| 摘要 | 第1-6页 |
| ABSTRACT | 第6-9页 |
| 縮略词 | 第9-10页 |
| 目录 | 第10-14页 |
| 1 绪论 | 第14-42页 |
| ·研究甘菊成花机理对于菊花花期改良的重要意义 | 第14-15页 |
| ·高等植物成花机理的研究进展 | 第15-17页 |
| ·高等植物成花的重要性 | 第15页 |
| ·“成花”和“花发育”的问题 | 第15-16页 |
| ·对成花机理进行研究的理论和实际意义 | 第16页 |
| ·早期高等植物成花机理研究的内容和成果 | 第16-17页 |
| ·存在的问题 | 第17页 |
| ·高等植物成花途径的分子调控机理 | 第17-23页 |
| ·光周期途径 | 第17-20页 |
| ·春化途径 | 第20-21页 |
| ·GA途径 | 第21-22页 |
| ·自主途径 | 第22-23页 |
| ·高等植物成花相关基因LFY和APl/FUL-like研究进展 | 第23-31页 |
| ·LFY基因在植物花发育及生殖器官形成中的作用 | 第24-28页 |
| ·APl/FUL-like基因研究进展 | 第28-31页 |
| ·高通量基因组学对解析高等植物成花机理中的重要性 | 第31-37页 |
| ·基因芯片和Tiling array在高等植物成花机理研究中的应用 | 第32-33页 |
| ·SAGE和MPSS在高等植物成花机理研究中的应用 | 第33-35页 |
| ·RNA-seq和DGE(Digital gene experssion)的原理及应用 | 第35页 |
| ·RNA-seq和DGE在转录组学研究中的优势 | 第35-37页 |
| ·甘菊成花机理研究亟需解决的问题 | 第37-41页 |
| ·研究目的 | 第39-40页 |
| ·拟解决的关键问题 | 第40页 |
| ·研究意义 | 第40-41页 |
| ·本项研究的技术路线 | 第41-42页 |
| 2 甘菊各个生长发育阶段转录组高通量测序 | 第42-64页 |
| ·材料与方法 | 第42-44页 |
| ·植物材料的处理及RNA提取 | 第42-43页 |
| ·转录组测序 | 第43-44页 |
| ·结果与分析 | 第44-59页 |
| ·序列组装及分析 | 第44-46页 |
| ·Unigene功能注释和编码蛋白框预测 | 第46-50页 |
| ·Unigene的GO分类 | 第50页 |
| ·甘菊转录组中发现的代谢途径 | 第50-51页 |
| ·甘菊转录组中转录因子的识别和分类 | 第51页 |
| ·甘菊转录组中与开花相关的基因 | 第51-59页 |
| ·讨论 | 第59-63页 |
| ·高通量测序技术在研究甘菊成花中的优势 | 第59页 |
| ·甘菊转录组数据的特点 | 第59-60页 |
| ·甘菊成花的遗传调控途径 | 第60页 |
| ·甘菊成花相关的重要基因 | 第60-62页 |
| ·LFY及APl/FUL-like基因的重要性 | 第62-63页 |
| ·本章小结 | 第63-64页 |
| 3 甘菊幼苗期和现蕾时数字芯片表达谱分析 | 第64-83页 |
| ·材料和方法 | 第64-66页 |
| ·植物材料与RNA提取 | 第64页 |
| ·文库构建和升级版DGE测序 | 第64页 |
| ·基因表达量统计 | 第64-65页 |
| ·差异表达基因筛选 | 第65-66页 |
| ·Gene Ontology功能显著性富集 | 第66页 |
| ·Pathway显著性富集 | 第66页 |
| ·结果 | 第66-76页 |
| ·甘菊幼苗期和现蕾时所处形态建成时期 | 第66-67页 |
| ·升级版DGE数据评估和基因覆盖度 | 第67-68页 |
| ·差异表达基因的GO功能显著性富集 | 第68-71页 |
| ·差异表达的基因所涉及的代谢途径 | 第71页 |
| ·转录因子的表达差异 | 第71-73页 |
| ·甘菊成花相关基因的表达差异 | 第73-75页 |
| ·甘菊中开花基因的表达模式验证 | 第75-76页 |
| ·讨论 | 第76-82页 |
| ·甘菊成花过程中多类生物学功能的基因发生了显著性变化 | 第76-77页 |
| ·淀粉、糖类等基础代谢在甘菊成花过程起着重要作用 | 第77页 |
| ·参与甘菊成花的转录因子家族 | 第77-80页 |
| ·甘菊成花的分子机理 | 第80-82页 |
| ·本章小结 | 第82-83页 |
