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细菌转录调控网络的空间结构组织特征

摘要第5-6页
Abstract第6-7页
英文缩略语表(Abbreviations)第8-9页
1.前言第9-19页
    1.1 转录调控网络第9-11页
    1.2 转录因子的运动方式及模型第11-13页
    1.3 细菌三维基因组第13-17页
    1.4 研究的目的和意义第17-19页
2.数据和方法第19-27页
    2.1 三维基因组数据分析第19-22页
        2.1.1 数据的来源和处理第19-20页
        2.1.2 交互矩阵的归一化和可视化第20-21页
        2.1.3 重建染色体三维空间结构第21-22页
    2.2 转录调控网络分析第22-25页
        2.2.1 构建转录调控网络第22-23页
        2.2.2 寻找网络关键节点第23页
        2.2.3 划分网络层级第23-24页
        2.2.4 寻找网络模体第24-25页
    2.3 整合转录调控网络和三维基因组数据第25-26页
    2.4 工具软件第26-27页
3.结果与分析第27-37页
    3.1 转录调控网络正负调控方式第27-30页
    3.2 转录调控网络的关键节点第30-32页
    3.3 转录调控网络的层级结构第32-34页
    3.4 转录调控网络中的模体第34-37页
4.讨论第37-43页
    4.1 交互矩阵还是结构模型?第37-38页
    4.2 转录调控网络基因组一维排布规律第38-39页
    4.3 转录调控网络的重连第39-40页
    4.4 转录调控网络的动力学验证第40页
    4.5 原核三维基因组实验技术第40-41页
    4.6 总结第41-43页
参考文献第43-51页
附录第51-52页
致谢第52页

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