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单核细胞增生李斯特菌XYSN和NTSN全基因组测序及比较基因组学分析

中文摘要第2-6页
Abstract第6-10页
符号说明第13-15页
文献综述第15-32页
    1 单核细胞增生李斯特菌研究进展第15-23页
        1.1 李斯特菌属概述第15页
        1.2 致病性李斯特菌主要毒力相关因子第15-23页
    2 微生物基因组学研究进展第23-27页
        2.1 DNA测序技术进展第23-24页
        2.2 微生物基因组学研究的应用第24-27页
        2.3 小结第27页
    参考文献第27-32页
第一章 动物源分离株XYSN和NTSN的生物学特性研究第32-41页
    1 材料和方法第32-34页
        1.1 材料第32-33页
        1.2 方法第33-34页
    2 结果与分析第34-38页
        2.1 生化试验第34-35页
        2.2 血清型鉴定第35页
        2.3 药敏试验第35-36页
        2.4 细胞侵袭实验第36-37页
        2.5 BALB/c小鼠的LD_(50)测定第37页
        2.6 MLST分型第37页
        2.7 基于actA基因的遗传谱系分析第37-38页
    3 讨论第38-40页
    参考文献第40-41页
第二章 单核细胞增生李斯特菌XYSN和NTSN全基因组序列的测定与注释分析第41-70页
    1 材料和方法第41-45页
        1.1 材料第41-42页
        1.2 实验方法第42-45页
    2 结果与分析第45-65页
        2.1 基因组DNA的提取第45-46页
        2.2 基因组测序的基本信息第46页
        2.3 LM XYSN和NTSN基因组测序的注释及分析第46-65页
    3 讨论第65-68页
    参考文献第68-70页
第三章 单核细胞增生李斯特菌XYSN和NTSN比较基因组学分析和进化分析第70-108页
    1 材料和方法第70-75页
        1.1 材料第70-73页
        1.2 实验方法第73-75页
    2 结果与分析第75-103页
        2.1 基因组共线性分析第75-78页
        2.2 BSR分析第78页
        2.3 同源基因聚类比较分析第78-79页
        2.4 LM泛基因组构建与分析第79-86页
        2.5 XYSN特异基因分析第86-87页
        2.6 XYSN毒力相关基因比较分析第87-100页
        2.7 进化分析第100-103页
    3 讨论第103-105页
    参考文献第105-108页
第四章 单核细胞增生李斯特菌XYSN中基因组岛9缺失突变株的构建、鉴定及生物学特性研究第108-121页
    1 材料和方法第108-111页
        1.1 材料第108-109页
        1.2 实验方法第109-111页
    2 结果与分析第111-116页
        2.1 缺失突变株XYSN△GI9的构建结果第111-114页
        2.2 缺失突变株XYSN△G19生物学特性结果第114-116页
    3 讨论第116-119页
    参考文献第119-121页
全文总结第121-122页
攻读硕士期间发表的学术论文第122-123页
致谢第123-124页
附录第124-137页

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