干旱和盐胁迫中桑microRNA差异表达分析
| 摘要 | 第6-8页 |
| Abstract | 第8-9页 |
| 第一章 绪论 | 第15-29页 |
| 1.1 microRNA研究现状 | 第15-24页 |
| 1.1.1 microRNA基因 | 第15页 |
| 1.1.2 miRNA的发现和命名 | 第15-16页 |
| 1.1.3 miRNA的特点 | 第16-17页 |
| 1.1.4 miRNA的合成机制 | 第17-18页 |
| 1.1.5 miRNA的作用方式 | 第18-19页 |
| 1.1.6 miRNA基因的获得 | 第19-20页 |
| 1.1.7 miRNA的生物学验证 | 第20-21页 |
| 1.1.8 靶基因的预测 | 第21-22页 |
| 1.1.9 miRNA的靶基因验证 | 第22-24页 |
| 1.2 植物miRNA与干旱、盐胁迫 | 第24-25页 |
| 1.3 本课题国内外研究现状和发展趋势 | 第25-26页 |
| 1.4 本课题理论意义和实用价值 | 第26-27页 |
| 1.5 研究内容和实验流程 | 第27-29页 |
| 1.5.1 研究内容 | 第27-28页 |
| 1.5.2 实验流程 | 第28-29页 |
| 第二章 小RNA文库的建立与测序 | 第29-45页 |
| 2.1 材料与设备 | 第29-30页 |
| 2.1.1 材料获取 | 第29页 |
| 2.1.2 验仪器与试剂 | 第29-30页 |
| 2.1.3 所需生物信息学软件 | 第30页 |
| 2.2 实验方法 | 第30-34页 |
| 2.2.1 总RNA提取 | 第30-31页 |
| 2.2.2 小RNA文库的构建 | 第31-32页 |
| 2.2.3 Solexa测序 | 第32页 |
| 2.2.4 测序数据的生物信息学分析 | 第32-34页 |
| 2.3 结果与分析 | 第34-41页 |
| 2.3.1 小RNA文库测序数据统计 | 第34-36页 |
| 2.3.2 桑树miRNA表达谱分析 | 第36-37页 |
| 2.3.3 确认Novel miRNA | 第37-38页 |
| 2.3.4 与干旱和盐胁迫相关miRNA | 第38-39页 |
| 2.3.5 靶基因预测结果 | 第39-41页 |
| 2.4 讨论 | 第41-42页 |
| 2.5 本章小结 | 第42-45页 |
| 第三章 差异表达miRNA的验证 | 第45-52页 |
| 3.1 材料及仪器 | 第45-46页 |
| 3.1.1 试剂 | 第45页 |
| 3.1.2 仪器 | 第45页 |
| 3.1.3 实验材料 | 第45-46页 |
| 3.2 实验方法 | 第46-49页 |
| 3.2.1 引物设计 | 第46-48页 |
| 3.2.2 反转录反应 | 第48页 |
| 3.2.3 荧光定量PCR检测 | 第48-49页 |
| 3.3 实验结果 | 第49-50页 |
| 3.4 讨论 | 第50-51页 |
| 3.5 本章小结 | 第51-52页 |
| 第四章 miR395a的靶基因定量及作用方式验证 | 第52-65页 |
| 4.1 实验材料与方法 | 第52-61页 |
| 4.1.1 桑叶材料 | 第52-53页 |
| 4.1.2 试剂与缓冲液 | 第53-54页 |
| 4.1.3 仪器与设备 | 第54页 |
| 4.1.4 实验方法 | 第54-61页 |
| 4.2 结果与分析 | 第61-63页 |
| 4.2.1 靶基因定量结果 | 第61-62页 |
| 4.2.25’RACE验证结果 | 第62-63页 |
| 4.3 讨论 | 第63-64页 |
| 4.4 本章小结 | 第64-65页 |
| 结论 | 第65-67页 |
| 参考文献 | 第67-75页 |
| 附录 | 第75-82页 |
| 附录1 桑树生长情况照片 | 第75-76页 |
| 附录2 鉴定的保守miRNA | 第76-79页 |
| 附录3 部分miRNA及其对应的多个靶基因 | 第79-80页 |
| 附录4 mRNA纯化流程 | 第80-81页 |
| 附录5 英文缩写说明 | 第81-82页 |
| 攻读硕士学位期间发表的学位论文 | 第82-84页 |
| 致谢 | 第84页 |
