致谢 | 第1-8页 |
摘要 | 第8-10页 |
Abstract | 第10-11页 |
目录 | 第11-13页 |
第一章 文献综述 | 第13-34页 |
1 稻瘟病与稻瘟病菌 | 第13-20页 |
·稻瘟菌病原生物学 | 第13-14页 |
·稻瘟病菌的生理分化 | 第14-15页 |
·生理小种 | 第14-15页 |
·变异机制 | 第15页 |
·稻瘟病的病害循环 | 第15-20页 |
·病原菌的越冬 | 第16页 |
·病原菌的传播 | 第16页 |
·病原菌侵入过程 | 第16-19页 |
·病原菌的发病 | 第19-20页 |
·病原菌的产孢与再侵染 | 第20页 |
2 转录表达谱学的研究 | 第20-28页 |
·转录表达谱的研究方法 | 第20-21页 |
·基因表达系列分析(SAGE) | 第21-28页 |
·SAGE技术的原理 | 第21-23页 |
·SAGE技术的优点 | 第23-24页 |
·SAGE技术的缺点及改进 | 第24-25页 |
·SAGE技术的应用 | 第25-27页 |
·SAGE技术的展望 | 第27-28页 |
3 数字基因表达谱测序 | 第28-34页 |
·高通量Illumina测序简介 | 第28-29页 |
·数字基因表达谱测流程 | 第29-34页 |
第二章 两个稻瘟菌温度敏感型突变体的数字基因表达分析(DEG) | 第34-58页 |
1 材料与方法 | 第34-42页 |
·试验菌株 | 第34-35页 |
·培养基 | 第35-36页 |
·试验试剂与仪器 | 第36-37页 |
·常规分子生物学实验方法 | 第37-39页 |
·突变体形态学观察方法 | 第39-40页 |
·菌落形态观察和生长速度测定 | 第39页 |
·致病性测定(大麦叶片) | 第39页 |
·菌落T-146孢子萌发和附着胞形成观察 | 第39-40页 |
·测序要求与内容 | 第40页 |
·测序菌株材料准备与送样测序 | 第40-41页 |
·测序结果分析方法 | 第41-42页 |
2 结果与分析 | 第42-57页 |
·突变体菌落形态和生长速度测定结果 | 第42页 |
·突变体致病性测定结果(大麦叶片) | 第42-43页 |
·突变体菌落T-146孢子萌发和附着胞形成观察结果 | 第43-44页 |
·数字基因表达谱测序结果分析 | 第44-48页 |
·数字基因表达差异结果 | 第48-49页 |
·T-146数字基因表达谱标签数据库结果分析 | 第49-51页 |
·Guy-11、T-146和T-154的表达谱对比分析 | 第51-52页 |
·数字基因表达差异基因的功能分析 | 第52-53页 |
·qRT-PCR验证结果与分析 | 第53-57页 |
3 讨论与总结 | 第57-58页 |
第三章 基于DEG分析结果的稻瘟菌相关基因敲除 | 第58-74页 |
1 实验材料 | 第58-60页 |
·实验菌株 | 第58页 |
·实验试剂与仪器 | 第58-59页 |
·培养基配制 | 第59-60页 |
2 实验方法 | 第60-72页 |
·MGG_01722,MGG_07200基因的确定与序列获得 | 第60-61页 |
·敲除载体构建策略 | 第61-68页 |
·融合引物设计 | 第62页 |
·融合PCR | 第62-65页 |
·DNA相关操作 | 第65-68页 |
·转化 | 第68-71页 |
·大肠杆菌转化 | 第68-70页 |
·农杆菌冻融法转化 | 第70页 |
·稻瘟菌T-DNA转化 | 第70-71页 |
·小量法提取稻瘟菌基因组DNA | 第71-72页 |
3 结果 | 第72-74页 |
·转化子获得 | 第72页 |
·致病性测定(大麦叶片) | 第72-74页 |
第四章 讨论与总结 | 第74-76页 |
参考文献 | 第76-86页 |
附录 基因 | 第86-109页 |