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高山离子芥低温胁迫调控的miRNAs及其靶基因的表达分析

摘要第3-5页
ABSTRACT第5-6页
第一部分 引言第10-23页
    1.1 植物冷胁迫第10-13页
        1.1.1 植物的冷驯化及其影响因素第10-11页
        1.1.2 植物响应低温胁迫的生理生化和分子生物学机制第11-13页
    1.2 MIRNA(MICRORNA)微小RNA第13-21页
        1.2.1 miRNA的特点第13-14页
        1.2.2 miRNA的生物合成第14页
        1.2.3 植物miRNA的作用方式第14页
        1.2.4 植物中miRNA的生物学功能第14-15页
        1.2.5 miRNA的预测及验证方法第15-18页
        1.2.6 植物逆境胁迫响应的miRNA第18-20页
        1.2.7 miRNA与植物抗病性第20-21页
    1.3 高山离子芥在植物耐寒、抗冻机理研究中的意义第21-22页
    1.4 本论文研究的目的和意义第22-23页
第二部分 实验材料与方法第23-35页
    2.1 冷胁迫调控的MIRNA的高通量测序第23-25页
        2.1.1 实验材料及处理第23页
        2.1.2 高山离子芥总RNA提取第23-24页
        2.1.3 深度测序第24页
        2.1.4 小RNAs的处理和miRNA鉴定/预测第24页
        2.1.5 sRNAs和靶基因的表达分析第24-25页
        2.1.6 功能基因的基因本体论(GO)特征第25页
    2.2 实时定量PCR验证MIRNA的表达的实验材料与方法第25-30页
        2.2.1 植物材料第25页
        2.2.2 引物序列第25-27页
        2.2.3 高山离子芥总RNA的提取(方法同前)第27页
        2.2.4 DNaseI(RNase free)处理总RNA第27-28页
        2.2.5 反转录为cDNA第28页
        2.2.6 实时定量PCR(qPCR)内参基因的筛选第28-29页
        2.2.7 实时定量PCR(qPCR)分析第29-30页
    2.3 高山离子芥基因的克隆第30-33页
        2.3.1 实验材料及处理第30页
        2.3.2 总RNA的提取(同前)第30页
        2.3.3 反转录获得cDNA第30页
        2.3.4 CB7248长片段的获得第30-31页
        2.3.5 高山离子芥CB7248短片段的获得第31-33页
    2.4 DC3000菌液浸染实验方法第33-34页
        2.4.1 实验材料第33页
        2.4.2 实验方法第33-34页
    2.5 高山离子芥耐冷生理学研究第34-35页
        2.5.1 实验材料及处理第34页
        2.5.2 电导率的测定第34页
        2.5.3 相对细胞活力的测定第34-35页
第三部分 实验结果第35-47页
    3.1 低温胁迫调控的MIRNAs和它的靶基因发现和表达分析第35-41页
        3.1.1 mRNA转录组测序数据第35页
        3.1.2 miRNAs测序第35-37页
        3.1.3 在高山离子芥中鉴别出冷胁迫调控的保守miRNAs第37-38页
        3.1.4 高山离子芥中冷胁迫调节miRNAs(CSR miRNAs)的预测第38-39页
        3.1.5 高山离子芥中保守的miRNAs和CSRmiRNA预测的目标功能基因的GO分析第39-41页
    3.2 MIRNA的实时定量QPCR表达分析第41-43页
        3.2.1 miRNA实时定量qPCR内参基因的筛选第41-42页
        3.2.2 miRNA实时定量qPCR表达分析第42-43页
    3.3 CB7248基因的克隆第43-44页
    3.4 DC3000菌液浸染拟南芥第44-45页
    3.5 高山离子芥生理学研究第45-47页
第四部分 讨论第47-50页
    4.1 深度测序结果、基因表达分析第47页
    4.2 MIRNA的实时荧光定量PCR表达分析第47-48页
    4.3 高山离子芥耐冷、抗冻的生理学研究第48-50页
第五部分 结论第50-51页
参考文献第51-57页
缩略词表第57-58页
在学期间的研究成果第58-59页
致谢第59页

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