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山羊DIO3基因组织特异性表达及DNA甲基化分析

摘要第5-7页
Abstract第7-8页
1 文献综述第12-21页
    1.1 DIO3简介第12页
    1.2 DIO3的结构和功能第12页
    1.3 DIO3基因的研究进展第12-13页
    1.4 DNA甲基化第13-20页
        1.4.1 DNA甲基化的作用因素第14-16页
        1.4.2 哺乳动物DNA甲基化的特点第16-17页
        1.4.3 哺乳动物DNA甲基化主要的生物学作用第17-18页
        1.4.4 DNA甲基化的检测方法第18-20页
    1.5 本研究的目的和意义第20-21页
2 材料和方法第21-38页
    2.1 试验材料第21-23页
        2.1.1 试验动物第21页
        2.1.2 主要仪器与试剂第21-23页
        2.1.3 常用的生物信息学网站和分析软件第23页
    2.2 试验方法第23-26页
        2.2.1 总RNA的提取及质量检测第23-24页
        2.2.2 cDNA的制备第24页
        2.2.3 基因组DNA的提取第24-25页
        2.2.4 MassArray甲基化检测第25-26页
    2.3 克隆引物设计第26-27页
    2.4 DIO3基因的分离及克隆测序第27-30页
        2.4.1 RT-PCR扩增第27-28页
        2.4.2 PCR产物的纯化回收第28-29页
        2.4.3 RT-PCR产物的克隆第29-30页
    2.5 基因组织特异性表达分析第30-31页
        2.5.1 荧光定量特异性引物设计第30页
        2.5.2 实时荧光定量PCR第30-31页
    2.6 DIO3 mRNA局部定位表达分析第31-34页
        2.6.1 mRNA原位杂交操作步骤第32-34页
    2.7 甲基化检测第34-38页
        2.7.1 甲基化引物设计第34页
        2.7.2 基因组DNA的重亚硫酸盐处理第34-35页
        2.7.3 甲基化PCR扩增第35-36页
        2.7.4 PCR产物酶切和RNaseA消化第36-38页
        2.7.5 产物树脂纯化第38页
        2.7.6 甲基化检测第38页
    2.8 统计分析第38页
3 结果与分析第38-55页
    3.1 总RNA质量检测第38-39页
    3.2 RT-PCR扩增结果第39页
        3.2.1 山羊DIO3基因测序结果第39页
    3.3 生物信息学分析第39-44页
        3.3.1 序列分析第39-40页
        3.3.2 系统进化树的构建第40-41页
        3.3.3 山羊DIO3蛋白二级结构的预测第41-42页
        3.3.4 DIO3蛋白3D结构模型预测第42-44页
    3.4 DIO3 mRNA组织特异性表达分析第44-49页
        3.4.1 实时荧光定量PCR引物验证第44页
        3.4.2 标准曲线的建立第44-45页
        3.4.3 荧光定量PCR扩增产物的特异性第45-46页
        3.4.4 山羊DIO3 mRNA的组织特异性表达差异第46页
        3.4.5 山羊DIO3 mRNA表达的发育性变化第46-49页
    3.5 DIO3 mRNA在大脑的定位表达分析第49-51页
    3.6 甲基化定量分析第51-55页
        3.6.1 基因组DNA的检测第51页
        3.6.2 DIO3基因内CpG岛的预测分析第51-52页
        3.6.3 甲基化结果检测第52-55页
4 讨论第55-59页
    4.1 克隆的cDNA序列分析第55-56页
    4.2 DIO3蛋白功能和理化特性分析第56页
    4.3 DIO3 mRNA组织特异性表达分析第56-57页
    4.4 大脑不同区域的定位表达分析第57-58页
    4.5 不同组织基因组DNA甲基化分析第58-59页
5 结论第59-60页
参考文献第60-65页
致谢第65-66页
攻读学位期间发表的学术论文目录第66页

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