| 4 甘菊DFL基因功能的研究 | 第83-115页 |
| ·材料和方法 | 第83-91页 |
| ·植物材料和生长环境 | 第83-84页 |
| ·菌株与质粒 | 第84页 |
| ·酶与各种生化试剂 | 第84页 |
| ·lfy突变体表型观察 | 第84页 |
| ·扫描电镜 | 第84-85页 |
| ·DFL基因序列氨基酸结构比对 | 第85页 |
| ·植物表达载体构建 | 第85-88页 |
| ·拟南芥中异源表达DFL基因 | 第88-89页 |
| ·亚细胞定位 | 第89-90页 |
| ·Quantitative real-time RT-PCR和R-PCR | 第90-91页 |
| ·结果 | 第91-110页 |
| ·拟南芥野生型和lfy突变体的花期 | 第91-92页 |
| ·拟南芥野生型和lfy突变体开花期及相关表型统计 | 第92-94页 |
| ·lfy突变位点特点 | 第94-95页 |
| ·lfy2中内源基因的表达模式 | 第95-96页 |
| ·植物融合蛋白表达载体的构建 | 第96-97页 |
| ·DFL N端和C端保守结构域氨基酸序列比对 | 第97-99页 |
| ·异源过表达DFL对拟南芥开花的影响 | 第99-101页 |
| ·使用LFY启动子异源表达DFL：EGFP对拟南芥表型的影响 | 第101-106页 |
| ·过表达DFL对拟南芥ldy突变体表型的影响 | 第106-108页 |
| ·DFL基因亚细胞定位 | 第108-110页 |
| ·讨论 | 第110-114页 |
| ·lfy突变体的分子机制 | 第110页 |
| ·DFL和LFY结构域内氨基酸序列比对 | 第110-111页 |
| ·DFL在细胞核内发挥作用 | 第111页 |
| ·DFL基因的功能 | 第111-112页 |
| ·异源表达DFL出现了共抑制现象 | 第112-113页 |
| ·DFL调控拟南芥成花转变的分子机制 | 第113-114页 |
| ·本章小结 | 第114-115页 |
| 5 甘菊DenFUL基因功能的研究 | 第115-138页 |
| ·材料和方法 | 第116-126页 |
| ·植物材料 | 第116-117页 |
| ·菌株与质粒(详见第四章) | 第117页 |
| ·酶与各种生化试剂(详见第四章) | 第117页 |
| ·引物 | 第117页 |
| ·甘菊RNA提取 | 第117-119页 |
| ·DenFUL基因序列分析 | 第119页 |
| ·RT-PCR分析DenFUL基因表达模式 | 第119-120页 |
| ·DenFUL在拟南芥叶肉细胞原生质体中的瞬时表达 | 第120-123页 |
| ·pDenFUL表达载体的构建和转化农杆菌感受态细胞 | 第123-124页 |
| ·拟南芥栽培及花浸法转基因 | 第124-125页 |
| ·DenFUL转基因拟南芥的鉴定 | 第125-126页 |
| ·Quantitative Real-Time PCR | 第126页 |
| ·结果 | 第126-135页 |
| ·甘菊DenFUL基因的生物信息学分析 | 第126-127页 |
| ·甘菊DenFUL基因结构和系统进化 | 第127-128页 |
| ·廿菊DenFUL基因的表达模式 | 第128-129页 |
| ·DenFUL亚细胞定位 | 第129-131页 |
| ·DenFUL转基因拟南芥的鉴定 | 第131页 |
| ·拟南芥中异位过表达DenFUL | 第131-134页 |
| ·过表达DenFUL对拟南芥内源开花基因表达的影响 | 第134-135页 |
| ·讨论 | 第135-137页 |
| ·DenFUL属于APl/SQUA亚家族euFUL进化系 | 第135页 |
| ·DenFUL基因的功能 | 第135-137页 |
| ·DenFUL基因在甘菊花发育中的作用 | 第137页 |
| ·本章小结 | 第137-138页 |
| 6 结论 | 第138-141页 |
| ·主要结果 | 第138-139页 |
| ·甘菊成花调控的基因网络 | 第139-140页 |
| ·本研究的创新点 | 第140-141页 |
| 7 展望 | 第141-142页 |
| 附录 | 第142-147页 |
| 参考文献 | 第147-170页 |
| 个人简介 | 第170-172页 |
| 在读期间发表和待发表论文目录 | 第172-174页 |
| 导师简介 | 第174-176页 |
| 致谢 | 第176-177页 |
