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柑橘类病毒的鉴定及其小RNA的深度测序分析研究

中文摘要第1-12页
Abstract第12-16页
第一章 文献综述第16-60页
 第一节 类病毒的研究进展第16-36页
     ·类病毒的结构和分类第16-22页
     ·类病毒的复制和移动第22-26页
     ·寄主范围、寄主特异性和寄主防卫第26-29页
     ·类病毒的致病性第29-32页
     ·类病毒之间的互作第32-36页
 第二节 柑橘类病毒研究进展第36-60页
     ·柑橘裂皮类病毒的发现第36页
     ·其他种类柑橘类病毒的鉴定第36-37页
     ·柑橘类病毒的分类第37-38页
     ·柑橘类病毒对产业经济的影响及其症状学第38-42页
     ·柑橘类病毒的寄主范围第42页
     ·柑橘类病毒的传播第42-43页
     ·柑橘类病毒的地理分布和流行学第43-44页
     ·柑橘类病毒的检测第44-47页
     ·柑橘类病毒病害的控制第47-49页
     ·七种柑橘类病毒各自的特征第49-60页
第二章 前言第60-62页
第三章 中国柑橘类病毒的生物学鉴定和分子鉴定第62-90页
   ·材料与方法第63-72页
   ·结果与分析第72-86页
     ·指示植物鉴定结果第72-73页
     ·中国七种柑橘类病毒的分子鉴定第73-77页
     ·柑橘类病毒复合侵染对香橼的影响第77-78页
     ·中国四种不常见的柑橘类病毒的序列比对和进化树分析第78-86页
   ·讨论第86-90页
第四章 巴基斯坦四种常见柑橘类病毒的分子鉴定与序列分析第90-104页
   ·材料与方法第90页
   ·结果与分析第90-104页
     ·巴基斯坦四种常见的柑橘类病毒的RT-PCR检测第91-93页
     ·巴基斯坦四种常见柑橘类病毒的序列分析第93-101页
     ·讨论第101-104页
第五章 柑橘类病毒V的生物学鉴定和分子鉴定第104-116页
   ·材料与方法第104-105页
   ·结果与分析第105-112页
     ·柑橘类病毒V的分子鉴定第105-106页
     ·柑橘类病毒V的生物学鉴定第106-108页
     ·柑橘类病毒V的遗传多样性分析第108-109页
     ·柑橘类病毒V的进化树分析第109-111页
     ·柑橘类病毒V的二级结构分析第111-112页
   ·讨论第112-116页
第六章 柑橘类病毒小RNA的深度测序分析第116-160页
   ·材料与方法第116-121页
   ·结果、分析与讨论第121-160页
     ·三份柑橘感染样品中柑橘类病毒的生物学检测第121-122页
     ·三份柑橘感染样品中柑橘类病毒的RT-PCR检测第122-123页
     ·三份柑橘感染样品中柑橘类病毒的全长序列分析第123-136页
     ·柑橘裂皮病类病毒小RNA的Northern blot检测第136-137页
     ·深度测序所需样品总RNA质量监控第137-138页
     ·四份柑橘样品小RNA深度测序读数的总体分析第138-141页
     ·柑橘类病毒小RNA的正负比例第141-142页
     ·柑橘类病毒小RNA以21-nt和22-nt为主第142-144页
     ·柑橘类病毒小RNA的热点分布第144-152页
     ·类病毒侵染对香橼内源小RNA的影响第152-160页
第七章 对PFOR预测未知类病毒的验证第160-168页
   ·实验材料和方法第161页
   ·结果与分析第161-164页
   ·讨论第164-168页
第八章 主要结论、创新点及研究展望第168-172页
   ·主要结论第168-170页
   ·创新点第170-171页
   ·研究展望第171-172页
参考文献第172-196页
附录Ⅰ 缩略词第196-198页
附录Ⅱ 柑橘中英名和拉丁学名第198-200页
博士在读期间发表的论文及参加科研课题情况第200-204页
致谢第204-206页

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