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玉米全基因组NBS类抗病基因的进化及病原菌诱导表达模式分析

摘要第1-5页
Abstract第5-8页
目录第8-12页
引言第12-13页
第一章 文献综述第13-36页
   ·植物抗病基因的分子机制和进化第13-18页
     ·植物抗病性的表现第13页
     ·R 基因抗病的作用机理——基因对基因假说第13-15页
       ·与病原菌非亲和因子有关的抗病机制(Avr/R 模式)第14页
       ·与病原菌亲和因子有关的抗病机制(Vir/r 模式)第14-15页
     ·抗病基因特异性进化第15-18页
       ·R 基因在基因组中的分布和进化第15-16页
       ·植物抗病专化性的分子机制第16页
       ·复制、重组和进化第16-17页
       ·转座子的重要作用第17-18页
   ·植物抗病基因的克隆与结构功能鉴定第18-25页
     ·植物抗病基因的分离克隆第18-21页
       ·转座子标签法第18页
       ·定位克隆法第18-19页
       ·同源序列克隆法第19页
       ·发展中的植物基因克隆新技术第19-21页
     ·抗病基因的结构与功能鉴定第21-22页
     ·NBS-LRR 类抗病蛋白的结构及功能第22-24页
       ·NBS 的结构和功能第23页
       ·LRR 的结构和功能第23页
       ·CC 的结构和功能第23-24页
       ·TIR 的结构和功能第24页
     ·R 基因克隆的应用前景第24-25页
   ·植物抗病基因的表达模式及其分析技术第25-28页
     ·植物抗病基因的表达第25-27页
       ·抗病基因信号传导机制第25页
       ·水杨酸诱导的抗病基因表达第25-27页
     ·抗病基因表达的分析技术第27-28页
   ·生物信息学在植物抗性基因研究中的应用第28-32页
     ·生物信息学研究内容第28-29页
     ·生物信息学数据库服务系统及软件应用第29-32页
       ·数据库服务系统第29-31页
       ·生物信息学常用序列分析软件第31-32页
   ·玉米抗病基因的研究第32-35页
     ·玉米病虫害的危害与防治第32-33页
     ·玉米常见的几种病害第33-34页
     ·玉米抗病基因研究第34-35页
   ·本课题研究的技术路线第35-36页
第二章 玉米全基因组 NBS 类基因的进化分析第36-53页
   ·材料与方法第36-38页
     ·数据库和基因序列来源第36-37页
     ·方法第37-38页
       ·NBS 类型同源基因的获得第37页
       ·NBS 类型抗病基因的分类第37页
       ·NBS 类型抗病基因系统进化分析第37页
       ·NBS 类型基因在染色体上的物理定位第37-38页
       ·NBS 类型基因的基序分析第38页
   ·结果与分析第38-51页
     ·NBS 类型基因的确定和分类第38-42页
     ·NBS 类基因的染色体定位和基因簇分析第42-43页
     ·序列比对和进化分析第43-49页
     ·保守基序分析第49-51页
   ·讨论第51-53页
第三章 玉米与其它植物 NBS 类基因比较与进化分析第53-68页
   ·材料与方法第53-54页
     ·数据库和基因序列来源第53页
     ·方法第53-54页
       ·其他四种植物 NBS 类同源基因的数量和类型第53页
       ·玉米、拟南芥和水稻等 NBS 基因染色体定位及基因复制第53-54页
       ·玉米与其它植物 NBS 类基因进化关系比较第54页
   ·结果与分析第54-66页
     ·NBS 类基因的数量与类型的差异分析第54-55页
     ·玉米、拟南芥和水稻和百脉根等染色体位置及基因复制比较分析第55-59页
     ·玉米与拟南芥的 NBS 类基因亲缘进化关系比较第59-61页
     ·玉米与百脉根的 NBS 类基因亲缘进化关系比较第61页
     ·玉米与高粱的 NBS 类基因亲缘进化关系比较第61-63页
     ·玉米 NBS 类抗病基因与已克隆 NBS 基因的亲缘关系分析第63-66页
   ·讨论第66-68页
第四章 玉米 NBS 类抗病基因病原菌诱导表达分析第68-84页
   ·材料与方法第68-74页
     ·实验材料第68-69页
       ·玉米品种第68页
       ·病原菌第68页
       ·酶及试剂第68页
       ·引物合成第68页
       ·仪器设备第68-69页
     ·实验方法第69-74页
       ·小斑病病原菌诱导处理第69页
       ·矮花叶病毒诱导处理第69-70页
       ·病原菌诱导NBS类基因RT-PCR分析第70-73页
       ·玉米 NBS 基因的表达序列标签(EST)数据库分析第73-74页
   ·结果与分析第74-82页
     ·病原菌诱导效果分析第74页
     ·玉米总 RNA 提取及 cDNA 的合成效果分析第74-75页
     ·玉米NBS类型基因表达模式分析第75-82页
       ·小斑病病原菌诱导表达模式第75-78页
       ·矮花叶病毒诱导表达模式第78-80页
       ·玉米 NBS 基因的 EST 数据库表达谱分析第80-82页
   ·讨论第82-84页
第五章 玉米 NBS56 抗病基因的克隆第84-96页
   ·材料与方法第84-89页
     ·实验材料第84页
       ·植物材料第84页
       ·载体与菌株第84页
       ·主要试剂第84页
     ·实验方法第84-89页
       ·ZmNBS56B 基因的获取第84-88页
       ·克隆基因的生物信息学分析第88页
       ·ZmNBS56B 蛋白质结构分析第88-89页
   ·结果与分析第89-94页
     ·玉米总 RNA 提取第89页
     ·ZmNBS56B 基因的克隆第89-90页
     ·ZmNBS56B CDS 和氨基酸序列分析第90-91页
     ·ZmNBS56B 蛋白质结构预测第91-94页
       ·蛋白二级结构的分析第91页
       ·蛋白疏水性和亲水性分析第91-92页
       ·跨膜结构分析第92-93页
       ·信号肽分析第93-94页
   ·讨论第94-96页
结论第96-98页
参考文献第98-109页
附录第109-112页
致谢第112-113页
作者简介第113-114页
攻读博士学位期间发表的论文第114页

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