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甜菜夜蛾与棉铃虫内源性piggyBac转座子的研究

目录第1-9页
中文摘要第9-12页
ABSTRACT第12-16页
第一章 文献综述第16-42页
 1 昆虫中的转座子第16-29页
   ·转座子的分类及其在昆虫中的分布第16-26页
     ·RNA转座子第22-24页
       ·长末端重复反转录转座子第22-23页
       ·非长末端重复反转录转座子第23页
       ·短散布因子第23-24页
     ·DNA转座子第24-26页
       ·剪切和粘贴的DNA转座子第24-25页
       ·袖珍反向重复转座子第25-26页
       ·滚圈式DNA转座子第26页
   ·昆虫转座子的进化第26-27页
   ·昆虫转座子的应用第27-29页
     ·昆虫的内源转座子和遗传转化第27-28页
     ·SINE插入位点的多样性作为遗传标记第28页
     ·SINE插入作为进化标记第28-29页
 2 用于转基因昆虫的转座子第29-40页
   ·P因子第29-31页
     ·P因子的结构第29-30页
     ·P因子的转座机制第30页
     ·P因子引起的杂种败育第30页
     ·P因子的种群生物学第30-31页
     ·P因子在转基因昆虫中的应用第31页
   ·hobo,(hAT)转座子家族第31-33页
     ·hobo,(hAT)转座子简介第31-32页
     ·hobo,(hAT)转座子在转基因昆虫中的应用第32-33页
   ·Minis第33页
     ·Minos简介第33页
     ·Minos在转基因昆虫中的应用第33页
   ·mariner第33-35页
     ·mariner简介第33-34页
     ·mariner在转基因昆虫中的应用第34-35页
   ·piggyBac第35-40页
     ·piggyBac的发现及其它TTAA转座子第35页
     ·piggyBac的结构特征和转座机制第35页
     ·piggyBac的转座活性调查第35-36页
     ·报告基因系统第36-37页
     ·piggyBac在转基因生物中的应用第37页
     ·piggyBac的分布第37-40页
 3 本研究的目的和意义第40-42页
第二章 甜菜夜蛾piggyBac类似因子的基因克隆与序列分析第42-60页
 1 材料与方法第44-52页
   ·实验材料第44-45页
     ·试虫第44-45页
     ·主要试剂第45页
     ·主要仪器第45页
   ·实验方法第45-52页
     ·基因组DNA的制备第45-46页
       ·试剂准备第45页
       ·基因组DNA的提取第45-46页
     ·环状DNA模板的制备第46-47页
       ·基因组DNA的消化第46页
       ·基因组DNA的环化第46-47页
     ·引物设计第47页
       ·克隆DNA片段用兼并引物第47页
       ·Inverse PCR引物第47页
     ·甜菜夜蛾piggyBac类似因子DNA片段的PCR扩增第47-48页
       ·PCR反应体系第47-48页
       ·PCR反应条件第48页
     ·甜菜夜蛾piggyBac类似因子全基因的Inverse PCR克隆第48-49页
       ·PCR反应体系第48页
       ·PCR反应程序第48-49页
     ·PCR产物回收与纯化第49页
     ·感受态大肠杆菌细胞的制备第49-50页
     ·连接反应及连接产物的转化第50-51页
       ·连接反应第50页
       ·转化第50-51页
       ·单克隆的挑选及扩大培养第51页
     ·转化产物检测第51页
       ·质粒酶切第51页
       ·PCR检测第51页
     ·序列测定第51-52页
 2 结果与分析第52-57页
   ·甜菜夜蛾piggyBac类似因子基因片段的克隆第52页
   ·与其它昆虫piggyBac类似因子的同源性分析第52-53页
   ·Inverse PCR获得的甜菜夜蛾piggyBac类似因子的DNA序列第53-57页
 3 讨论第57-60页
第三章 棉铃虫piggyBac类似因子基因的克隆与序列分析第60-87页
 1 材料与方法第61-70页
   ·验材料第61-62页
     ·试虫第61页
     ·主要试剂第61-62页
     ·主要仪器第62页
   ·实验方法第62-70页
     ·基因组DNA的提取第62页
     ·环状DNA模板的制备第62-63页
     ·棉铃虫piggyBac类似因子基因DNA片段的PCR扩增第63-64页
       ·引物设计第63页
