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猪流行性腹泻病毒SYBR Green Ⅰ和Taq-Man荧光定量PCR检测方法的建立及应用

摘要第8-9页
Abstract第9页
第一章 文献综述第10-19页
    1 PEDV的研究进展第10-18页
        1.1 PEDV的生物学特性第10-14页
            1.1.1 PEDV的病原学第10-11页
            1.1.2 PEDV基因组结构第11页
            1.1.3 PEDV的非结构基因第11-12页
            1.1.4 PEDV的结构基因和其编码产物第12-14页
        1.2 PEDV的流行病学特点第14页
        1.3 PEDV的实验室诊断方法第14-15页
            1.3.1 病原学诊断第14页
            1.3.2 血清学诊断第14-15页
            1.3.3 常规RT-PCR法第15页
        1.4 荧光定量PCR第15-18页
            1.4.1 荧光定量PCR原理第15-16页
            1.4.2 实时荧光定量PCR中的荧光化学物质第16-18页
            1.4.3 实时荧光定量PCR的定量方法第18页
    2 本试验的研究目的和意义第18-19页
第二章 PEDV常规RT-PCR检测方法的建立及应用第19-28页
    1 材料第19-20页
        1.1 病料的来源第19页
        1.2 主要试剂第19页
        1.3 常用试剂的配制第19-20页
        1.4 主要仪器设备第20页
    2 方法第20-23页
        2.1 引物设计与合成第20页
        2.2 RNA的提取第20-21页
        2.3 RT-PCR第21页
            2.3.1 cDNA的合成第21页
            2.3.2 PCR扩增第21页
        2.4 目的产物纯化第21-22页
        2.5 目的产物的连接与转化第22页
            2.5.1 目的片段的T-A克隆第22页
            2.5.2 连接产物的转化第22页
        2.6 重组菌的筛选与鉴定第22-23页
            2.6.1 重组菌的扩大培养第22页
            2.6.2 菌落PCR第22-23页
            2.6.3 重组菌测序鉴定第23页
        2.7 PCR的条件优化第23页
            2.7.1 特异性实验第23页
            2.7.2 最佳退火温度的优化第23页
            2.7.3 最佳引物浓度的优化第23页
            2.7.4 敏感性实验第23页
        2.8 临床检测第23页
    3 结果第23-26页
        3.1 PCR的条件优化结果第23-25页
            3.1.1 特异性实验第23-24页
            3.1.2 最佳退火温度的确定第24页
            3.1.3 最佳引物浓度的确定第24-25页
            3.1.4 敏感性实验第25页
        3.2 目的片段的序列分析第25-26页
        3.3 临床样品的检测第26页
    4 小结与讨论第26-28页
第三章 PEDV SYBR Green I实时荧光定量PCR检测方法的建立及应用第28-37页
    1 材料第28-29页
        1.1 病料的来源第28页
        1.2 主要试剂第28页
        1.3 常用试剂的配制第28-29页
        1.4 主要仪器设备第29页
    2 方法第29-32页
        2.1 引物设计与合成第29页
        2.2 RNA的提取第29页
        2.3 SYBR Green I荧光定量PCR标准品的制备第29-31页
            2.3.1 RT-PCR第29页
            2.3.2 目的产物纯化第29页
            2.3.3 目的产物的连接与转化第29页
            2.3.4 重组菌的筛选与鉴定第29-30页
            2.3.5 阳性质粒的提取第30页
            2.3.6 阳性质粒的酶切鉴定第30页
            2.3.7 标准品的制备第30-31页
        2.4 SYBR Green I荧光定量PCR反应体系的建立及优化第31页
        2.5 SYBR Green I标准曲线的建立第31页
        2.6 溶解曲线的分析第31页
        2.7 SYBR Green I特异性、敏感性和稳定性试验第31页
        2.8 SYBR Green I实时荧光定量PCR的应用第31-32页
    3 结果第32-35页
        3.1 目的片段的扩增及重组质粒的鉴定第32页
        3.2 SYBR Green I荧光定量PCR反应条件的确定和标准曲线的建立第32-33页
        3.3 SYBR Green I实时荧光定量PCR的溶解曲线分析第33-34页
        3.4 SYBR Green I荧光定量PCR特异性、敏感性和稳定性试验结果第34-35页
        3.5 临床样品的检测第35页
    4 小结与讨论第35-37页
第四章 PEDV Taq-Man实时荧光定量PCR检测方法的建立及应用第37-45页
    1 材料第37-38页
        1.1 病料的来源第37页
        1.2 主要试剂第37页
        1.3 常用试剂的配制第37-38页
        1.4 主要仪器设备第38页
    2 方法第38-40页
        2.1 Taq-Man实时荧光定量PCR的引物与探针设计与合成第38页
        2.2 RNA的提取第38页
        2.3 Taq-Man实时荧光定量PCR标准品的制备第38-39页
            2.3.1 RT-PCR第38页
            2.3.2 目的产物纯化第38页
            2.3.3 目的产物的连接与转化第38页
            2.3.4 重组菌的筛选与鉴定第38-39页
            2.3.5 阳性质粒的提取第39页
            2.3.6 阳性质粒的酶切鉴定第39页
            2.3.7 标准品的制备第39页
        2.4 Taq-Man实时荧光定量PCR反应体系的建立及优化第39页
        2.5 Taq-Man实时荧光定量PCR标准曲线的建立第39页
        2.6 Taq-Man实时荧光定量PCR特异性、敏感性和稳定性试验第39-40页
        2.7 Taq-Man实时荧光定量PCR的临床运用第40页
    3 结果第40-43页
        3.1 目的片段的扩增及重组质粒的鉴定第40页
        3.2 Taq-Man实时荧光定量PCR反应条件的确定和标准曲线的建立第40-41页
        3.3 Taq-Man实时荧光定量PCR特异性、敏感性和稳定性试验结果第41-42页
        3.4 临床样品的检测第42-43页
    4 小结与讨论第43-45页
第五章 应用Taq-Man实时荧光定量PCR探究PEDV疫苗株的培养及增殖规律第45-53页
    1 材料第45-46页
        1.1 材料来源第45页
        1.2 主要试剂第45页
        1.3 常用试剂的配制第45-46页
        1.4 主要仪器设备第46页
    2 方法第46-48页
        2.1 Vero-81细胞复苏第46页
        2.2 Vero-81细胞的传代培养第46页
        2.3 PEDV疫苗株CV777的增殖第46-47页
        2.4 PEDV疫苗株CV777的Taq-Man实时荧光定量PCR定量第47页
            2.4.1 RNA的提取第47页
            2.4.2 Taq-Man实时荧光定量PCR第47页
        2.5 病毒TCID50的测定第47页
        2.6 PEDV疫苗株CV777一步生长曲线的绘制第47-48页
    3 结果第48-51页
        3.1 Vero-81细胞的培养第48页
        3.2 PEDV CV777疫苗株的培养第48-49页
        3.3 CV777拷贝数和滴度的测定第49-50页
            3.3.1 拷贝数的测定第49页
            3.3.2 TCID50的测定第49-50页
        3.4 CV777一步生长曲线的绘制第50-51页
    4 小结与讨论第51-53页
全文总结第53-54页
参考文献第54-60页
致谢第60页

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