基于噬菌体展示的构象性B细胞表位预测研究
| 摘要 | 第5-6页 |
| ABSTRACT | 第6页 |
| 第一章 引言 | 第9-20页 |
| 1.1 B细胞表位预测的研究背景 | 第9-10页 |
| 1.1.1 免疫信息学 | 第9页 |
| 1.1.2 B细胞表位 | 第9-10页 |
| 1.2 噬菌体展示技术简介 | 第10-12页 |
| 1.3 B细胞表位预测的发展现状 | 第12-14页 |
| 1.4 基于噬菌体展示的B细胞表位预测方法介绍 | 第14-18页 |
| 1.5 本文研究的内容及意义 | 第18-19页 |
| 1.6 本文的创新点 | 第19页 |
| 1.7 论文组织结构 | 第19-20页 |
| 第二章 基于噬菌体展示的构象性B细胞表位预测方法 | 第20-32页 |
| 2.1 方法简介 | 第20-22页 |
| 2.1.1 方法概述 | 第20-21页 |
| 2.1.2 方法流程图 | 第21-22页 |
| 2.2 MIMOX2算法的实现 | 第22-32页 |
| 2.2.1 PDB文件输入解析 | 第22-23页 |
| 2.2.2 计算抗原表面的可及性面积 | 第23-24页 |
| 2.2.3 抗原表面划分片区 | 第24-25页 |
| 2.2.4 模拟肽与片区中的氨基酸理化性质匹配 | 第25-28页 |
| 2.2.5 片区得分计算 | 第28-29页 |
| 2.2.6 结果列表展示 | 第29-30页 |
| 2.2.7 预测表位氨基酸残基 3D空间定位展示 | 第30-32页 |
| 第三章 测试数据集 | 第32-41页 |
| 3.1 构象性B细胞表位预测算法的测试 | 第32-33页 |
| 3.2 WXY数据集的构建 | 第33-41页 |
| 3.2.1 确定复合物结构 | 第33-35页 |
| 3.2.2 模拟肽的分析与处理 | 第35-37页 |
| 3.2.3 表位氨基酸残基的确定 | 第37-39页 |
| 3.2.4 WXY测试集的综合分析 | 第39-41页 |
| 第四章 算法分析与讨论 | 第41-46页 |
| 4.1 系统测试分析 | 第41-44页 |
| 4.1.1 系统测试方法构建 | 第41-42页 |
| 4.1.2 基于WXY测试集的系统测试分析 | 第42-44页 |
| 4.2 典型实例测试分析 | 第44-46页 |
| 第五章 总结与展望 | 第46-50页 |
| 5.1 总结 | 第46页 |
| 5.2 展望 | 第46-50页 |
| 5.2.1 对于MIMOX2的展望 | 第46-49页 |
| 5.2.2 对于WXY数据集的展望 | 第49-50页 |
| 致谢 | 第50-51页 |
| 参考文献 | 第51-55页 |
| 附录 | 第55-67页 |
| 硕士期间取得的研究成果 | 第67-68页 |