       ·PCR反应体系第63-64页
       ·PCR反应条件第64页
     ·棉铃虫piggyBac类似因子HaPLE1全序列的PCR扩增第64-66页
       ·引物设计第64-65页
       ·PCR反应体系第65页
       ·PCR反应条件第65-66页
     ·Vectorret PCR克隆棉铃虫内源piggyBac类似因子在基因组上的旁侧序列第66-69页
       ·Vectorret PCR接头序列设计第66页
       ·Vectorret PCR模板制备第66-67页
       ·Vectorret PCR引物设计第67-68页
       ·Vectorret PCR反应体系第68页
       ·Vectorret PCR反应条件第68-69页
     ·棉铃虫piggyBac类似因子HaPLE2全序列的PCR扩增第69-70页
       ·Flanking PCR引物设计第69-70页
       ·PCR反应体系第70页
       ·PCR反应条件第70页
     ·PCR产物回收与纯化第70页
     ·连接反应及连接产物的转化第70页
     ·序列测定第70页
 2 结果与分析第70-78页
   ·棉铃虫piggyBac类似因子DNA片段的克隆第71页
   ·棉铃虫内源piggyBac类似因子HaPLE1的全序列第71-73页
   ·piggyBac类似因子的旁侧序列第73-75页
   ·棉铃虫piggyBac类似因子HaPLE2的全序列第75-76页
   ·棉铃虫两个piggyBac类似因子HaPLE1和HaPLE2的序列比较分析第76-77页
   ·棉铃虫piggyBac类似因子的ITR与其他昆虫piggyBac类似因子的ITR序列的比较第77-78页
   ·棉铃虫内源piggyBac类似因子HaPLE1与其它昆虫piggyBac类似因子的氨基酸序列比对第78页
 3 讨论第78-87页
第四章 HaPLE1和HaPLE2在棉铃虫不同地理品系中的分布第87-92页
 1 材料与方法第87-89页
   ·实验材料第87-88页
     ·供试棉铃虫第87-88页
     ·主要试剂第88页
     ·主要仪器第88页
   ·实验方法第88-89页
     ·基因组DNA的提取第88页
     ·引物设计第88-89页
     ·PCR反应体系第89页
     ·PCR反应条件第89页
     ·PCR产物回收与纯化第89页
     ·连接反应及连接产物的转化第89页
 2 结果与分析第89-90页
 3 讨论第90-92页
第五章 piggyBac转庄子基因的系统进化分析第92-97页
 1 材料与方法第92-94页
   ·piggyBac因子的氨基酸序列第93-94页
   ·piggyBac转座子系统进化树的构建第94页
 2 结果与分析第94-95页
 3 讨论第95-97页
第六章 棉铃虫piggyBac构建的载体在果蝇卵中的转座活性研究第97-109页
 1 材料与方法第98-105页
   ·实验材料第98-99页
     ·实验用载体第98页
     ·试虫第98页
     ·主要试剂第98页
     ·主要仪器第98-99页
   ·实验方法第99-105页
     ·载体构建第99-101页
       ·引物设计第99页
       ·PCR反应体系第99页
       ·PCR反应条件第99-100页
       ·PCR产物回收第100页
       ·酶切第100页
       ·回收第100-101页
       ·连接第101页
       ·回收第101页
       ·转化测序第101页
       ·无内毒素质粒的提取第101页
     ·果蝇卵的收集与处理第101-102页
     ·果蝇卵的转化第102页
     ·果蝇卵中质粒DNA的提取第102-103页
       ·试剂准备第102页
       ·质粒提取步骤第102-103页
     ·质粒的转化第103-104页
       ·质粒的酶切第103页
       ·电转化感受态细胞的制备第103-104页
       ·电击转化过程第104页
     ·质粒提取第104页
     ·测序第104-105页
 2 结果与分析第105-108页
   ·载体p3E1.2-CBW-1和p3E1.2-CBW-2的构建第105-106页
   ·载体p3E1.2-CBW-1的活性调查第106-107页
   ·发生了剪切的载体的序列分析第107-108页
 3 讨论第108-109页
全文总结第109-110页
参考文献第110-132页
附录:攻读学位期间发表的学术论文第132-134页
致谢第134页

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