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安徽省水稻条纹病毒分子变异及其NS3基因的功能鉴定

中文摘要第1-6页
Abstract第6-12页
文献综述第12-23页
 1 水稻条纹病毒的生物学特性第12-17页
   ·水稻条纹叶枯病的分布与危害第12页
   ·水稻条纹叶枯病的症状第12页
   ·水稻条纹叶枯病的病原、寄主及传毒介体第12-13页
   ·水稻条纹病毒的基因组结构第13页
   ·水稻条纹病毒编码的蛋白及其功能第13-15页
   ·水稻条纹病毒的变异第15-17页
 2 RNA 沉默第17-23页
   ·RNA 沉默简介第17页
   ·RNA 沉默的机制第17-18页
   ·RNA 沉默抑制子第18-23页
     ·沉默抑制子的发现和种类第18-20页
     ·沉默抑制子的鉴定方法第20-21页
       ·农杆菌介导的瞬时表达系统鉴定抑制子第20页
       ·利用病毒载体表达法鉴定抑制子第20页
       ·转基因植物杂交和嫁接鉴定抑制子第20-21页
     ·沉默抑制子抑制基因沉默的机制第21页
     ·沉默抑制子的生物技术应用第21-23页
       ·提高外源蛋白的表达水平第21-22页
       ·解析RNA 沉默过程第22-23页
引言第23-25页
材料与方法第25-41页
 1 供试材料第25-26页
   ·病样来源第25-26页
   ·植物材料第26页
   ·菌种和载体第26页
   ·酶和化学试剂第26页
   ·常用缓冲溶液和培养基第26页
   ·抗生素第26页
   ·仪器设备第26页
 2 试验方法第26-41页
   ·叶片总RNA 的提取第26-27页
     ·提RNA 的准备工作第26-27页
     ·Trizol 抽提液提取总RNA 方法第27页
   ·cDNA 的合成第27-28页
   ·PCR 技术第28页
   ·PCR 产物的克隆第28-32页
     ·PCR 产物回收和纯化第28-29页
     ·PCR 产物的连接第29页
     ·感受态细胞的制备第29-30页
       ·Ecoli DH5α感受态细胞的少量制备(CaCl_2 法)第29-30页
       ·农杆菌感受态细胞的少量制备第30页
     ·连接产物的转化第30页
       ·连接产物转化大肠杆菌第30页
       ·连接产物转化农杆菌(冻融法)第30页
     ·阳性克隆的PCR 鉴定第30-31页
     ·质粒提取第31-32页
   ·克隆基因的测序、分析和登录第32页
   ·RSV CP 基因和NS3 基因的克隆第32-33页
     ·CP 基因的克隆第32页
       ·CP 基因的引物设计第32页
       ·cDNA 合成及外壳蛋白(CP)基因的RT-PCR 扩增第32页
     ·NS3 基因的克隆第32-33页
       ·NS3 基因的引物设计第32-33页
       ·NS3 基因的PCR 扩增第33页
   ·克隆基因的序列分析第33-36页
   ·NS3 基因植物表达载体的构建第36-39页
     ·用于局部沉默的NS3 基因植物表达载体的构建策略(图)第36-37页
     ·用于回复试验的NS3 基因植物表达载体的构建策略(图)第37页
     ·NS3 片段的引物设计第37-38页
     ·NS3 片段的克隆第38页
     ·NS3 植物表达载体的构建第38页
     ·重组植物表达载体转入农杆菌第38-39页
   ·农杆菌共浸润接种第39页
   ·系统沉默试验第39-40页
   ·回复试验第40页
   ·GFP 荧光观察和拍照第40-41页
结果与分析第41-51页
 1 RSV CP 基因和NS3 基因的克隆第41-43页
   ·RSV CP 基因的克隆第41-42页
     ·cDNA 合成及外壳蛋白(CP)基因的RT-PCR 扩增第41页
     ·RSV CP 基因的克隆第41-42页
   ·RSV NS3 基因的克隆第42-43页
     ·cDNA 合成及NS3 基因的RT-PCR 扩增第42-43页
     ·RSV NS3 基因的克隆第43页
 2 RSV CP 基因和NS3 基因的序列分析第43-47页
   ·CP 基因的相似性分析第43-45页
   ·NS3 基因的相似性分析第45-47页
 3 NS3 基因植物表达载体的构建第47-49页
   ·用于局部沉默的NS3 基因植物表达载体的构建第47-48页
     ·用于局部沉默的NS3 基因片段的克隆第47页
     ·pBin-NS3 植物表达载体的构建第47-48页
   ·用于回复试验的NS3 基因植物表达载体的构建第48-49页
     ·用于回复试验的NS3 基因片段的克隆第48-49页
     ·TRV-NS3 植物表达载体的构建第49页
 4 RSV 马鞍山分离物编码的NS3 能抑制GFP 16c 本氏烟的局部沉默第49-50页
 5 RSV 安徽马鞍山分离物编码的NS3 蛋白的回复试验第50-51页
讨论第51-54页
 1 RSV CP 基因和NS3 基因的序列分析第51-52页
 2 RSV 安徽马鞍山分离物编码的NS3 基因功能鉴定第52-54页
结论第54-55页
附:草莓镶脉病毒(SVBV)外壳蛋白的原核表达及抗血清制备第55-61页
 1 材料与方法第55-57页
   ·酶及生化试剂第55-56页
   ·质粒载体及菌株第56页
   ·引物的设计与合成第56页
   ·SVBV 外壳蛋白基因的克隆第56页
   ·原核表达质粒的构建第56页
   ·CP 在pET-32a 表达系统中的表达与纯化第56页
   ·重组蛋白的多抗血清的制备第56-57页
 2 结果与分析第57-60页
   ·SVBV 外壳蛋白CP 基因的克隆和原核表达质粒的构建第57页
   ·重组质粒的鉴定第57-58页
   ·重组蛋白的表达、纯化、SDS-PAGE 及Western-blot 分析第58-59页
   ·抗血清制备及效价测定第59-60页
 3 讨论第60-61页
参考文献第61-68页
附录A:常用缓冲液及培养基配方法第68-73页
附录B:常用的抗生素和激素及使用浓度第73-74页
附录C:常用化学试剂、分子生物学试剂及仪器第74-76页
附录D:本文所用的重要缩写词及中文对照第76-77页
致谢第77-78页
作者简介第78页

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