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番茄HD-Zip转录因子家族生物信息学分析及HD-ZipⅠ亚族抗逆相关基因鉴定分析

摘要第8-9页
英文摘要第9-10页
1 引言第11-17页
    1.1 研究目的与意义第11页
    1.2 植物HD-Zip转录因子的研究进展第11-15页
        1.2.1HD-Zip转录因子的结构特征及分类第12-13页
        1.2.2HD-Zip转录因子的生物学功能第13-15页
    1.3 生物信息学及其应用第15页
    1.4 基因沉默VIGS技术及其应用第15-16页
    1.5 技术路线第16-17页
2 材料和方法第17-28页
    2.1 番茄HD-Zip基因家族的生物信息学分析第17-18页
        2.1.1 实验方法第17-18页
    2.2 番茄HD-Zip Ⅰ 基因组织特异性及非生物胁迫表达模式分析第18-21页
        2.2.1 实验材料第18-19页
        2.2.2 实验方法第19-21页
    2.3 番茄Sl HZ11和Sl HZ15基因沉默载体的构建第21-25页
        2.3.1 实验材料第21页
        2.3.2 实验方法第21-25页
    2.4 番茄植株侵染第25-26页
        2.4.1 植物材料准备第25页
        2.4.2 侵染过程第25-26页
    2.5 基因沉默植株沉默效果检测第26页
        2.5.1 沉默植株表型观察第26页
        2.5.2 基因表达量分析第26页
    2.6 基因沉默植株逆境胁迫处理及样品采集第26页
    2.7 相关生理指标测定第26-28页
        2.7.1 丙二醛第26页
        2.7.2 脯氨酸第26-27页
        2.7.3 过氧化物酶第27-28页
3 结果与分析第28-53页
    3.1 番茄HD-Zip基因家族的生物信息学分析第28-37页
        3.1.1 番茄HD-Zip基因家族的挖掘及鉴定第28-30页
        3.1.2 番茄HD-Zip基因家族的进化分析第30-31页
        3.1.3 番茄HD-Zip基因家族保守结构域分析第31-33页
        3.1.4 番茄HD-Zip基因家族内含子、外显子及基因保守序列分析第33页
        3.1.5 番茄HD-Zip基因家族染色体定位分析第33-35页
        3.1.6 番茄HD-Zip基因家族二级结构和三级结构预测分析第35-37页
    3.2 番茄HD-Zip Ⅰ 基因组织特异性及非生物胁迫表达模式分析第37-44页
        3.2.1 番茄HD-Zip Ⅰ 基因家族启动子分析第37-38页
        3.2.2 RNA的提取第38-39页
        3.2.3 番茄HD-Zip I组织特异性分析第39-40页
        3.2.4 番茄HD-Zip Ⅰ 基因非生物胁迫表达模式分析第40-44页
    3.3 番茄SlHZ11和SlHZ15基因沉默载体的构建第44-47页
        3.3.1 SlHZ11和SlHZ15基因的扩增第44页
        3.3.2 pTRV2载体的制备第44-45页
        3.3.3 重组质粒的制备及筛选第45页
        3.3.4 重组质粒的测序及比对第45-47页
    3.4 农杆菌侵染第47-53页
        3.4.1 番茄幼苗沉默效果第47-48页
        3.4.2 不同组织沉默效果第48-49页
        3.4.3 不同逆境处理条件下Sl HZ11和Sl HZ15沉默植株生理指标的分析第49-53页
4 讨论第53-55页
    4.1 番茄HD-Zip基因家族的生物信息学分析第53页
    4.2 番茄组织特异性及非生物胁迫表达模式分析第53-54页
        4.2.1 番茄组织特异性分析第53-54页
        4.2.2 番茄HD-Zip Ⅰ 非生物胁迫表达模式分析第54页
    4.3 SlHZ11和Sl HZ15基因的功能分析第54-55页
5 结论第55-56页
致谢第56-57页
参考文献第57-63页
攻读硕士学位期间发表的学术论文第63页

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