| 摘要 | 第1-11页 |
| ABSTRACT | 第11-14页 |
| 缩略词表 | 第14-15页 |
| 第一部分 文献综述 | 第15-32页 |
| 第一章 棉纤维发育相关EST与基因研究进展 | 第15-23页 |
| 1.棉纤维发育EST研究 | 第15-19页 |
| ·EST基本概念 | 第15-16页 |
| ·EST的获取 | 第16页 |
| ·EST的应用 | 第16-18页 |
| ·构建遗传学图谱 | 第16-17页 |
| ·提供DNA芯片的基因资源 | 第17页 |
| ·发现和鉴定新基因 | 第17页 |
| ·基因差异表达的研究 | 第17页 |
| ·用于克隆新基因 | 第17-18页 |
| ·棉纤维发育相关EST研究进展 | 第18-19页 |
| 2.棉纤维发育相关基因研究 | 第19-23页 |
| 第二章 基因芯片技术研究进展 | 第23-31页 |
| 1.基因芯片技术的概念及原理 | 第23页 |
| 2.基因芯片技术的产生背景与发展 | 第23-25页 |
| ·基因芯片概念的提出与产生背景 | 第23-24页 |
| ·基因芯片技术的发展 | 第24页 |
| ·基因芯片技术在我国的发展 | 第24-25页 |
| 3.基因芯片的分类 | 第25页 |
| 4.基因芯片技术在作物研究中的应用 | 第25-28页 |
| ·基因组测序 | 第25页 |
| ·寻找新基因 | 第25-26页 |
| ·检测基因表达水平 | 第26-27页 |
| ·突变性和多态性检测 | 第27页 |
| ·后基因组学研究 | 第27页 |
| ·转基因农产品检测和植物检疫 | 第27-28页 |
| ·其他方面 | 第28页 |
| 5.基因芯片技术在棉花研究中应用与进展 | 第28-31页 |
| 本研究的目的和意义 | 第31-32页 |
| 第二部分 研究报告 | 第32-107页 |
| 第三章 棉纤维品质相关EST的鉴定与定位 | 第32-59页 |
| 1.材料与方法 | 第32-43页 |
| ·试验材料 | 第33页 |
| ·cDNA文库的构建 | 第33页 |
| ·cDNA芯片的制备与杂交 | 第33-35页 |
| ·芯片制备 | 第33-34页 |
| ·探针标记 | 第34页 |
| ·杂交与洗涤 | 第34页 |
| ·检测和数据分析 | 第34-35页 |
| ·ESTs的序列分析和功能分类 | 第35页 |
| ·RT-PCR验证 | 第35-39页 |
| ·RNA的提取 | 第35-38页 |
| ·总RNA的DNase Ⅰ消化 | 第38页 |
| ·cDNA第一链的合成 | 第38页 |
| ·RT-PCR | 第38-39页 |
| ·利用(7235×TM-1)重组自交系的基因定位及其与纤维品质性状的相关性分析 | 第39-41页 |
| ·DNA的提取 | 第39-41页 |
| ·纤维品质测定 | 第41页 |
| ·DNA分子标记试验及数据分析 | 第41页 |
| ·单标记分析 | 第41页 |
| ·利用[(TM-1×Hai7124)×TM-1]群体的基因定位 | 第41-43页 |
| ·染色体命名 | 第43页 |
| 2.结果和分析 | 第43-55页 |
| ·EST序列信息 | 第43页 |
| ·杂交表达谱与差异表达基因的功能预测 | 第43-44页 |
| ·基因芯片结果的RT-PCR验证 | 第44-49页 |
| ·利用(7235×TM-1)RIL的基因定位和纤维品质相关性分析 | 第49-51页 |
| ·利用[(TM-1×Hai 7124)×TM-1]群体的基因定位 | 第51-55页 |
| 3.讨论 | 第55-59页 |
| ·棉纤维发育表达谱研究材料的选择 | 第55页 |
| ·差异表达ESTs的功能特征 | 第55-56页 |
| ·棉花中的乙醇脱氢酶基因(ADH)与脂转移蛋白基因(LTP) | 第56-57页 |
| ·棉纤维品质发育相关基因的染色体分布特点 | 第57-59页 |
| 第四章 棉花GhGS基因的克隆和特征分析 | 第59-80页 |
| 1.材料与方法 | 第60-68页 |
| ·植物材料 | 第60页 |
| ·RNA的分离 | 第60页 |
