基于CPU-GPU集群的分子动力学并行计算研究

摘要	第1-5页
Abstract	第5-9页
1 绪论	第9-17页
·分子动力学	第9-13页
·分子动力学简介	第9页
·势能函数	第9-11页
·系统运动方程	第11-12页
·分子搜索算法	第12-13页
·国内外研究现状	第13-15页
·本文主要研究内容	第15-17页
2 GPU与并行计算	第17-25页
·GPU简介	第17-19页
·GPU的发展	第17-18页
·CUDA技术	第18-19页
·GPU的并行计算原理	第19页
·并行计算	第19-25页
·并行算法设计	第19-21页
·并行任务分解算法	第21-23页
·MPI消息通信	第23-25页
3 集群架构与系统总体设计	第25-32页
·集群系统架构	第25-26页
·系统总体设计	第26-32页
4 CPU-GPU集群上的并行实现	第32-46页
·运行平台的搭建	第32-35页
·安装网络文件系统	第32页
·MPI并行编程环境的搭建	第32-35页
·CUDA安装	第35页
·系统初始化	第35-36页
·并行任务划分算法	第36-38页
·GPU上的并行计算	第38-46页
5 实验与结果分析	第46-54页
·单CPU与单GPU的性能比较	第46-49页
·单GPU与FPGA的性能比较	第49-50页
·CPU集群与CPU-GPU集群的性能比较	第50-54页
结论	第54-56页
参考文献	第56-59页
攻读硕士学位期间发表学术论文情况	第59-60页
致谢	第60-61页