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出芽短梗霉转录组学分析及普鲁兰糖合成相关基因功能研究

摘要第11-12页
Abstract第12-13页
第一章 绪论第14-22页
    1.1 出芽短梗霉介绍第14页
    1.2 普鲁兰糖概述第14-15页
        1.2.1 普鲁兰糖的基本结构第14-15页
        1.2.2 普鲁兰糖的性质第15页
    1.3 普鲁兰糖的生物合成途径第15-16页
    1.4 产普鲁兰糖条件优化第16-17页
    1.5 普鲁兰糖在医学上的应用第17-19页
        1.5.1 生物医学和制药工程第17-18页
        1.5.2 血浆扩张器第18页
        1.5.3 药物用途第18-19页
    1.6 分子水平上的研究第19-20页
    1.7 研究策略和内容第20-22页
        1.7.1 前期研究进展第20页
        1.7.2 本研究目的和内容第20-22页
第二章 出芽短梗霉转录组学分析第22-35页
    2.1 引言第22页
    2.2 材料第22-23页
        2.2.1 菌株与试剂第22页
        2.2.2 仪器与设备第22-23页
    2.3 方法第23-25页
        2.3.1 样品制备第23页
        2.3.2 生物信息分析流程第23页
        2.3.3 序列拼接组装第23页
        2.3.4 基因功能注释第23-24页
        2.3.5 样本间基因表达水平相关性第24页
        2.3.6 差异表达基因功能注释第24页
        2.3.7 普鲁兰糖合成相关基因筛选第24-25页
    2.4 结果与分析第25-34页
        2.4.1 Unigenes文库的构建第25页
        2.4.2 测序数据质量评估第25-27页
        2.4.3 基因功能注释第27-29页
        2.4.4 样本间基因表达水平相关性分析第29-30页
        2.4.5 差异表达基因功能注释分析第30-33页
        2.4.6 普鲁兰糖合成相关基因筛选结果第33-34页
    2.5 结论与讨论第34-35页
第三章 普鲁兰糖合成相关基因在不同条件下的RT-qPCR结果分析第35-48页
    3.1 引言第35页
    3.2 材料第35页
        3.2.1 菌株与试剂第35页
        3.2.2 仪器与设备第35页
    3.3 方法第35-39页
        3.3.1 出芽短梗霉的培养与收集第35-36页
        3.3.2 多糖含量的测定第36页
        3.3.3 总RNA提取及cDNA第一条链合成第36-38页
        3.3.4 基因筛选及引物设计第38页
        3.3.5 普鲁兰糖合成相关基因的RT-qPCR验证第38-39页
    3.4 结果与分析第39-47页
        3.4.1 多糖产量分析第39页
        3.4.2 普鲁兰糖合成相关基因的RT-qPCR结果分析第39-45页
        3.4.3 普鲁兰糖合成相关基因的生物信息学分析第45-47页
    3.5 结论与讨论第47-48页
第四章 P1蛋白诱导纯化及P1基因敲除体系构建第48-66页
    4.1 引言第48-49页
    4.2 材料第49-50页
        4.2.1 菌株与试剂第49-50页
        4.2.2 仪器与设备第50页
    4.3 方法第50-58页
        4.3.1 菌株的培养与收集第50页
        4.3.2 总RNA提取及cDNA第一条链合成第50页
        4.3.3 P1基因RT-qPCR验证第50页
        4.3.4 P1基因的克隆及测序第50-52页
        4.3.5 P1表达载体的构建第52-54页
        4.3.6 蛋白诱导及纯化第54-55页
        4.3.7 出芽短梗霉对潮霉素最低浓度抑制第55-56页
        4.3.8 P1基因敲除载体的构建第56-57页
        4.3.9 农杆菌侵染出芽短梗霉第57-58页
    4.4 结果与分析第58-64页
        4.4.1 P1基因的RT-qPCR验证第58-59页
        4.4.2 P1基因克隆结果第59-61页
        4.4.3 表达载体的构建第61-62页
        4.4.4 蛋白表达及纯化分析第62-63页
        4.4.5 出芽短梗霉对潮霉素最低浓度抑制第63页
        4.4.6 敲除载体的构建第63-64页
        4.4.7 农杆菌侵染出芽短梗霉第64页
    4.5 结论与讨论第64-66页
第五章 结论与展望第66-68页
    5.1 结论第66-67页
        5.1.1 出芽短梗霉普鲁兰糖合成相关基因的表达分析第66页
        5.1.2 P1蛋白诱导纯化及敲除体系构建第66-67页
    5.2 展望第67-68页
参考文献第68-73页
附录第73-74页
致谢第74-75页
攻读硕士学位期间发表文章第75页

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