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一株O型口蹄疫病毒分离株的全基因序列分析

中文摘要第1-9页
英文摘要第9-10页
1 引言第10-15页
   ·口蹄疫的流行及其危害第10页
   ·口蹄疫病毒(FMDV)第10-13页
     ·FMDV的生物学特性第10-11页
     ·FMDV基因组及其编码蛋白质的基本结构第11-12页
     ·FMDV的抗原性第12-13页
     ·FMDV的遗传变异第13页
   ·RACE—cDNA末端的快速扩增第13-14页
     ·3′RACE第14页
     ·5′RACE第14页
   ·本试验的目的和意义第14-15页
2 材料与方法第15-23页
   ·试验材料第15-16页
     ·病毒第15页
     ·菌种、质粒载体和细胞第15页
     ·酶类和主要试剂第15页
     ·仪器和设备第15-16页
   ·试验方法第16-23页
     ·引物设计与合成第16页
     ·常规RNA的提取及反转录第16-17页
     ·3′末端快速扩增法扩增FMDV 3′末端序列(3′RACE)第17页
     ·5′末端快速扩增法扩增FMDV 5′末端序列(5′RACE)第17-19页
     ·RT-PCR扩增目的基因第19-20页
     ·目的基因克隆及鉴定第20-23页
3 结果与分析第23-34页
   ·基因的扩增第23页
   ·pMD18-T-X的鉴定第23页
   ·HLJOC12/03毒株的核苷酸序列与其氨基酸序列第23-24页
   ·HLJOC12/03毒株各基因的序列分析第24-34页
     ·核苷酸序列比较第26页
     ·氨基酸序列比较第26-27页
     ·FMDV HLJOC12/03株核糖体进入位点(IRES)预测的二级结构图第27-28页
     ·FMDV HLJOC12/03株5′UTR预测的二级结构图第28-29页
     ·与参考毒株绘制L、VP1、3C系统进化树第29-30页
     ·VP1结构蛋白B细胞抗原表位的预测第30-31页
     ·5′ UTR的序列分析第31页
     ·L蛋白编码区的序列分析第31-32页
     ·P1序列分析第32页
     ·P2核苷酸序列及其编码的氨基酸序列分析第32-33页
     ·P3核苷酸序列及其编码的氨基酸序列分析第33页
     ·3′UTR的序列分析第33-34页
4 讨论第34-37页
   ·HLJOC12/03基因组序列比较第34页
   ·选择压力下,HLJOC12/03的变异特点第34页
   ·HLJOC12/03中IRES的特点第34-35页
   ·HLJOC12/03中VP1的抗原性第35页
   ·根据L、3C、VP1的核苷酸序列绘制系统发生树的暗示第35页
   ·3A在FMDV中的作用第35-36页
   ·本研究的难点和突破口第36-37页
5 结论第37-38页
致谢第38-39页
参考文献第39-45页
攻读硕士期间发表的学术论文第45页

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