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果胶酶基因的克隆表达及其在小尾寒羊瘤胃环境中的多样性分析

摘要第1-8页
Abstract第8-15页
英文缩略表第15-16页
第一章 绪论第16-31页
   ·果胶类物质的组成和结构第16-17页
   ·果胶的生物学功能第17-18页
     ·提供能量第17页
     ·影响碳水化合物代谢第17页
     ·影响脂肪代谢第17-18页
     ·影响其他营养素代谢第18页
   ·果胶在动物营养中的作用第18页
     ·在单胃动物营养中的作用第18页
     ·在反刍动物营养中的作用第18页
   ·果胶酶第18-29页
     ·降解果胶类物质的相关酶类及简介第18-20页
     ·果胶酶的分类第20-24页
     ·果胶酶的性质第24-26页
     ·果胶酶的应用第26-29页
   ·瘤胃简介第29-30页
 本研究的目的和意义第30-31页
第二章 小尾寒羊瘤胃环境中果胶酶基因多样性分析第31-57页
   ·实验材料第31-32页
     ·瘤胃材料第31页
     ·菌株,载体,工具酶,试剂第31页
     ·引物合成和核酸测序第31页
     ·溶液第31页
     ·培养基第31-32页
     ·主要仪器第32页
   ·实验方法第32-39页
     ·小尾寒羊瘤胃液果胶酶的酶活力变化趋势的测定第32页
     ·小尾寒羊瘤胃微生物宏基因组 DNA 的提取和纯化第32-33页
     ·各家族果胶酶简并引物的设计第33页
     ·各家族果胶酶简并引物的验证第33-36页
     ·瘤胃内果胶酶基因片段的连接转化和序列初步分析第36-37页
     ·瘤胃内果胶酶基因片段的扩增及文库的构建第37-38页
     ·瘤胃内果胶酶基因片段的测序及多样性分析第38-39页
     ·瘤胃内三个果胶酶家族之间多样性比较第39页
   ·结果与分析第39-54页
     ·小尾寒羊瘤胃液果胶酶的酶活力变化趋势第39-40页
     ·瘤胃微生物宏基因组 DNA 的提取和纯化第40页
     ·各家族果胶酶基因简并引物的设计与验证第40-42页
     ·各家族果胶酶基因序列的初步评估第42-43页
     ·各家族果胶酶基因片段文库的构建第43-44页
     ·瘤胃果胶酶基因多样性的分析第44-52页
     ·瘤胃内三个果胶酶家族之间多样性比较结果第52-54页
   ·讨论第54-56页
 本章小结第56-57页
第三章 直接从瘤胃微生物中克隆果胶酶基因全长第57-78页
   ·实验材料第57页
     ·宏基因组 DNA第57页
     ·菌株,载体,工具酶,试剂第57页
     ·引物合成及 DNA 测序第57页
     ·常用溶液第57页
     ·培养基第57页
     ·主要仪器第57页
   ·实验方法第57-63页
     ·目标基因序列的选择第57-58页
     ·宏基因组中果胶酶全长序列的扩增第58-59页
     ·宏转录组中果胶酶基因的扩增第59-63页
   ·结果与分析第63-75页
     ·瘤胃宏基因组中目标基因序列的选择第63-64页
     ·宏基因组 DNA 中果胶酶全长序列的扩增第64-73页
     ·瘤胃宏转录组中果胶酶基因的扩增第73-75页
   ·讨论第75-77页
 本章小结第77-78页
第四章 瘤胃中两个果胶酶基因的异源表达与性质分析第78-88页
   ·实验材料第78-79页
     ·菌株和质粒第78页
     ·引物合成及 DNA 测序第78页
     ·试剂盒、工具酶和生化试剂第78页
     ·主要仪器第78页
     ·培养基第78页
     ·常用溶液第78-79页
   ·实验方法第79-83页
     ·原核表达载体 pET-22b(+)-A125 和 pET-22b(+)-D1 的构建第79-81页
     ·重组酶的纯化及性质测定第81-82页
     ·重组酶的酶活测定第82-83页
     ·重组酶的性质测定第83页
   ·结果与分析第83-86页
     ·重组酶在大肠杆菌中的表达与纯化第83-84页
     ·重组酶酶学性质的测定第84-86页
   ·讨论第86-87页
 本章小结第87-88页
第五章 具有应用潜力的新颖果胶酶的克隆和异源表达及性质分析第88-137页
 第一节 来源于Penicillium sp. CGMCC 1669和Klebsiella sp. Y1的两个多聚半乳糖醛酸酶第88-117页
   ·实验材料第88-89页
     ·菌株和质粒第88页
     ·引物合成与测序第88页
     ·试剂盒、工具酶和试剂第88页
     ·主要仪器第88页
     ·培养基配制第88-89页
   ·实验方法第89-100页
     ·来源于 Penicillium sp. CGMCC 1669 和 Klebsiella sp. Y1 的多聚半乳糖醛酸酶基因 pg Ⅰ 和 pg Ⅱ 的克隆第89-90页
     ·重组表达载体 pPIC9-pg Ⅰ 和 pPET-22b(+)-pg Ⅱ 的构建第90-93页
     ·pPIC9-pg Ⅰ 和 pPET-22b(+)-pg Ⅱ 在表达宿主中的表达第93-96页
     ·重组多聚半乳糖醛酸酶 PG Ⅰ 和 PG Ⅱ 的纯化第96-97页
     ·重组多聚半乳糖醛酸酶 PG Ⅰ 和 PG Ⅱ 的酶学性质分析第97-100页
   ·结果与分析第100-115页
     ·重组多聚半乳糖醛酸酶的全长克隆第100-105页
     ·重组多聚半乳糖醛酸酶的异源表达和纯化第105-107页
     ·重组多聚半乳糖醛酸酶的酶学性质研究第107-115页
   ·讨论第115-117页
 第二节 来源于 Streptomyces sp. S27、Klebsiella sp. Y1 和 Xanthomonas campestris ACCC 10048 的三个果胶酸裂解酶第117-136页
   ·实验材料第117页
     ·菌株和质粒第117页
     ·引物合成与测序第117页
     ·试剂盒、工具酶和试剂第117页
     ·主要仪器第117页
     ·培养基配制第117页
   ·实验方法第117-121页
     ·分别来源于 Streptomyces sp. S27、 Klebsiella sp. Y1 和 Xanthomonas campestris ACCC 10048 的果胶酸裂解酶基因 str、kl 和 xan 的克隆第117-118页
     ·重组表达载体 pPET-22b(+)-str、pPET-22b(+)-kl 和 pPET-22b(+)-xan 的构建第118-119页
     ·pPET-22b(+)-str、pPET-22b(+)-kl 和 pPET-22b(+)-xan 在宿主中的表达第119页
     ·三个重组酶的纯化第119页
     ·重组果胶酸裂解酶 STR,KL,XAN 的酶学性质分析第119-121页
   ·结果与分析第121-134页
     ·果胶酸裂解酶的全长克隆第121-126页
     ·三个重组果胶酸裂解酶在大肠杆菌中异源表达和纯化第126-127页
     ·重组果胶酸裂解酶的酶学性质研究第127-134页
   ·讨论第134-136页
 本章小结第136-137页
第六章 全文结论第137-138页
参考文献第138-149页
致谢第149-150页
作者简历第150-151页

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