| 摘要 | 第7-9页 |
| Abstract | 第9-10页 |
| 1. 绪论 | 第11-19页 |
| 1.1 昆虫肠道微生物的研究概况 | 第11-12页 |
| 1.2 昆虫肠道微生物多样性研究 | 第12-14页 |
| 1.2.1 影响昆虫肠道微生物多样性的因素 | 第13-14页 |
| 1.3 昆虫肠道微生物的功能 | 第14-17页 |
| 1.3.1 肠道微生物的食物降解功能 | 第14-15页 |
| 1.3.2 肠道微生物的解毒功能 | 第15-16页 |
| 1.3.3 肠道微生物的其他功能 | 第16页 |
| 1.3.4 昆虫与微生物的共同进化 | 第16-17页 |
| 1.4 肠道微生物的研究方法 | 第17-18页 |
| 1.5 本研究的目的和意义 | 第18-19页 |
| 1.6 技术路线 | 第19页 |
| 2 材料方法 | 第19-31页 |
| 2.1 主要试剂及主要仪器 | 第19-20页 |
| 2.2 斜纹夜蛾的饲养 | 第20页 |
| 2.3 斜纹夜蛾肠道细菌多样性分析 | 第20-26页 |
| 2.3.1 斜纹夜蛾肠道细菌宏基因组测序和数据分析 | 第20-22页 |
| 2.3.1.1 测序数据预处理 | 第20-21页 |
| 2.3.1.2 宏基因组组装 | 第21页 |
| 2.3.1.3 物种注释 | 第21-22页 |
| 2.3.2 斜纹夜蛾肠道细菌多样性的PCR-DGGE分析 | 第22-23页 |
| 2.3.2.1 斜纹夜蛾幼虫肠道内容物和肠道细菌总DNA的提取 | 第22页 |
| 2.3.2.2 16S rRNA V3区的PCR扩增 | 第22-23页 |
| 2.3.2.3 变性梯度凝胶电泳(DGGE) | 第23页 |
| 2.3.2.4 基于DGGE图谱的微生物多样性分析 | 第23页 |
| 2.3.2.5 DGGE序列分析 | 第23页 |
| 2.3.3 实时荧光定量PCR验证斜纹夜蛾肠道细菌 | 第23-24页 |
| 2.3.4 斜纹夜蛾肠道细菌的分离与培养 | 第24-26页 |
| 2.3.4.1 斜纹夜蛾肠道的解剖 | 第24-25页 |
| 2.3.4.2 斜纹夜蛾肠道细菌的分离纯化 | 第25-26页 |
| 2.3.4.3 斜纹夜蛾肠道分离细菌16S rRNA基因的扩增 | 第26页 |
| 2.3.4.4 斜纹夜蛾肠道细菌系统发育分析 | 第26页 |
| 2.4 宏基因组测序分析斜纹夜蛾肠道细菌的功能 | 第26-29页 |
| 2.4.1 斜纹夜蛾肠道细菌宏基因组数据分析 | 第26-29页 |
| 2.4.1.1 基因预测及丰度分析 | 第26-27页 |
| 2.4.1.2 功能注释及丰度分析 | 第27-29页 |
| 2.5 抗生素处理对斜纹夜蛾肠道细菌的影响 | 第29-31页 |
| 2.5.1 供试虫源和食料植物 | 第29页 |
| 2.5.2 抗生素处理斜纹夜蛾 | 第29页 |
| 2.5.3 抗生素处理后DGGE分析斜纹夜蛾肠道细菌 | 第29页 |
| 2.5.4 抗生素处理后实时荧光定量PCR验证斜纹夜蛾肠道细菌 | 第29-30页 |
| 2.5.5 斜纹夜蛾幼虫营养指标的测定 | 第30页 |
| 2.5.6 数据分析 | 第30-31页 |
| 3 结果与分析 | 第31-71页 |
| 3.1 斜纹夜蛾肠道细菌多样性分析 | 第31-48页 |
| 3.1.1 斜纹夜蛾肠道细菌宏基因组测序数据分析 | 第31-39页 |
| 3.1.1.1 宏基因组数据分析斜纹夜蛾肠道细菌结构组成 | 第32-39页 |
| 3.1.2 斜纹夜蛾肠道细菌PCR-DGGE分析 | 第39-41页 |
| 3.1.2.1 基于DGGE图谱的斜纹夜蛾肠道细菌多样性分析 | 第39-40页 |
| 3.1.2.2 斜纹夜蛾肠道细菌序列比对与系统发育分析 | 第40-41页 |
| 3.1.3 定量PCR验证斜纹夜蛾肠道细菌的丰度 | 第41-42页 |
| 3.1.4 传统微生物分离纯培养法分析斜纹夜蛾肠道细菌的多样性 | 第42-48页 |
| 3.1.4.1 斜纹夜蛾肠道细菌的分离纯化 | 第42-43页 |
| 3.1.4.2 分离菌株16S rRNA克隆及测序 | 第43-47页 |
| 3.1.4.3 斜纹夜蛾16S rRNA系统发育分析 | 第47-48页 |
| 3.2 斜纹夜蛾肠道细菌功能研究 | 第48-64页 |
| 3.2.1 斜纹夜蛾肠道细菌基因功能分析 | 第48-52页 |
| 3.2.2 斜纹夜蛾肠道细菌对纤维素、木聚糖、果胶和碳水化合物的降解 | 第52-58页 |
| 3.2.3 斜纹夜蛾肠道细菌在氨基酸合成和维生素代谢上的作用 | 第58-62页 |
| 3.2.4 斜纹夜蛾肠道细菌对有毒酚类的代谢降解 | 第62-64页 |
| 3.3 抗生素处理对斜纹夜蛾肠道细菌的影响 | 第64-71页 |
| 3.3.1 抗生素处理后肠道细菌DGGE分析 | 第64-65页 |
| 3.3.2 抗生素处理后qPCR分析斜纹夜蛾肠道细菌多样性 | 第65-66页 |
| 3.3.3 抗生素及肠道细菌对斜纹夜蛾营养指标的影响 | 第66-71页 |
| 4 总结与讨论 | 第71-74页 |
| 4.1 斜纹夜蛾肠道细菌多样性 | 第71-72页 |
| 4.2 斜纹夜蛾肠道细菌功能分析 | 第72页 |
| 4.3 抗生素及肠道细菌对斜纹夜蛾取食的影响 | 第72-74页 |
| 参考文献 | 第74-83页 |
| 附录 | 第83-84页 |
| 致谢 | 第84页 |
