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MicorRNA调节胡杨抗逆性状的分子机制研究

摘要第1-6页
ABSTRACT第6-10页
1.引言第10-21页
     ·研究意义及材料介绍第10页
     ·MIRNA调控生物基因表达的研究现状第10-18页
       ·miRNA的产生和生理作用机理第10-12页
       ·miRNA在植物和动物中都具有广泛的生理功能第12-13页
       ·目前发现新的miRNA序列的方法第13-15页
       ·发现miRNA的新技术方法第15-17页
       ·预测miRNA靶基因的方法第17-18页
     ·研究内容、技术路线以及预期成果第18-21页
       ·研究内容第18-20页
       ·技术路线第20页
       ·预期成果第20-21页
2.胡杨microRNA的首次发现及靶基因预测分析第21-40页
     ·材料与方法第21-24页
       ·植物材料及脱水处理第21页
       ·总RNA的提取第21页
       ·小RNA的分离第21-22页
       ·cDNA文库构建和测序第22页
       ·Real-timePCR分析和克隆测序第22-23页
       ·发现胡杨miRNA的生物信息分析流程第23页
       ·胡杨中miRNA靶基因的预测第23页
       ·植物中miRNA408家族的进化树分析第23-24页
     ·试验结果第24-29页
       ·胡杨miRNA的克隆第24-25页
       ·胡杨和毛果杨中保守的miRNA第25-26页
       ·胡杨miRNA在脱水胁迫下的基因表达第26-28页
       ·胡杨的miRNA靶基因预测第28页
       ·植物miR408家族的进化分析第28-29页
     ·讨论第29-40页
       ·胡杨的新miRNA与了非生物胁迫调节的关系第29页
       ·胡杨受脱水胁迫诱导表达的miRNA与其它生物和非生物胁迫响应过程的联系第29页
       ·与毛果杨相比胡杨中的miRNA能够调控更多的抗逆相关基因第29-40页
3.全基因组范围内发现胡杨新MIRNA和干旱胁迫响应MIRNA第40-66页
     ·试验方法第40-43页
       ·材料处理第40-41页
       ·胡杨的小RNA和降解组高通量测序第41页
       ·小RNA测序数据分析第41页
       ·降解组测序数据分析第41-42页
       ·miRNA表达分析第42页
       ·miRNA的生物芯片表达谱分析第42-43页
     ·试验结果第43-57页
       ·干旱胁迫下胡杨的生理表现第43-44页
       ·胡杨的小RNA高通量测序第44-45页
       ·在胡杨与毛果杨保守的miRNA第45-47页
       ·胡杨中新的miRNA第47-49页
       ·降解组测序验证胡杨miRNA的靶基因第49-52页
       ·发现胡杨中的mirtron基因第52-54页
       ·干旱胁迫下miRNA以及miRNA家族的基因表达分析第54-57页
     ·讨论第57-66页
       ·胡杨已知保守miRNA和新miRNA可能具有不同的调节功能第57-58页
       ·胡杨的mirtron基因具有RNA蛋白结合序列第58页
       ·降解组测序对于胡杨miRNA靶基因的验证第58-66页
4.响应盐胁迫的胡杨MIRNA和靶基因第66-116页
     ·试验方法第66-68页
       ·材料处理第66页
       ·胡杨的小RNA和降解组高通量测序第66页
       ·小RNA测序数据分析第66-67页
       ·降解组测序数据分析第67页
       ·miRNA表达分析第67页
       ·盐胁迫下胡杨的转录组分析第67-68页
     ·试验结果第68-80页
       ·盐胁迫下胡杨的小RNA高通量测序第68-70页
       ·在胡杨中与毛果杨同源的miRNA第70-71页
       ·胡杨中新的miRNA第71-73页
       ·胡杨miRNA在盐胁迫处理下的表达分析第73-75页
       ·降解组测序验证盐处理下胡杨的miRNA靶基因第75-77页
       ·盐胁迫下胡杨的转录组研究第77-80页
     ·讨论第80-116页
       ·盐胁迫下胡杨的miRNA形成机制的复杂性第80页
       ·降解组测序对已知miRNA靶基因的验证第80-81页
       ·盐胁迫下表达变化趋势相反的胡杨miRNA和靶基因组合第81-82页
       ·盐胁迫下胡杨miRNA参与生长素信转导、光响应和生物节律控制调节第82-83页
       ·转录组测序对已知盐胁迫响应基因的验证第83-116页
5.结论与展望第116-119页
     ·结论第116-117页
     ·独创或新颖之处第117页
     ·展望第117-119页
参考文献第119-128页
个人简介第128-129页
导师简介第129-130页
致谢第130页

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