| ·GhGS全长cDNA的获得和不同品种中GhGS基因的获得 | 第60-61页 |
| ·GhGS全长cDNA的获得 | 第60-61页 |
| ·不同品种中基因组GhGS序列的获得 | 第61页 |
| ·序列分析 | 第61-62页 |
| ·Southern杂交分析 | 第62-64页 |
| ·基因组DNA的酶切 | 第62页 |
| ·试剂及其配制 | 第62-63页 |
| ·Southern印迹 | 第63-64页 |
| ·DIG标记探针 | 第64页 |
| ·杂交 | 第64页 |
| ·洗膜与显色 | 第64页 |
| ·Northern杂交 | 第64-65页 |
| ·RNA甲醛琼脂糖凝胶变性电泳 | 第65页 |
| ·Northern转膜 | 第65页 |
| ·探针的制备与杂交 | 第65页 |
| ·GhGS的染色体定位及与纤维品质性状的相关性分析 | 第65-66页 |
| ·利用(7235×TM-1)重组自交系的基因定位及与纤维品质性状的相关性分析 | 第66页 |
| ·利用[(TM-1×Hai7124)×TM-1]群体的基因定位 | 第66页 |
| ·GS活性和总蛋白含量的测定 | 第66-68页 |
| ·GS活性的测定 | 第66-67页 |
| ·总蛋白含量的测定 | 第67-68页 |
| 2.结果与分析 | 第68-77页 |
| ·GhGS基因的转录表达 | 第68-69页 |
| ·GhGS基因的克隆和序列分析 | 第69-73页 |
| ·GhGS全长cDNA的获得和序列分析 | 第69-72页 |
| ·GhGS基因在陆地棉中的拷贝数分析和不同棉花品种GhGS基因的分离 | 第72-73页 |
| ·GhGS基因的染色体定位及与纤维品质性状的相关性分析 | 第73-75页 |
| ·GS活力和总蛋白含量的测定 | 第75-77页 |
| 3.讨论 | 第77-80页 |
| ·GS在种子形成中可能起重要作用 | 第77-78页 |
| ·纤维中的GS | 第78页 |
| ·四倍体棉花中GhGS基因的转录和调控 | 第78-80页 |
| 第五章 陆地棉GhXyl基因、GhLipase基因和六个小分子质量热激蛋白基因(HSP)的克隆和特征分析 | 第80-107页 |
| 1.材料与方法 | 第81-84页 |
| ·植物材料 | 第81页 |
| ·RNA的分离 | 第81-82页 |
| ·RT-PCR分析 | 第82页 |
| ·全长cDNA的获得及序列分析 | 第82-83页 |
| ·Southern杂交 | 第83页 |
| ·基因定位 | 第83-84页 |
| 2.结果与分析 | 第84-101页 |
| ·基因全长的克隆与序列分析 | 第84-93页 |
| ·GhXyl全长cDNA的克隆与序列分析 | 第84-88页 |
| ·GhLipase全长cDNA的克隆和序列分析 | 第88-92页 |
| ·六个小分子质量HSP基因序列分析 | 第92-93页 |
| ·RT-PCR分析 | 第93-96页 |
| ·GhXyl基因的转录表达 | 第93-94页 |
| ·GhLipase基因的转录表达 | 第94-95页 |
| ·六个小分子质量HSP基因的转录表达 | 第95-96页 |
| ·Southern杂交分析 | 第96-97页 |
| ·GhXyl基因在陆地棉中的拷贝数 | 第96页 |
| ·GhLipase基因在陆地棉中的拷贝数 | 第96-97页 |
| ·基因定位 | 第97-101页 |
| ·GhXyl基因的定位 | 第97-98页 |
| ·GhLipase基因的定位 | 第98-99页 |
| ·三个小分子质量HSP基因的定位 | 第99-101页 |
| 3.讨论 | 第101-107页 |
| ·GhXly基因在纤维发育过程中的可能功能 | 第101-102页 |
| ·GhLipase基因在纤维发育过程中的可能功能 | 第102-103页 |
| ·棉花小分子质量HSP的特征及其在纤维发育过程中的可能功能 | 第103-107页 |
| 全文结论 | 第107-109页 |
| 参考文献 | 第109-121页 |
| 附录 | 第121-123页 |
| 攻读博士学位期间发表论文 | 第123-125页 |
| 致谢 | 第125页 |
