGE技术的展望第27-28页
 3 数字基因表达谱测序第28-34页
   ·高通量Illumina测序简介第28-29页
   ·数字基因表达谱测流程第29-34页
第二章 两个稻瘟菌温度敏感型突变体的数字基因表达分析(DEG)第34-58页
 1 材料与方法第34-42页
   ·试验菌株第34-35页
   ·培养基第35-36页
   ·试验试剂与仪器第36-37页
   ·常规分子生物学实验方法第37-39页
   ·突变体形态学观察方法第39-40页
     ·菌落形态观察和生长速度测定第39页
     ·致病性测定(大麦叶片)第39页
     ·菌落T-146孢子萌发和附着胞形成观察第39-40页
   ·测序要求与内容第40页
   ·测序菌株材料准备与送样测序第40-41页
   ·测序结果分析方法第41-42页
 2 结果与分析第42-57页
   ·突变体菌落形态和生长速度测定结果第42页
   ·突变体致病性测定结果(大麦叶片)第42-43页
   ·突变体菌落T-146孢子萌发和附着胞形成观察结果第43-44页
   ·数字基因表达谱测序结果分析第44-48页
   ·数字基因表达差异结果第48-49页
   ·T-146数字基因表达谱标签数据库结果分析第49-51页
   ·Guy-11、T-146和T-154的表达谱对比分析第51-52页
   ·数字基因表达差异基因的功能分析第52-53页
   ·qRT-PCR验证结果与分析第53-57页
 3 讨论与总结第57-58页
第三章 基于DEG分析结果的稻瘟菌相关基因敲除第58-74页
 1 实验材料第58-60页
   ·实验菌株第58页
   ·实验试剂与仪器第58-59页
   ·培养基配制第59-60页
 2 实验方法第60-72页
   ·MGG_01722,MGG_07200基因的确定与序列获得第60-61页
   ·敲除载体构建策略第61-68页
     ·融合引物设计第62页
     ·融合PCR第62-65页
     ·DNA相关操作第65-68页
   ·转化第68-71页
     ·大肠杆菌转化第68-70页
     ·农杆菌冻融法转化第70页
     ·稻瘟菌T-DNA转化第70-71页
   ·小量法提取稻瘟菌基因组DNA第71-72页
 3 结果第72-74页
   ·转化子获得第72页
   ·致病性测定(大麦叶片)第72-74页
第四章 讨论与总结第74-76页
参考文献第76-86页
附录 基因第86-109页

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