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蛋白激酶TTK的动力学研究及其羧基末端D domain在其激酶活性中作用的研究

摘要第1-13页
ABSTRACT第13-17页
Chapter Ⅰ:Introduction第17-33页
     ·The TTK protein kinase family第17-21页
     ·The roles for Mps1第21-26页
       ·Mps1p in spindle pole duplication第21-22页
       ·Mps1 in the spindle assembly checkpoint第22-24页
       ·Mps1 corrects chromosome attachment errors第24-25页
       ·Other functions of Mps1 kinase第25-26页
     ·The SAC kinases Mps1 in cancer第26-28页
     ·Regulation of Mps1第28-33页
Chapter Ⅱ Cloning, expression and purification of recombinant proteins第33-50页
   ·Material and methods第34-40页
       ·Cell cultures第34页
     ·Chemicals and buffers第34-35页
       ·Mammalian expression constructs第35页
       ·Amplification of recombinant baculovirus encoding TTK-wt and TTK-d第35-36页
       ·Baculovirus expression of TTK-wt and TTK-d第36页
       ·Protein purification of TTK-wt and TTK-d第36-37页
       ·Western blot第37-38页
       ·3C protease expression and purification第38页
       ·Protein TTKA expression and purification第38-39页
       ·In vitro kinase assay第39-40页
   ·Results第40-48页
     ·Expression and purification of 3C protease第40-41页
     ·Expression and purification of TTKA第41-42页
     ·Purification of TTK-wt and TTK-d第42-43页
     ·Time course experiment of TTK kinase activity第43-44页
       ·Assay for different substrates phosphorylation by TTK第44-45页
       ·Comparison of kinase activity between TTK-wt and TTK-d第45-48页
   ·Discussion第48-50页
Chapter Ⅲ Measuring the absolute abundance of the crucial protein kinases duringcell cycle in Hela cells第50-77页
     ·Materials and methods第51-60页
       ·Materials and reagents第51-52页
       ·Cell lines第52-53页
       ·Cell density and viability estimations第53页
       ·Cell synchronization第53页
       ·Cell cycle analysis第53-54页
       ·Cell culture and nocodazole treatment第54-55页
       ·Cell lysis and sample preparation第55-56页
       ·Quantification of cellular concentrations of TTK and Cdks第56-57页
       ·Densitometry using ImageJ第57-58页
       ·Data analysis and calculations for Coomassie-stained gels using Microsoft Excel第58-59页
       ·Data analysis and calculations for immunoblot data using Microsoft Excel第59-60页
   ·Results第60-71页
       ·The TTK level in Hela cells and sw480 cells第60-61页
       ·Analysis for cell cycle status by flow cytometry(FACScan)第61-63页
       ·Measuring GST-TTK protein standard concentration第63-64页
       ·Measuring GST-Cdk and CyclinB protein standards concentration第64-66页
       ·Determine cellular abundance of Mps1,Cdk1 and Cyclin B第66-68页
       ·Data analysis第68-71页
   ·Discussion第71-77页
       ·A method for accurately quantifying the absolute number of biological molecules第71-73页
       ·Cell cycle-dependent regulation of the steady state level of TTK in vivo第73-74页
       ·Accumulation of Mps1 at centrosomes is essential for centrosome duplication第74-75页
       ·Mitosis might require a higher threshold of TTK than centrosome duplication第75页
       ·Cdk attenuates degradation of the TTK at centrosome duplication第75-77页
 Chapter Ⅳ Kinetic study of TTK and the modulation of its kinase activity by thecarboxyl terminal tail第77-114页
     ·Materials and Method第78-87页
       ·Autokinase assay第78-79页
       ·In vitro kinase assays第79-80页
       ·Quantitating gels using Molecular dynamics densitometer and Image quant 5.0第80-81页
       ·Which one is suitable substrate for kinetics studies?第81页
       ·Is product formation linear with time?第81-82页
       ·Does autophosphorylation increase transphosphorylation?第82页
       ·Is autophosphorylation of TTK intermolecular or intramolecular action?第82-83页
       ·How the reaction rate varied with enzyme concentration第83-84页
       ·Is there a product inhibition?第84页
       ·Is D domain of TTK responsible for its kinase activity?第84页
       ·Two-substrate kinetic analysis for TTK catalytic mechanism第84-86页
       ·What is role of D domain in TTK transphophorylation?第86页
       ·Substrate Analog Inhibitors Inhibition Analysis第86-87页
     ·Results第87-109页
       ·Suitable substrate for kinetics study第87-88页
       ·A Lag-phase in TTK Product Formation第88-89页
       ·Autophosphorylation enhances transphophorylation第89-91页
       ·Autophosphorylation is an intermolecular reaction第91-92页
       ·The reaction rate is varied with enzyme concentration第92-95页
       ·Interpretation of product inhibition experiments第95-97页
       ·D domain is critical for substrate phosphorylation of TTK第97-101页
       ·Two-substrate Kinetic Analysis for TTK-wt and TTK-d第101-108页
       ·Investigation of the TTK kinase activity using substrate analog inhibitor第108-109页
   ·Discussion第109-114页
       ·A lag-phase in TTK product formation and auto-phosphorylation enhances activity第109-111页
       ·Self association or clustering of Mpsl molecules may enhance autophosphorylation and activate its kinase activity第111-112页
       ·TTK catalysis transpires through a sequential kinetic mechanism第112-114页
Conclusions第114-119页
References第119-128页
Acknowledgements第128-130页
攻读学位期间发表的学术论文第130-131页
附录第131-132页
学位论文评阅及答辩情况表第132页

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