基于质谱的高通量糖基化肽段鉴定新方法研究
| 摘要 | 第5-6页 |
| Abstract | 第6页 |
| 1 糖蛋白相关背景 | 第7-25页 |
| 1.1 蛋白后修饰背景 | 第7-11页 |
| 1.1.1 蛋白质组学简介 | 第7-9页 |
| 1.1.2 蛋白质翻译后修饰简介及主要研究方法 | 第9-11页 |
| 1.2 糖生物学背景 | 第11-20页 |
| 1.2.1 糖生物学简介 | 第11-14页 |
| 1.2.2 N糖基化简介 | 第14-17页 |
| 1.2.3 糖生物学主要检测技术 | 第17-20页 |
| 1.3 糖蛋白一交叉领域 | 第20页 |
| 参考文献 | 第20-25页 |
| 2 糖蛋白组学质谱研究方法 | 第25-42页 |
| 2.1 相关背景,糖蛋白的复杂性 | 第25-26页 |
| 2.2 样品富集方法简介 | 第26-27页 |
| 2.3 质谱解析方法 | 第27-37页 |
| 2.3.1 糖基化位点分析 | 第28-29页 |
| 2.3.2 纯糖链分析 | 第29页 |
| 2.3.3 糖肽分析 | 第29-37页 |
| 2.3.3.1 不同能量CID | 第30-33页 |
| 2.3.3.2 ETD及多种技术联用 | 第33-34页 |
| 2.3.3.3 其它特殊设计 | 第34-37页 |
| 2.4 展望 | 第37页 |
| 参考文献 | 第37-42页 |
| 3 软件初步设计 | 第42-62页 |
| 3.1 实验流程及预期效果 | 第42-44页 |
| 3.2 谱图特征分析及应用 | 第44-47页 |
| 3.3 手工解析策略及初步结果 | 第47-56页 |
| 3.4 自动化分析策略及初步结果 | 第56-59页 |
| 3.4.1 诱导数据库质控方法测试 | 第56-57页 |
| 3.4.2 诱导谱图质控方法测试 | 第57-59页 |
| 3.5 总结 | 第59页 |
| 参考文献 | 第59-62页 |
| 4 验证实验设计 | 第62-77页 |
| 4.1 验证技术筛选 | 第62-65页 |
| 4.2 指定离子参数测试 | 第65-68页 |
| 4.3 HCD谱图分析 | 第68-71页 |
| 4.4 CID/HCD谱图特征大规模对比 | 第71-74页 |
| 4.5 总结 | 第74页 |
| 参考文献 | 第74-77页 |
| 5 软件优化与结果 | 第77-87页 |
| 5.1 统一打分模型 | 第77-79页 |
| 5.2 血清糖肽最终分析结果及比较 | 第79-83页 |
| 5.3 血清糖肽结构分析 | 第83-84页 |
| 5.4 基于糖肽鉴定的心得体会 | 第84-85页 |
| 参考文献 | 第85-87页 |
| 6 附录 | 第87-100页 |
| 6.1 糖链符号对应组成列表 | 第87-89页 |
| 6.2 高质量糖肽谱图举例 | 第89-93页 |
| 6.3 Ig系列蛋白的糖基化数据 | 第93-94页 |
| 6.4 CID/HCD成对糖肽谱图举例 | 第94-96页 |
| 6.5 实验方法 | 第96-100页 |
| 论文发表情况 | 第100-102页 |
| 致谢 | 第102-103页 |
