摘要 | 第1-6页 |
ABSTRACT | 第6-10页 |
1.引言 | 第10-21页 |
·研究意义及材料介绍 | 第10页 |
·MIRNA调控生物基因表达的研究现状 | 第10-18页 |
·miRNA的产生和生理作用机理 | 第10-12页 |
·miRNA在植物和动物中都具有广泛的生理功能 | 第12-13页 |
·目前发现新的miRNA序列的方法 | 第13-15页 |
·发现miRNA的新技术方法 | 第15-17页 |
·预测miRNA靶基因的方法 | 第17-18页 |
·研究内容、技术路线以及预期成果 | 第18-21页 |
·研究内容 | 第18-20页 |
·技术路线 | 第20页 |
·预期成果 | 第20-21页 |
2.胡杨microRNA的首次发现及靶基因预测分析 | 第21-40页 |
·材料与方法 | 第21-24页 |
·植物材料及脱水处理 | 第21页 |
·总RNA的提取 | 第21页 |
·小RNA的分离 | 第21-22页 |
·cDNA文库构建和测序 | 第22页 |
·Real-timePCR分析和克隆测序 | 第22-23页 |
·发现胡杨miRNA的生物信息分析流程 | 第23页 |
·胡杨中miRNA靶基因的预测 | 第23页 |
·植物中miRNA408家族的进化树分析 | 第23-24页 |
·试验结果 | 第24-29页 |
·胡杨miRNA的克隆 | 第24-25页 |
·胡杨和毛果杨中保守的miRNA | 第25-26页 |
·胡杨miRNA在脱水胁迫下的基因表达 | 第26-28页 |
·胡杨的miRNA靶基因预测 | 第28页 |
·植物miR408家族的进化分析 | 第28-29页 |
·讨论 | 第29-40页 |
·胡杨的新miRNA与了非生物胁迫调节的关系 | 第29页 |
·胡杨受脱水胁迫诱导表达的miRNA与其它生物和非生物胁迫响应过程的联系 | 第29页 |
·与毛果杨相比胡杨中的miRNA能够调控更多的抗逆相关基因 | 第29-40页 |
3.全基因组范围内发现胡杨新MIRNA和干旱胁迫响应MIRNA | 第40-66页 |
·试验方法 | 第40-43页 |
·材料处理 | 第40-41页 |
·胡杨的小RNA和降解组高通量测序 | 第41页 |
·小RNA测序数据分析 | 第41页 |
·降解组测序数据分析 | 第41-42页 |
·miRNA表达分析 | 第42页 |
·miRNA的生物芯片表达谱分析 | 第42-43页 |
·试验结果 | 第43-57页 |
·干旱胁迫下胡杨的生理表现 | 第43-44页 |
·胡杨的小RNA高通量测序 | 第44-45页 |
·在胡杨与毛果杨保守的miRNA | 第45-47页 |
·胡杨中新的miRNA | 第47-49页 |
·降解组测序验证胡杨miRNA的靶基因 | 第49-52页 |
·发现胡杨中的mirtron基因 | 第52-54页 |
·干旱胁迫下miRNA以及miRNA家族的基因表达分析 | 第54-57页 |
·讨论 | 第57-66页 |
·胡杨已知保守miRNA和新miRNA可能具有不同的调节功能 | 第57-58页 |
·胡杨的mirtron基因具有RNA蛋白结合序列 | 第58页 |
·降解组测序对于胡杨miRNA靶基因的验证 | 第58-66页 |
4.响应盐胁迫的胡杨MIRNA和靶基因 | 第66-116页 |
·试验方法 | 第66-68页 |
·材料处理 | 第66页 |
·胡杨的小RNA和降解组高通量测序 | 第66页 |
·小RNA测序数据分析 | 第66-67页 |
·降解组测序数据分析 | 第67页 |
·miRNA表达分析 | 第67页 |
·盐胁迫下胡杨的转录组分析 | 第67-68页 |
·试验结果 | 第68-80页 |
·盐胁迫下胡杨的小RNA高通量测序 | 第68-70页 |
·在胡杨中与毛果杨同源的miRNA | 第70-71页 |
·胡杨中新的miRNA | 第71-73页 |
·胡杨miRNA在盐胁迫处理下的表达分析 | 第73-75页 |
·降解组测序验证盐处理下胡杨的miRNA靶基因 | 第75-77页 |
·盐胁迫下胡杨的转录组研究 | 第77-80页 |
·讨论 | 第80-116页 |
·盐胁迫下胡杨的miRNA形成机制的复杂性 | 第80页 |
·降解组测序对已知miRNA靶基因的验证 | 第80-81页 |
·盐胁迫下表达变化趋势相反的胡杨miRNA和靶基因组合 | 第81-82页 |
·盐胁迫下胡杨miRNA参与生长素信转导、光响应和生物节律控制调节 | 第82-83页 |
·转录组测序对已知盐胁迫响应基因的验证 | 第83-116页 |
5.结论与展望 | 第116-119页 |
·结论 | 第116-117页 |
·独创或新颖之处 | 第117页 |
·展望 | 第117-119页 |
参考文献 | 第119-128页 |
个人简介 | 第128-129页 |
导师简介 | 第129-130页 |
致谢 | 第130页 |